214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4744 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B4744  hypothetical protein  100 
 
 
276 aa  540  1e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4520  Universal stress protein UspA family UspA14  52.17 
 
 
274 aa  253  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0108751  decreased coverage  0.00456228 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1143  hypothetical protein  43.42 
 
 
276 aa  180  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5579  UspA domain protein  35.66 
 
 
278 aa  132  5e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.961326 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1135  UspA domain-containing protein  36.04 
 
 
277 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0708  hypothetical protein  37.28 
 
 
279 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.560113  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2431  universal stress protein family protein  37.28 
 
 
279 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0754  universal stress family protein  37.28 
 
 
279 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.576046  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1233  universal stress family protein  37.28 
 
 
279 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.705496  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1159  universal stress family protein  37.28 
 
 
279 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1719  universal stress family protein  37.28 
 
 
279 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1566  universal stress protein family protein  36.08 
 
 
279 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.57632  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5815  UspA domain-containing protein  34.39 
 
 
279 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.123141 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1854  hypothetical protein  34.62 
 
 
278 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.796292  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1133  UspA domain-containing protein  34.25 
 
 
279 aa  120  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6199  UspA domain-containing protein  34.16 
 
 
277 aa  119  7e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320687  normal  0.442079 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4282  UspA domain-containing protein  34.16 
 
 
277 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.132109 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6312  UspA domain protein  33.67 
 
 
281 aa  118  9e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4723  UspA domain protein  30.71 
 
 
278 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.973873  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3814  UspA domain-containing protein  34.52 
 
 
277 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.360617  normal  0.615146 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5581  UspA domain protein  33.57 
 
 
276 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.351015  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2790  hypothetical protein  32.86 
 
 
277 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.153836 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0427  UspA domain-containing protein  34.05 
 
 
271 aa  112  5e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4049  hypothetical protein  32.73 
 
 
274 aa  112  6e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.36673  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5897  UspA domain-containing protein  35.29 
 
 
279 aa  112  6e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.793802  normal  0.290079 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1339  hypothetical protein  33.68 
 
 
280 aa  112  9e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.305203  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3817  UspA domain-containing protein  34.69 
 
 
279 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16777  normal  0.520429 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2897  UspA domain-containing protein  35.48 
 
 
270 aa  109  4.0000000000000004e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.185015  decreased coverage  0.00487068 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0446  hypothetical protein  30.34 
 
 
274 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.179985  normal  0.962231 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4285  UspA domain-containing protein  34.92 
 
 
279 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.870275  normal  0.299211 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1568  universal stress protein family protein  32.75 
 
 
278 aa  107  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.801358  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1852  hypothetical protein  32.5 
 
 
275 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1346  hypothetical protein  31.11 
 
 
274 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.658073  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2617  UspA domain-containing protein  33.45 
 
 
271 aa  107  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213655  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1142  hypothetical protein  34.34 
 
 
279 aa  105  6e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3434  hypothetical protein  28.92 
 
 
275 aa  105  8e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.406558 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1935  hypothetical protein  29.21 
 
 
272 aa  105  9e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.774934  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0348  hypothetical protein  31.01 
 
 
274 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00425417 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1345  hypothetical protein  32.96 
 
 
277 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4518  universal stress protein UspA family  31.94 
 
 
282 aa  104  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0105068  decreased coverage  0.00495689 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2788  UspA domain protein  46.62 
 
 
271 aa  103  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.084902  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1367  hypothetical protein  30.32 
 
 
276 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0440  UspA domain-containing protein  32.01 
 
 
272 aa  103  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.713184  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0706  hypothetical protein  34.4 
 
 
278 aa  102  5e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.566487  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2429  universal stress protein family protein  34.4 
 
 
278 aa  102  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0578  UspA domain-containing protein  37.5 
 
 
279 aa  103  5e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.1138  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1231  universal stress family protein  34.4 
 
 
279 aa  102  5e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.709922  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1157  universal stress family protein  34.4 
 
 
279 aa  102  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2630  UspA domain-containing protein  34.15 
 
 
272 aa  102  7e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4050  hypothetical protein  32.87 
 
 
277 aa  102  8e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.946948  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2220  UspA domain-containing protein  31.91 
 
 
277 aa  101  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2353  UspA domain-containing protein  33.22 
 
 
276 aa  100  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366598  normal  0.604347 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0489  UspA domain-containing protein  30.25 
 
 
272 aa  100  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.382692  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2612  hypothetical protein  33.9 
 
 
291 aa  100  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.12045  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1366  hypothetical protein  32.1 
 
 
277 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2231  hypothetical protein  38.62 
 
 
278 aa  100  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0430  UspA domain-containing protein  32.14 
 
 
269 aa  99.4  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6103  UspA domain-containing protein  41.62 
 
 
271 aa  99.8  5e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0269268 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6175  UspA domain protein  39.11 
 
 
280 aa  99.4  7e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4724  UspA domain protein  32.47 
 
 
277 aa  98.6  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1024  universal stress protein UspA  37.7 
 
 
279 aa  97.4  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1035  universal stress protein UspA  30 
 
 
274 aa  97.4  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2248  hypothetical protein  37 
 
 
277 aa  95.5  8e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6131  UspA domain-containing protein  32.97 
 
 
271 aa  95.5  8e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267021  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6135  UspA domain protein  32.98 
 
 
270 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1168  hypothetical protein  33.22 
 
 
279 aa  94.7  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8718  UspA domain protein  39.39 
 
 
280 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0395  UspA domain-containing protein  32.29 
 
 
270 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.275124  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0952  universal stress protein UspA  29.75 
 
 
264 aa  94.4  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.511261  normal  0.862568 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1300  UspA domain protein  32.53 
 
 
278 aa  94  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.085168  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1679  hypothetical protein  30.69 
 
 
269 aa  94  3e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0785159  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4937  UspA domain-containing protein  30.95 
 
 
279 aa  94  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.144949  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2567  UspA domain-containing protein  30.96 
 
 
270 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.0044371  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2546  hypothetical protein  36.87 
 
 
279 aa  93.2  4e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.109309  normal  0.809091 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0423  UspA domain protein  30.71 
 
 
271 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.892038  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5814  UspA domain-containing protein  32.98 
 
 
278 aa  92.4  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.128092 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2621  UspA domain-containing protein  34.25 
 
 
268 aa  92.4  7e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.55549  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0381  UspA domain protein  30.81 
 
 
274 aa  92.4  7e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0466978  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4709  hypothetical protein  29.29 
 
 
278 aa  92  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3114  hypothetical protein  36.84 
 
 
265 aa  92  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.936734  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2238  hypothetical protein  30.6 
 
 
280 aa  91.7  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.289135  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1849  UspA domain-containing protein  30 
 
 
277 aa  91.7  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3435  putative UspA stress protein  30.34 
 
 
278 aa  91.7  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.34254  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4817  UspA domain protein  29.29 
 
 
271 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3571  UspA domain-containing protein  42.86 
 
 
279 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.620295  normal  0.215578 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0185  hypothetical protein  27.76 
 
 
279 aa  90.1  4e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.123321 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0697  universal stress protein  36.81 
 
 
282 aa  89.7  4e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1926  hypothetical protein  37.09 
 
 
277 aa  90.1  4e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.295242  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2352  UspA domain-containing protein  36.81 
 
 
282 aa  89.7  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.229476  normal  0.139893 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1913  hypothetical protein  29.67 
 
 
278 aa  88.6  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.082206  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0954  universal stress protein  25.42 
 
 
283 aa  88.6  1e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2305  UspA domain-containing protein  43.14 
 
 
308 aa  88.2  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4210  UspA domain-containing protein  37.91 
 
 
280 aa  88.2  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3584  hypothetical protein  27.82 
 
 
278 aa  87.8  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4566  UspA domain protein  28.11 
 
 
279 aa  87.8  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.564371  normal  0.196949 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4433  UspA domain protein  28.11 
 
 
279 aa  87.8  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0533  UspA domain-containing protein  33.79 
 
 
282 aa  87.4  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.298494 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5900  UspA domain-containing protein  33.45 
 
 
278 aa  87  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.556152  normal  0.106065 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0097  UspA domain protein  28.93 
 
 
271 aa  87  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3018  UspA domain-containing protein  31.01 
 
 
277 aa  87  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>