233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2236 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2236  hypothetical protein  100 
 
 		 273 aa  553  1e-157  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4566  UspA domain protein  30.96 
 
 		 279 aa  125  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.564371  normal  0.196949 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4433  UspA domain protein  30.96 
 
 		 279 aa  125  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1854  hypothetical protein  34.64 
 
 		 278 aa  124  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.796292  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0185  hypothetical protein  30.74 
 
 		 279 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.123321 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4709  hypothetical protein  31.56 
 
 		 278 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5815  UspA domain-containing protein  36.9 
 
 		 279 aa  120  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.123141 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6312  UspA domain protein  33.81 
 
 		 281 aa  120  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5897  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 		 279 aa  115  6e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.793802  normal  0.290079 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1142  hypothetical protein  35.5 
 
 		 279 aa  113  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0348  hypothetical protein  34.72 
 
 		 274 aa  113  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00425417 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0017  hypothetical protein  33.1 
 
 		 280 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0334555  normal  0.756521 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4285  UspA domain-containing protein  32.74 
 
 		 279 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.870275  normal  0.299211 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5581  UspA domain protein  30.11 
 
 		 276 aa  109  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.351015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3817  UspA domain-containing protein  32.03 
 
 		 279 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16777  normal  0.520429 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0708  hypothetical protein  30.07 
 
 		 279 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.560113  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2431  universal stress protein family protein  30.07 
 
 		 279 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0754  universal stress family protein  30.07 
 
 		 279 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.576046  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1233  universal stress family protein  30.07 
 
 		 279 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.705496  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1159  universal stress family protein  30.07 
 
 		 279 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1719  universal stress family protein  30.07 
 
 		 279 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4282  UspA domain-containing protein  36.82 
 
 		 277 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.132109 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1133  UspA domain-containing protein  29.08 
 
 		 279 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6199  UspA domain-containing protein  35.82 
 
 		 277 aa  106  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320687  normal  0.442079 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0578  UspA domain-containing protein  32.74 
 
 		 279 aa  106  3e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.1138  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0446  hypothetical protein  33.49 
 
 		 274 aa  106  5e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.179985  normal  0.962231 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2353  UspA domain-containing protein  35.2 
 
 		 276 aa  106  5e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366598  normal  0.604347 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1566  universal stress protein family protein  36.13 
 
 		 279 aa  105  6e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.57632  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1135  UspA domain-containing protein  36.61 
 
 		 277 aa  105  6e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1852  hypothetical protein  35.56 
 
 		 275 aa  105  8e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3814  UspA domain-containing protein  35.82 
 
 		 277 aa  105  8e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.360617  normal  0.615146 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0381  UspA domain protein  37.21 
 
 		 274 aa  102  5e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0466978  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5814  UspA domain-containing protein  38.92 
 
 		 278 aa  101  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.128092 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1168  hypothetical protein  32.87 
 
 		 279 aa  98.2  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5579  UspA domain protein  32.4 
 
 		 278 aa  98.2  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.961326 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2305  UspA domain-containing protein  34.95 
 
 		 308 aa  97.1  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0952  universal stress protein UspA  33.64 
 
 		 264 aa  95.5  9e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.511261  normal  0.862568 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1452  UspA domain protein  32.54 
 
 		 282 aa  94.4  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4724  UspA domain protein  37.5 
 
 		 277 aa  94.7  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3114  hypothetical protein  32.86 
 
 		 265 aa  94.4  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.936734  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1339  hypothetical protein  32 
 
 		 280 aa  94  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.305203  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1926  hypothetical protein  35.76 
 
 		 277 aa  93.2  4e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.295242  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0706  hypothetical protein  35 
 
 		 278 aa  92  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.566487  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2429  universal stress protein family protein  35 
 
 		 278 aa  92  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1231  universal stress family protein  35 
 
 		 279 aa  92  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.709922  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1157  universal stress family protein  35 
 
 		 279 aa  92  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1568  universal stress protein family protein  34.64 
 
 		 278 aa  90.1  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.801358  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0687  UspA domain protein  29.35 
 
 		 267 aa  89.7  4e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.354242  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8718  UspA domain protein  35.11 
 
 		 280 aa  89.4  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2788  UspA domain protein  36.91 
 
 		 271 aa  89.4  6e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.084902  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1416  UspA domain protein  28.03 
 
 		 280 aa  87.8  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.700604  normal  0.217237 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4050  hypothetical protein  31.94 
 
 		 277 aa  87.8  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.946948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1345  hypothetical protein  35.33 
 
 		 277 aa  87.8  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5900  UspA domain-containing protein  38.76 
 
 		 278 aa  86.3  5e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.556152  normal  0.106065 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4518  universal stress protein UspA family  32.12 
 
 		 282 aa  84.7  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0105068  decreased coverage  0.00495689 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4817  UspA domain protein  32.42 
 
 		 271 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0097  UspA domain protein  32.42 
 
 		 271 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3504  UspA domain-containing protein  36.07 
 
 		 286 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0778665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3584  hypothetical protein  25.8 
 
 		 278 aa  83.2  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1592  UspA domain protein  26.36 
 
 		 280 aa  82.8  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.757336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1366  hypothetical protein  33.15 
 
 		 277 aa  82.8  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6175  UspA domain protein  33.51 
 
 		 280 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2248  hypothetical protein  32.78 
 
 		 277 aa  80.9  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3435  putative UspA stress protein  28.82 
 
 		 278 aa  80.9  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.34254  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0409  UspA domain-containing protein  36.61 
 
 		 286 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2220  UspA domain-containing protein  28.97 
 
 		 277 aa  77.8  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3811  UspA domain protein  36.07 
 
 		 286 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.860312 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2605  hypothetical protein  32.02 
 
 		 279 aa  77.4  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.490664  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1047  hypothetical protein  29.29 
 
 		 281 aa  77  0.0000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2612  hypothetical protein  31.98 
 
 		 291 aa  77  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.12045  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1012  hypothetical protein  29.29 
 
 		 281 aa  77  0.0000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0430  UspA domain-containing protein  30.43 
 
 		 269 aa  76.3  0.0000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2134  UspA domain-containing protein  34.5 
 
 		 281 aa  76.3  0.0000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2599  UspA domain-containing protein  34.97 
 
 		 286 aa  75.9  0.0000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1733  UspA domain protein  35.62 
 
 		 276 aa  75.5  0.0000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.328326 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7779  putative UspA  31.25 
 
 		 242 aa  75.5  0.0000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0208146  normal  0.10666 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3807  UspA domain protein  29.25 
 
 		 270 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1948  hypothetical protein  30.9 
 
 		 279 aa  75.1  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2617  UspA domain-containing protein  31.66 
 
 		 271 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5229  UspA domain protein  31 
 
 		 271 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.000806741  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1605  UspA domain-containing protein  36.42 
 
 		 280 aa  73.2  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.591971  normal  0.475521 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3500  UspA domain-containing protein  28.97 
 
 		 270 aa  73.2  0.000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4520  Universal stress protein UspA family UspA14  37.5 
 
 		 274 aa  73.2  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0108751  decreased coverage  0.00456228 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0427  UspA domain-containing protein  32.61 
 
 		 271 aa  73.2  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3893  UspA domain protein  33.69 
 
 		 311 aa  72.8  0.000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.531117  normal  0.217481 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3883  UspA domain protein  29.18 
 
 		 270 aa  72.8  0.000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.29253  normal  0.0935727 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3567  hypothetical protein  29.86 
 
 		 284 aa  72.4  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.920255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1935  hypothetical protein  34.44 
 
 		 272 aa  71.6  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.774934  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6103  UspA domain-containing protein  37.19 
 
 		 271 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0269268 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2546  hypothetical protein  30.53 
 
 		 279 aa  71.2  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.109309  normal  0.809091 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4937  UspA domain-containing protein  28.12 
 
 		 279 aa  70.5  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.144949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3885  UspA domain protein  29.82 
 
 		 271 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0886728  normal  0.0599221 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2231  hypothetical protein  32.04 
 
 		 278 aa  69.7  0.00000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1314  UspA domain-containing protein  31.07 
 
 		 292 aa  69.7  0.00000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.624966  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2238  hypothetical protein  28.69 
 
 		 280 aa  69.3  0.00000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.289135  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0939  UspA domain-containing protein  34.44 
 
 		 287 aa  69.3  0.00000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.799371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2619  UspA domain-containing protein  26.91 
 
 		 286 aa  68.9  0.00000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.794322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1024  universal stress protein UspA  32.58 
 
 		 279 aa  68.6  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0440  UspA domain-containing protein  28.77 
 
 		 272 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.713184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1732  hypothetical protein  32.58 
 
 		 284 aa  68.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0582534  normal  0.0358146 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>