193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3035 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_3035  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 278 aa  565  1e-160  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.415696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2248  hypothetical protein  40.58 
 
 		 277 aa  211  7.999999999999999e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1948  hypothetical protein  32.85 
 
 		 279 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1983  UspA domain protein  32.97 
 
 		 273 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0316321  normal  0.0164528 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3435  putative UspA stress protein  32.51 
 
 		 278 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.34254  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1366  hypothetical protein  37.44 
 
 		 277 aa  119  7e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4210  UspA domain-containing protein  32.23 
 
 		 280 aa  118  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1345  hypothetical protein  36.07 
 
 		 277 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0400  hypothetical protein  45.64 
 
 		 281 aa  113  4.0000000000000004e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2353  UspA domain-containing protein  36.1 
 
 		 276 aa  112  7.000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366598  normal  0.604347 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1024  universal stress protein UspA  36.21 
 
 		 279 aa  109  5e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2454  UspA domain-containing protein  29.18 
 
 		 291 aa  109  5e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.821699  normal  0.675849 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4724  UspA domain protein  30.82 
 
 		 277 aa  106  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0348  hypothetical protein  30.57 
 
 		 274 aa  105  7e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00425417 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0952  universal stress protein UspA  33.91 
 
 		 264 aa  104  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.511261  normal  0.862568 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5579  UspA domain protein  37.91 
 
 		 278 aa  101  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.961326 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4050  hypothetical protein  33 
 
 		 277 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.946948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0446  hypothetical protein  30.3 
 
 		 274 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.179985  normal  0.962231 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1339  hypothetical protein  32.1 
 
 		 280 aa  100  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.305203  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3114  hypothetical protein  32 
 
 		 265 aa  99.4  6e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.936734  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1926  hypothetical protein  33.9 
 
 		 277 aa  99  7e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.295242  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6312  UspA domain protein  38.26 
 
 		 281 aa  97.4  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1143  hypothetical protein  36.65 
 
 		 276 aa  97.1  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2788  UspA domain protein  39.46 
 
 		 271 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.084902  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0939  UspA domain-containing protein  28.91 
 
 		 287 aa  95.5  9e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.799371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1854  hypothetical protein  36.24 
 
 		 278 aa  93.6  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.796292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1852  hypothetical protein  35.71 
 
 		 275 aa  93.2  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5815  UspA domain-containing protein  36.31 
 
 		 279 aa  92  9e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.123141 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0381  UspA domain protein  31.58 
 
 		 274 aa  92  9e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0466978  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0708  hypothetical protein  34.64 
 
 		 279 aa  92  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.560113  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2431  universal stress protein family protein  34.64 
 
 		 279 aa  92  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0754  universal stress family protein  34.64 
 
 		 279 aa  92  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.576046  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1233  universal stress family protein  34.64 
 
 		 279 aa  92  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.705496  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1159  universal stress family protein  34.64 
 
 		 279 aa  92  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1719  universal stress family protein  34.64 
 
 		 279 aa  92  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7779  putative UspA  29.38 
 
 		 242 aa  91.3  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0208146  normal  0.10666 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1133  UspA domain-containing protein  35.26 
 
 		 279 aa  91.7  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6175  UspA domain protein  34.83 
 
 		 280 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1566  universal stress protein family protein  34.08 
 
 		 279 aa  90.9  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.57632  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8718  UspA domain protein  34.83 
 
 		 280 aa  89.7  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3504  UspA domain-containing protein  36.11 
 
 		 286 aa  89  7e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0778665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4215  UspA domain-containing protein  26.32 
 
 		 281 aa  88.2  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.322139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1135  UspA domain-containing protein  28.97 
 
 		 277 aa  86.7  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4566  UspA domain protein  34.16 
 
 		 279 aa  86.3  5e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.564371  normal  0.196949 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4433  UspA domain protein  34.16 
 
 		 279 aa  86.3  5e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5897  UspA domain-containing protein  31.39 
 
 		 279 aa  86.3  5e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.793802  normal  0.290079 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1168  hypothetical protein  28.29 
 
 		 279 aa  85.9  7e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3814  UspA domain-containing protein  35.29 
 
 		 277 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.360617  normal  0.615146 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3817  UspA domain-containing protein  33.97 
 
 		 279 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16777  normal  0.520429 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0409  UspA domain-containing protein  29.12 
 
 		 286 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3811  UspA domain protein  35.56 
 
 		 286 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.860312 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2238  hypothetical protein  33.92 
 
 		 280 aa  84  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.289135  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4285  UspA domain-containing protein  33.97 
 
 		 279 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.870275  normal  0.299211 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2292  UspA domain-containing protein  32.63 
 
 		 287 aa  83.2  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0820685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3179  UspA domain-containing protein  32.89 
 
 		 279 aa  83.6  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.983564  normal  0.0746884 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1605  UspA domain-containing protein  33.78 
 
 		 280 aa  82.8  0.000000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.591971  normal  0.475521 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1046  UspA domain protein  36.05 
 
 		 279 aa  82.8  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.308422  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0185  hypothetical protein  35.37 
 
 		 279 aa  82.4  0.000000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.123321 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4282  UspA domain-containing protein  32.84 
 
 		 277 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.132109 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4520  Universal stress protein UspA family UspA14  36.48 
 
 		 274 aa  81.6  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0108751  decreased coverage  0.00456228 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6199  UspA domain-containing protein  33.66 
 
 		 277 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320687  normal  0.442079 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1664  UspA domain-containing protein  35.62 
 
 		 279 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.483104  normal  0.685181 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0578  UspA domain-containing protein  32.57 
 
 		 279 aa  80.5  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.1138  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0429  UspA domain-containing protein  25.53 
 
 		 295 aa  80.1  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.760524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4744  hypothetical protein  34.92 
 
 		 276 aa  79.7  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5581  UspA domain protein  34.46 
 
 		 276 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.351015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3584  hypothetical protein  31.54 
 
 		 278 aa  79.3  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1568  universal stress protein family protein  29.5 
 
 		 278 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.801358  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2305  UspA domain-containing protein  32.89 
 
 		 308 aa  79  0.00000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1231  universal stress family protein  34.66 
 
 		 279 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.709922  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1157  universal stress family protein  34.66 
 
 		 279 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0706  hypothetical protein  34.66 
 
 		 278 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.566487  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2429  universal stress protein family protein  34.66 
 
 		 278 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3567  hypothetical protein  27.24 
 
 		 284 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.920255  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1047  hypothetical protein  31.93 
 
 		 281 aa  78.2  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0533  UspA domain-containing protein  28.91 
 
 		 282 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.298494 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1314  UspA domain-containing protein  26.26 
 
 		 292 aa  77.4  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.624966  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1012  hypothetical protein  31.93 
 
 		 281 aa  78.2  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2134  UspA domain-containing protein  29.7 
 
 		 281 aa  77.4  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6103  UspA domain-containing protein  36.57 
 
 		 271 aa  76.6  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0269268 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2612  hypothetical protein  29.39 
 
 		 291 aa  74.7  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.12045  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0079  UspA domain-containing protein  25.94 
 
 		 285 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.288519  normal  0.367855 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1849  UspA domain-containing protein  31.82 
 
 		 277 aa  75.5  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2619  UspA domain-containing protein  29.82 
 
 		 286 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.794322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4709  hypothetical protein  33.13 
 
 		 278 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1035  universal stress protein UspA  33.33 
 
 		 274 aa  74.3  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2101  UspA domain protein  33.11 
 
 		 287 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal  0.400879 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0697  universal stress protein  31.91 
 
 		 282 aa  73.2  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2231  hypothetical protein  29.27 
 
 		 278 aa  73.6  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2352  UspA domain-containing protein  31.91 
 
 		 282 aa  73.2  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.229476  normal  0.139893 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1592  UspA domain protein  24.03 
 
 		 280 aa  73.2  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.757336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3571  UspA domain-containing protein  34.39 
 
 		 279 aa  72.8  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.620295  normal  0.215578 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2220  UspA domain-containing protein  34.46 
 
 		 277 aa  72.8  0.000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1305  UspA domain protein  27.45 
 
 		 287 aa  72.8  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186426  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2599  UspA domain-containing protein  28.32 
 
 		 286 aa  72.8  0.000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1416  UspA domain protein  23.21 
 
 		 280 aa  72.4  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.700604  normal  0.217237 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0097  UspA domain protein  32.35 
 
 		 271 aa  72.4  0.000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4817  UspA domain protein  32.35 
 
 		 271 aa  72.4  0.000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1765  UspA domain-containing protein  32.43 
 
 		 315 aa  72.4  0.000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3018  UspA domain-containing protein  28.74 
 
 		 277 aa  72.4  0.000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>