196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8718 on replicon NC_011892
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011892  Mnod_8718  UspA domain protein  100 
 
 		 280 aa  547  1e-155  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6175  UspA domain protein  93.57 
 
 		 280 aa  514  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3571  UspA domain-containing protein  68.93 
 
 		 279 aa  330  2e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.620295  normal  0.215578 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1605  UspA domain-containing protein  61.43 
 
 		 280 aa  289  4e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.591971  normal  0.475521 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3179  UspA domain-containing protein  51.79 
 
 		 279 aa  254  9e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.983564  normal  0.0746884 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3504  UspA domain-containing protein  51.25 
 
 		 286 aa  239  4e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0778665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2599  UspA domain-containing protein  51.25 
 
 		 286 aa  232  6e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3811  UspA domain protein  51.25 
 
 		 286 aa  228  6e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.860312 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0409  UspA domain-containing protein  50.18 
 
 		 286 aa  228  8e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3815  UspA domain protein  46.4 
 
 		 286 aa  219  3e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.763121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3508  UspA domain-containing protein  46.04 
 
 		 286 aa  218  7e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.364633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0398  UspA domain-containing protein  45.68 
 
 		 286 aa  216  2e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.21079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3893  UspA domain protein  47.84 
 
 		 311 aa  210  2e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.531117  normal  0.217481 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3888  UspA domain protein  47.66 
 
 		 264 aa  177  2e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0925098 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2238  hypothetical protein  39.86 
 
 		 280 aa  171  1e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.289135  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2353  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 276 aa  137  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366598  normal  0.604347 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0952  universal stress protein UspA  43.62 
 
 		 264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.511261  normal  0.862568 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6312  UspA domain protein  48.99 
 
 		 281 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1926  hypothetical protein  33.7 
 
 		 277 aa  125  1e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.295242  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3435  putative UspA stress protein  32.16 
 
 		 278 aa  123  4e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.34254  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2248  hypothetical protein  35.48 
 
 		 277 aa  122  7e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1948  hypothetical protein  31.83 
 
 		 279 aa  121  9.999999999999999e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0400  hypothetical protein  35.53 
 
 		 281 aa  120  1.9999999999999998e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1854  hypothetical protein  46.31 
 
 		 278 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.796292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0348  hypothetical protein  35.17 
 
 		 274 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00425417 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1143  hypothetical protein  40.32 
 
 		 276 aa  116  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3114  hypothetical protein  37.29 
 
 		 265 aa  116  3.9999999999999997e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.936734  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3814  UspA domain-containing protein  40 
 
 		 277 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.360617  normal  0.615146 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4282  UspA domain-containing protein  40.47 
 
 		 277 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.132109 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5815  UspA domain-containing protein  35.83 
 
 		 279 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.123141 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6199  UspA domain-containing protein  38.97 
 
 		 277 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320687  normal  0.442079 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0381  UspA domain protein  39.13 
 
 		 274 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0466978  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1733  UspA domain protein  46.43 
 
 		 276 aa  113  4.0000000000000004e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.328326 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7779  putative UspA  40.91 
 
 		 242 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0208146  normal  0.10666 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0446  hypothetical protein  38.55 
 
 		 274 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.179985  normal  0.962231 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5579  UspA domain protein  40.22 
 
 		 278 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.961326 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2231  hypothetical protein  29.18 
 
 		 278 aa  109  5e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1133  UspA domain-containing protein  38.59 
 
 		 279 aa  109  6e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4724  UspA domain protein  35.98 
 
 		 277 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1566  universal stress protein family protein  42 
 
 		 279 aa  107  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.57632  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3567  hypothetical protein  32.4 
 
 		 284 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.920255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1142  hypothetical protein  41.53 
 
 		 279 aa  106  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0427  UspA domain-containing protein  40.78 
 
 		 271 aa  106  5e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0708  hypothetical protein  31.71 
 
 		 279 aa  105  8e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.560113  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2431  universal stress protein family protein  31.71 
 
 		 279 aa  105  8e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0754  universal stress family protein  31.71 
 
 		 279 aa  105  8e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.576046  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1233  universal stress family protein  31.71 
 
 		 279 aa  105  8e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.705496  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1159  universal stress family protein  31.71 
 
 		 279 aa  105  8e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1719  universal stress family protein  31.71 
 
 		 279 aa  105  8e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4050  hypothetical protein  32.95 
 
 		 277 aa  105  9e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.946948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3584  hypothetical protein  38.51 
 
 		 278 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3817  UspA domain-containing protein  36.09 
 
 		 279 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16777  normal  0.520429 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0097  UspA domain protein  42.66 
 
 		 271 aa  104  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0687  UspA domain protein  38.46 
 
 		 267 aa  104  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.354242  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4817  UspA domain protein  42.66 
 
 		 271 aa  104  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5897  UspA domain-containing protein  42 
 
 		 279 aa  104  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.793802  normal  0.290079 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1452  UspA domain protein  38.46 
 
 		 282 aa  102  5e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2617  UspA domain-containing protein  35.56 
 
 		 271 aa  102  7e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4433  UspA domain protein  41.71 
 
 		 279 aa  102  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4566  UspA domain protein  41.71 
 
 		 279 aa  102  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.564371  normal  0.196949 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4285  UspA domain-containing protein  35.22 
 
 		 279 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.870275  normal  0.299211 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1024  universal stress protein UspA  35.63 
 
 		 279 aa  100  3e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2454  UspA domain-containing protein  35.8 
 
 		 291 aa  100  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.821699  normal  0.675849 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1345  hypothetical protein  35.19 
 
 		 277 aa  99.8  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2612  hypothetical protein  40.91 
 
 		 291 aa  99.4  6e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.12045  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6131  UspA domain-containing protein  39.44 
 
 		 271 aa  99.4  6e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5581  UspA domain protein  34.95 
 
 		 276 aa  99.4  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.351015  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1047  hypothetical protein  38.41 
 
 		 281 aa  99  7e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1732  hypothetical protein  31.96 
 
 		 284 aa  99  7e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0582534  normal  0.0358146 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2605  hypothetical protein  34.83 
 
 		 279 aa  99  7e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.490664  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1012  hypothetical protein  38.41 
 
 		 281 aa  99  7e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4518  universal stress protein UspA family  40.13 
 
 		 282 aa  98.6  9e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0105068  decreased coverage  0.00495689 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1555  UspA domain protein  44.83 
 
 		 270 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1135  UspA domain-containing protein  41.51 
 
 		 277 aa  98.6  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1339  hypothetical protein  36.21 
 
 		 280 aa  98.6  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.305203  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0489  UspA domain-containing protein  36.65 
 
 		 272 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.382692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4744  hypothetical protein  39.05 
 
 		 276 aa  97.8  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0430  UspA domain-containing protein  42.76 
 
 		 269 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6135  UspA domain protein  41.38 
 
 		 270 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2220  UspA domain-containing protein  32.49 
 
 		 277 aa  97.1  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1035  universal stress protein UspA  35.39 
 
 		 274 aa  96.7  4e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1355  UspA domain-containing protein  44.83 
 
 		 313 aa  96.3  4e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.574813 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4520  Universal stress protein UspA family UspA14  43.54 
 
 		 274 aa  96.3  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0108751  decreased coverage  0.00456228 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1366  hypothetical protein  31.54 
 
 		 277 aa  95.9  7e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0266  UspA domain-containing protein  31.15 
 
 		 260 aa  95.5  8e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.194417  normal  0.123671 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4709  hypothetical protein  42.38 
 
 		 278 aa  94.4  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3035  UspA domain-containing protein  30.08 
 
 		 278 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.415696  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1983  UspA domain protein  34.48 
 
 		 273 aa  94.7  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0316321  normal  0.0164528 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0440  UspA domain-containing protein  38.62 
 
 		 272 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.713184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3807  UspA domain protein  38.62 
 
 		 270 aa  94  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2567  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 270 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.0044371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3500  UspA domain-containing protein  38.62 
 
 		 270 aa  93.2  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1568  universal stress protein family protein  33.9 
 
 		 278 aa  93.2  5e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.801358  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1852  hypothetical protein  36 
 
 		 275 aa  92.8  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2982  UspA domain-containing protein  43.36 
 
 		 279 aa  92.8  5e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0185  hypothetical protein  40 
 
 		 279 aa  92.8  6e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.123321 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0395  UspA domain-containing protein  41.55 
 
 		 270 aa  92.4  7e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.275124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2134  UspA domain-containing protein  34.15 
 
 		 281 aa  92.4  7e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4937  UspA domain-containing protein  32.14 
 
 		 279 aa  92.4  7e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.144949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0939  UspA domain-containing protein  35.23 
 
 		 287 aa  92  9e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.799371  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>