204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5581 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5581  UspA domain protein  100 
 
 
276 aa  555  1e-157  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.351015  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1852  hypothetical protein  66.67 
 
 
275 aa  355  2.9999999999999997e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1568  universal stress protein family protein  63.31 
 
 
278 aa  348  5e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.801358  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0706  hypothetical protein  64.39 
 
 
278 aa  340  1e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.566487  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2429  universal stress protein family protein  64.39 
 
 
278 aa  340  1e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1231  universal stress family protein  64.39 
 
 
279 aa  340  2e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.709922  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1157  universal stress family protein  64.39 
 
 
279 aa  340  2e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6199  UspA domain-containing protein  59.93 
 
 
277 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320687  normal  0.442079 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3814  UspA domain-containing protein  58.84 
 
 
277 aa  319  3e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.360617  normal  0.615146 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4282  UspA domain-containing protein  58.84 
 
 
277 aa  317  1e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.132109 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5814  UspA domain-containing protein  56.12 
 
 
278 aa  299  4e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.128092 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5900  UspA domain-containing protein  60.07 
 
 
278 aa  298  6e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.556152  normal  0.106065 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1135  UspA domain-containing protein  54.29 
 
 
277 aa  290  2e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0756  universal stress protein  61.39 
 
 
332 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1854  hypothetical protein  42.35 
 
 
278 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.796292  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1133  UspA domain-containing protein  40.21 
 
 
279 aa  196  3e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1142  hypothetical protein  41.28 
 
 
279 aa  191  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6312  UspA domain protein  42.66 
 
 
281 aa  189  4e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0185  hypothetical protein  37.99 
 
 
279 aa  188  8e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.123321 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5579  UspA domain protein  41.49 
 
 
278 aa  185  6e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.961326 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5897  UspA domain-containing protein  41.64 
 
 
279 aa  182  6e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.793802  normal  0.290079 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4285  UspA domain-containing protein  43.11 
 
 
279 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.870275  normal  0.299211 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5815  UspA domain-containing protein  39.01 
 
 
279 aa  179  4e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.123141 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3817  UspA domain-containing protein  42.76 
 
 
279 aa  177  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16777  normal  0.520429 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0708  hypothetical protein  41.49 
 
 
279 aa  176  4e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.560113  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2431  universal stress protein family protein  41.49 
 
 
279 aa  176  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0754  universal stress family protein  41.49 
 
 
279 aa  176  4e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.576046  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1233  universal stress family protein  41.49 
 
 
279 aa  176  4e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.705496  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1159  universal stress family protein  41.49 
 
 
279 aa  176  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1719  universal stress family protein  41.49 
 
 
279 aa  176  4e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4566  UspA domain protein  36.92 
 
 
279 aa  176  4e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.564371  normal  0.196949 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4433  UspA domain protein  36.92 
 
 
279 aa  176  4e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1566  universal stress protein family protein  39.64 
 
 
279 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.57632  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4709  hypothetical protein  36.56 
 
 
278 aa  165  8e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1168  hypothetical protein  40.36 
 
 
279 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4518  universal stress protein UspA family  38.38 
 
 
282 aa  160  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0105068  decreased coverage  0.00495689 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1592  UspA domain protein  36.27 
 
 
280 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.757336  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1416  UspA domain protein  35.56 
 
 
280 aa  146  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.700604  normal  0.217237 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2353  UspA domain-containing protein  35.48 
 
 
276 aa  147  3e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366598  normal  0.604347 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1339  hypothetical protein  36.36 
 
 
280 aa  144  1e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.305203  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0017  hypothetical protein  37.68 
 
 
280 aa  143  3e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0334555  normal  0.756521 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0446  hypothetical protein  36.04 
 
 
274 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.179985  normal  0.962231 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3584  hypothetical protein  32.87 
 
 
278 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0348  hypothetical protein  35.02 
 
 
274 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00425417 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2305  UspA domain-containing protein  35.48 
 
 
308 aa  135  9e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3567  hypothetical protein  33.92 
 
 
284 aa  132  6e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.920255  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4937  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 
279 aa  129  6e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.144949  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1452  UspA domain protein  36.59 
 
 
282 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0578  UspA domain-containing protein  31.1 
 
 
279 aa  128  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.1138  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2605  hypothetical protein  33.77 
 
 
279 aa  126  4.0000000000000003e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.490664  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0381  UspA domain protein  34.05 
 
 
274 aa  122  9e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0466978  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1732  hypothetical protein  31.82 
 
 
284 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0582534  normal  0.0358146 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4050  hypothetical protein  31.43 
 
 
277 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.946948  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1366  hypothetical protein  30.85 
 
 
277 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2790  hypothetical protein  34.88 
 
 
277 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.153836 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2788  UspA domain protein  33.56 
 
 
271 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.084902  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5229  UspA domain protein  34.77 
 
 
271 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.000806741  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0952  universal stress protein UspA  33.93 
 
 
264 aa  115  5e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.511261  normal  0.862568 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1345  hypothetical protein  31.07 
 
 
277 aa  115  6e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4724  UspA domain protein  32.57 
 
 
277 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1948  hypothetical protein  34.98 
 
 
279 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3114  hypothetical protein  33.33 
 
 
265 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.936734  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0440  UspA domain-containing protein  32.86 
 
 
272 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.713184  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1143  hypothetical protein  31.25 
 
 
276 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0687  UspA domain protein  30.5 
 
 
267 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.354242  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2236  hypothetical protein  30.11 
 
 
273 aa  109  5e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2630  UspA domain-containing protein  32.98 
 
 
272 aa  108  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2238  hypothetical protein  37.85 
 
 
280 aa  107  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.289135  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1926  hypothetical protein  37.71 
 
 
277 aa  107  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.295242  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3435  putative UspA stress protein  34.78 
 
 
278 aa  107  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.34254  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4744  hypothetical protein  32.99 
 
 
276 aa  106  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6103  UspA domain-containing protein  42.29 
 
 
271 aa  106  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0269268 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2220  UspA domain-containing protein  31.01 
 
 
277 aa  106  4e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4817  UspA domain protein  30.99 
 
 
271 aa  106  4e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1024  universal stress protein UspA  35.96 
 
 
279 aa  105  7e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3269  UspA domain-containing protein  35.94 
 
 
271 aa  105  7e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.17581  normal  0.400144 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2880  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 
271 aa  105  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0939  UspA domain-containing protein  39.34 
 
 
287 aa  103  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.799371  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1035  universal stress protein UspA  31.34 
 
 
274 aa  103  4e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1605  UspA domain-containing protein  41.18 
 
 
280 aa  102  5e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.591971  normal  0.475521 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2248  hypothetical protein  34.93 
 
 
277 aa  102  5e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0194  UspA domain-containing protein  32.17 
 
 
270 aa  102  6e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6175  UspA domain protein  34.47 
 
 
280 aa  102  6e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2612  hypothetical protein  34.36 
 
 
291 aa  102  7e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.12045  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0097  UspA domain protein  30.63 
 
 
271 aa  102  7e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1346  hypothetical protein  31.5 
 
 
274 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.658073  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8718  UspA domain protein  34.95 
 
 
280 aa  99.4  6e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1300  UspA domain protein  32.52 
 
 
278 aa  99.4  6e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.085168  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1913  hypothetical protein  27.97 
 
 
278 aa  98.2  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.082206  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2231  hypothetical protein  29.23 
 
 
278 aa  98.2  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1305  UspA domain protein  33.33 
 
 
287 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186426  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0489  UspA domain-containing protein  30.53 
 
 
272 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.382692  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6131  UspA domain-containing protein  33.45 
 
 
271 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267021  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3571  UspA domain-containing protein  38.16 
 
 
279 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.620295  normal  0.215578 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4723  UspA domain protein  30.18 
 
 
278 aa  97.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.973873  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2134  UspA domain-containing protein  28.79 
 
 
281 aa  97.1  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3885  UspA domain protein  32.03 
 
 
271 aa  96.7  4e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0886728  normal  0.0599221 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0423  UspA domain protein  30.5 
 
 
271 aa  95.9  6e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.892038  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1047  hypothetical protein  28.42 
 
 
281 aa  95.9  7e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1012  hypothetical protein  28.42 
 
 
281 aa  95.9  7e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>