183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6199 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010557  BamMC406_6199  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 277 aa  557  1e-158  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320687  normal  0.442079 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4282  UspA domain-containing protein  97.83 
 
 		 277 aa  549  1e-155  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.132109 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3814  UspA domain-containing protein  96.39 
 
 		 277 aa  541  1e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.360617  normal  0.615146 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5900  UspA domain-containing protein  89.21 
 
 		 278 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.556152  normal  0.106065 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5814  UspA domain-containing protein  64.39 
 
 		 278 aa  346  3e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.128092 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1568  universal stress protein family protein  61.15 
 
 		 278 aa  328  4e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.801358  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1231  universal stress family protein  61.87 
 
 		 279 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.709922  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1157  universal stress family protein  61.87 
 
 		 279 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0706  hypothetical protein  61.87 
 
 		 278 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.566487  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2429  universal stress protein family protein  61.87 
 
 		 278 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5581  UspA domain protein  59.93 
 
 		 276 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.351015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1135  UspA domain-containing protein  59.5 
 
 		 277 aa  315  7e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1852  hypothetical protein  59.57 
 
 		 275 aa  293  3e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0756  universal stress protein  61.38 
 
 		 332 aa  219  3e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1854  hypothetical protein  44.6 
 
 		 278 aa  207  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.796292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5579  UspA domain protein  41.9 
 
 		 278 aa  192  6e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.961326 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6312  UspA domain protein  41.58 
 
 		 281 aa  189  5e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0708  hypothetical protein  42.18 
 
 		 279 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.560113  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2431  universal stress protein family protein  42.18 
 
 		 279 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0754  universal stress family protein  42.18 
 
 		 279 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.576046  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1233  universal stress family protein  42.18 
 
 		 279 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.705496  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1159  universal stress family protein  42.18 
 
 		 279 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1719  universal stress family protein  42.18 
 
 		 279 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4433  UspA domain protein  40.93 
 
 		 279 aa  187  1e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4566  UspA domain protein  40.93 
 
 		 279 aa  187  1e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.564371  normal  0.196949 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1133  UspA domain-containing protein  39.29 
 
 		 279 aa  185  8e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1566  universal stress protein family protein  40.14 
 
 		 279 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.57632  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4285  UspA domain-containing protein  41.52 
 
 		 279 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.870275  normal  0.299211 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1142  hypothetical protein  40.71 
 
 		 279 aa  182  6e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5815  UspA domain-containing protein  39.64 
 
 		 279 aa  181  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.123141 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0185  hypothetical protein  41.11 
 
 		 279 aa  180  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.123321 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5897  UspA domain-containing protein  40.34 
 
 		 279 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.793802  normal  0.290079 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3817  UspA domain-containing protein  40.14 
 
 		 279 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16777  normal  0.520429 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4709  hypothetical protein  39.1 
 
 		 278 aa  170  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1168  hypothetical protein  40.14 
 
 		 279 aa  161  9e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1592  UspA domain protein  37.67 
 
 		 280 aa  161  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.757336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0017  hypothetical protein  38.27 
 
 		 280 aa  155  8e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0334555  normal  0.756521 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1416  UspA domain protein  36.43 
 
 		 280 aa  153  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.700604  normal  0.217237 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4518  universal stress protein UspA family  38.38 
 
 		 282 aa  151  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0105068  decreased coverage  0.00495689 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1339  hypothetical protein  37.19 
 
 		 280 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.305203  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0348  hypothetical protein  37.81 
 
 		 274 aa  142  4e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00425417 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2605  hypothetical protein  34.86 
 
 		 279 aa  142  4e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.490664  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0446  hypothetical protein  37.23 
 
 		 274 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.179985  normal  0.962231 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2305  UspA domain-containing protein  36.79 
 
 		 308 aa  138  8.999999999999999e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2353  UspA domain-containing protein  35.61 
 
 		 276 aa  135  6.0000000000000005e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366598  normal  0.604347 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0578  UspA domain-containing protein  34.14 
 
 		 279 aa  135  9e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.1138  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5229  UspA domain protein  37.1 
 
 		 271 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.000806741  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0381  UspA domain protein  34.05 
 
 		 274 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0466978  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6175  UspA domain protein  39.63 
 
 		 280 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1143  hypothetical protein  33.68 
 
 		 276 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3584  hypothetical protein  31.51 
 
 		 278 aa  119  6e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3567  hypothetical protein  30.18 
 
 		 284 aa  116  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.920255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3114  hypothetical protein  35.02 
 
 		 265 aa  116  3e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.936734  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4520  Universal stress protein UspA family UspA14  34.38 
 
 		 274 aa  116  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0108751  decreased coverage  0.00456228 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0440  UspA domain-containing protein  34.64 
 
 		 272 aa  117  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.713184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1452  UspA domain protein  34.48 
 
 		 282 aa  116  5e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1035  universal stress protein UspA  33.1 
 
 		 274 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1926  hypothetical protein  33.33 
 
 		 277 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.295242  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2630  UspA domain-containing protein  34.39 
 
 		 272 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8718  UspA domain protein  41.48 
 
 		 280 aa  113  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2788  UspA domain protein  41.52 
 
 		 271 aa  112  6e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.084902  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4744  hypothetical protein  34.16 
 
 		 276 aa  112  9e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3885  UspA domain protein  35 
 
 		 271 aa  112  9e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0886728  normal  0.0599221 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0952  universal stress protein UspA  34.42 
 
 		 264 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.511261  normal  0.862568 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1366  hypothetical protein  32.41 
 
 		 277 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2220  UspA domain-containing protein  34.26 
 
 		 277 aa  110  3e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0687  UspA domain protein  29.33 
 
 		 267 aa  110  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.354242  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1732  hypothetical protein  30.56 
 
 		 284 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0582534  normal  0.0358146 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2236  hypothetical protein  35.82 
 
 		 273 aa  106  3e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3269  UspA domain-containing protein  37.63 
 
 		 271 aa  107  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.17581  normal  0.400144 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0409  UspA domain-containing protein  37.84 
 
 		 286 aa  106  5e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4937  UspA domain-containing protein  31.69 
 
 		 279 aa  105  6e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.144949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2238  hypothetical protein  38.29 
 
 		 280 aa  105  7e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.289135  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2617  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 271 aa  104  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4817  UspA domain protein  32.41 
 
 		 271 aa  105  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4724  UspA domain protein  31.12 
 
 		 277 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2248  hypothetical protein  40.91 
 
 		 277 aa  103  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1345  hypothetical protein  31.12 
 
 		 277 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0194  UspA domain-containing protein  34.15 
 
 		 270 aa  103  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3571  UspA domain-containing protein  40.23 
 
 		 279 aa  103  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.620295  normal  0.215578 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0427  UspA domain-containing protein  32.62 
 
 		 271 aa  103  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1314  UspA domain-containing protein  31.79 
 
 		 292 aa  103  4e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.624966  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0097  UspA domain protein  31.31 
 
 		 271 aa  102  7e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1935  hypothetical protein  31.25 
 
 		 272 aa  102  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.774934  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2134  UspA domain-containing protein  31.49 
 
 		 281 aa  102  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1305  UspA domain protein  33.56 
 
 		 287 aa  100  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186426  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0423  UspA domain protein  33.33 
 
 		 271 aa  100  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.892038  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2790  hypothetical protein  33.33 
 
 		 277 aa  100  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.153836 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2612  hypothetical protein  31.91 
 
 		 291 aa  99.8  5e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.12045  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4050  hypothetical protein  30.07 
 
 		 277 aa  99.4  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.946948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0939  UspA domain-containing protein  36.76 
 
 		 287 aa  99.4  6e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.799371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6135  UspA domain protein  32.97 
 
 		 270 aa  98.6  9e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1047  hypothetical protein  30.48 
 
 		 281 aa  98.2  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2880  UspA domain-containing protein  32.16 
 
 		 271 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3807  UspA domain protein  33.92 
 
 		 270 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1012  hypothetical protein  30.48 
 
 		 281 aa  98.2  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0430  UspA domain-containing protein  33.68 
 
 		 269 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1605  UspA domain-containing protein  36.08 
 
 		 280 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.591971  normal  0.475521 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4049  hypothetical protein  34.38 
 
 		 274 aa  97.8  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.36673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2231  hypothetical protein  34.83 
 
 		 278 aa  97.4  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>