184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2790 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2790  hypothetical protein  100 
 
 		 277 aa  551  1e-156  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.153836 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1913  hypothetical protein  57.4 
 
 		 278 aa  326  3e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.082206  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4049  hypothetical protein  57.4 
 
 		 274 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.36673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1346  hypothetical protein  54.71 
 
 		 274 aa  299  3e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.658073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1367  hypothetical protein  52.71 
 
 		 276 aa  278  8e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4723  UspA domain protein  50.9 
 
 		 278 aa  276  2e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.973873  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4817  UspA domain protein  37.99 
 
 		 271 aa  170  3e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0097  UspA domain protein  37.63 
 
 		 271 aa  167  1e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3807  UspA domain protein  40.86 
 
 		 270 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3434  hypothetical protein  36.1 
 
 		 275 aa  162  8.000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.406558 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3500  UspA domain-containing protein  40.5 
 
 		 270 aa  161  1e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2220  UspA domain-containing protein  35.71 
 
 		 277 aa  160  2e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3883  UspA domain protein  38.71 
 
 		 270 aa  159  4e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.29253  normal  0.0935727 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0489  UspA domain-containing protein  39.64 
 
 		 272 aa  156  4e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.382692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0440  UspA domain-containing protein  37.23 
 
 		 272 aa  155  7e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.713184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3269  UspA domain-containing protein  43.01 
 
 		 271 aa  154  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.17581  normal  0.400144 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5229  UspA domain protein  40.65 
 
 		 271 aa  154  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.000806741  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1035  universal stress protein UspA  35.46 
 
 		 274 aa  145  6e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2630  UspA domain-containing protein  36.88 
 
 		 272 aa  144  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1935  hypothetical protein  32.85 
 
 		 272 aa  144  2e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.774934  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0430  UspA domain-containing protein  37.14 
 
 		 269 aa  143  4e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6135  UspA domain protein  36.65 
 
 		 270 aa  142  5e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2621  UspA domain-containing protein  37.5 
 
 		 268 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.55549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1142  hypothetical protein  36.14 
 
 		 279 aa  133  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2880  UspA domain-containing protein  34.89 
 
 		 271 aa  132  5e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0427  UspA domain-containing protein  35.84 
 
 		 271 aa  132  5e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0395  UspA domain-containing protein  35.25 
 
 		 270 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.275124  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0185  hypothetical protein  35.94 
 
 		 279 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.123321 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2567  UspA domain-containing protein  33.45 
 
 		 270 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.0044371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2617  UspA domain-containing protein  34.77 
 
 		 271 aa  129  6e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1568  universal stress protein family protein  37.89 
 
 		 278 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.801358  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6131  UspA domain-containing protein  34.88 
 
 		 271 aa  126  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3885  UspA domain protein  36.52 
 
 		 271 aa  127  3e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0886728  normal  0.0599221 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1555  UspA domain protein  33.8 
 
 		 270 aa  123  3e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1355  UspA domain-containing protein  33.45 
 
 		 313 aa  122  6e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.574813 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0706  hypothetical protein  36.62 
 
 		 278 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.566487  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2429  universal stress protein family protein  36.62 
 
 		 278 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1231  universal stress family protein  36.62 
 
 		 279 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.709922  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1157  universal stress family protein  36.62 
 
 		 279 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0423  UspA domain protein  32.86 
 
 		 271 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.892038  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4566  UspA domain protein  35.69 
 
 		 279 aa  120  3e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.564371  normal  0.196949 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4433  UspA domain protein  35.69 
 
 		 279 aa  120  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5581  UspA domain protein  34.88 
 
 		 276 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.351015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0194  UspA domain-containing protein  32.5 
 
 		 270 aa  119  6e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4709  hypothetical protein  33.33 
 
 		 278 aa  118  9e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1143  hypothetical protein  33.92 
 
 		 276 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1133  UspA domain-containing protein  31.32 
 
 		 279 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1300  UspA domain protein  32.3 
 
 		 278 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.085168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1135  UspA domain-containing protein  35.05 
 
 		 277 aa  112  9e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1854  hypothetical protein  33.1 
 
 		 278 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.796292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6312  UspA domain protein  32.65 
 
 		 281 aa  109  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1852  hypothetical protein  33.8 
 
 		 275 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3817  UspA domain-containing protein  30.74 
 
 		 279 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16777  normal  0.520429 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7291  putative universal stress protein UspA  31.29 
 
 		 274 aa  106  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.103507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4285  UspA domain-containing protein  30.39 
 
 		 279 aa  106  5e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.870275  normal  0.299211 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4520  Universal stress protein UspA family UspA14  30 
 
 		 274 aa  105  8e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0108751  decreased coverage  0.00456228 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4744  hypothetical protein  32.86 
 
 		 276 aa  105  9e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3814  UspA domain-containing protein  34.38 
 
 		 277 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.360617  normal  0.615146 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4282  UspA domain-containing protein  32.99 
 
 		 277 aa  102  6e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.132109 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5897  UspA domain-containing protein  29.03 
 
 		 279 aa  101  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.793802  normal  0.290079 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5579  UspA domain protein  30.53 
 
 		 278 aa  100  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.961326 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1566  universal stress protein family protein  30.88 
 
 		 279 aa  99.8  4e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.57632  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5815  UspA domain-containing protein  29.51 
 
 		 279 aa  99.8  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.123141 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6199  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 277 aa  100  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320687  normal  0.442079 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5814  UspA domain-containing protein  34.27 
 
 		 278 aa  99.8  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.128092 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0708  hypothetical protein  30.53 
 
 		 279 aa  99.4  6e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.560113  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2431  universal stress protein family protein  30.53 
 
 		 279 aa  99.4  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0754  universal stress family protein  30.53 
 
 		 279 aa  99.4  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.576046  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1233  universal stress family protein  30.53 
 
 		 279 aa  99.4  6e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.705496  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1159  universal stress family protein  30.53 
 
 		 279 aa  99.4  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1719  universal stress family protein  30.53 
 
 		 279 aa  99.4  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3567  hypothetical protein  29.97 
 
 		 284 aa  97.8  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.920255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4518  universal stress protein UspA family  29.33 
 
 		 282 aa  95.9  7e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0105068  decreased coverage  0.00495689 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2612  hypothetical protein  35.23 
 
 		 291 aa  94  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.12045  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2574  hypothetical protein  31.36 
 
 		 267 aa  93.6  4e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4050  hypothetical protein  31.16 
 
 		 277 aa  92  9e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.946948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1948  hypothetical protein  30.19 
 
 		 279 aa  90.9  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0017  hypothetical protein  35.56 
 
 		 280 aa  89.7  4e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0334555  normal  0.756521 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1345  hypothetical protein  34.15 
 
 		 277 aa  89.4  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1168  hypothetical protein  29.82 
 
 		 279 aa  86.7  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1339  hypothetical protein  29.33 
 
 		 280 aa  87  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.305203  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2353  UspA domain-containing protein  30.6 
 
 		 276 aa  86.7  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366598  normal  0.604347 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0939  UspA domain-containing protein  36.76 
 
 		 287 aa  85.5  8e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.799371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1366  hypothetical protein  33.33 
 
 		 277 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8718  UspA domain protein  38.42 
 
 		 280 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6175  UspA domain protein  38.42 
 
 		 280 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4937  UspA domain-containing protein  28.86 
 
 		 279 aa  84.7  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.144949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1732  hypothetical protein  29.76 
 
 		 284 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0582534  normal  0.0358146 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3571  UspA domain-containing protein  40.27 
 
 		 279 aa  82.8  0.000000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.620295  normal  0.215578 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0578  UspA domain-containing protein  27.44 
 
 		 279 aa  82.8  0.000000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.1138  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0400  hypothetical protein  34.27 
 
 		 281 aa  81.6  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0348  hypothetical protein  31.1 
 
 		 274 aa  82  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00425417 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0571  hypothetical protein  33.91 
 
 		 259 aa  80.9  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3114  hypothetical protein  35.87 
 
 		 265 aa  80.9  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.936734  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2788  UspA domain protein  38.29 
 
 		 271 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.084902  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2231  hypothetical protein  30.45 
 
 		 278 aa  80.1  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4724  UspA domain protein  32.93 
 
 		 277 aa  79.3  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1926  hypothetical protein  38.93 
 
 		 277 aa  79  0.00000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.295242  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0381  UspA domain protein  36.24 
 
 		 274 aa  79  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0466978  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3584  hypothetical protein  27.99 
 
 		 278 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>