208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1345 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_1345  hypothetical protein  100 
 
 		 277 aa  565  1e-160  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1366  hypothetical protein  92.42 
 
 		 277 aa  534  1e-151  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4724  UspA domain protein  84.48 
 
 		 277 aa  474  1e-132  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4050  hypothetical protein  68.95 
 
 		 277 aa  417  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.946948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3114  hypothetical protein  37.05 
 
 		 265 aa  195  7e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.936734  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2353  UspA domain-containing protein  39.01 
 
 		 276 aa  191  8e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366598  normal  0.604347 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1926  hypothetical protein  37.41 
 
 		 277 aa  188  7e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.295242  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0381  UspA domain protein  38.13 
 
 		 274 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0466978  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0952  universal stress protein UspA  35.97 
 
 		 264 aa  186  3e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.511261  normal  0.862568 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0348  hypothetical protein  37.86 
 
 		 274 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00425417 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0446  hypothetical protein  37.28 
 
 		 274 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.179985  normal  0.962231 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5579  UspA domain protein  35.11 
 
 		 278 aa  158  8e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.961326 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1854  hypothetical protein  35.61 
 
 		 278 aa  155  8e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.796292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6312  UspA domain protein  35.69 
 
 		 281 aa  149  4e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1948  hypothetical protein  35.71 
 
 		 279 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4285  UspA domain-containing protein  34.29 
 
 		 279 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.870275  normal  0.299211 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2788  UspA domain protein  41.54 
 
 		 271 aa  145  5e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.084902  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3817  UspA domain-containing protein  33.57 
 
 		 279 aa  143  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16777  normal  0.520429 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0708  hypothetical protein  35 
 
 		 279 aa  142  8e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.560113  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2431  universal stress protein family protein  35 
 
 		 279 aa  142  8e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0754  universal stress family protein  35 
 
 		 279 aa  142  8e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.576046  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1233  universal stress family protein  35 
 
 		 279 aa  142  8e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.705496  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1159  universal stress family protein  35 
 
 		 279 aa  142  8e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1719  universal stress family protein  35 
 
 		 279 aa  142  8e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1566  universal stress protein family protein  35.71 
 
 		 279 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.57632  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0017  hypothetical protein  38.06 
 
 		 280 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0334555  normal  0.756521 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5897  UspA domain-containing protein  32.4 
 
 		 279 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.793802  normal  0.290079 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1142  hypothetical protein  44.24 
 
 		 279 aa  135  5e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5815  UspA domain-containing protein  35.74 
 
 		 279 aa  133  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.123141 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1133  UspA domain-containing protein  31.4 
 
 		 279 aa  132  5e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1168  hypothetical protein  34.15 
 
 		 279 aa  132  7.999999999999999e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6103  UspA domain-containing protein  43.22 
 
 		 271 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0269268 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3435  putative UspA stress protein  31.72 
 
 		 278 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.34254  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2248  hypothetical protein  38.95 
 
 		 277 aa  125  8.000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4566  UspA domain protein  32.75 
 
 		 279 aa  124  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.564371  normal  0.196949 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4433  UspA domain protein  32.75 
 
 		 279 aa  124  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2605  hypothetical protein  31.09 
 
 		 279 aa  124  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.490664  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7779  putative UspA  40 
 
 		 242 aa  124  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0208146  normal  0.10666 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1605  UspA domain-containing protein  40.7 
 
 		 280 aa  122  9e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.591971  normal  0.475521 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1339  hypothetical protein  31.82 
 
 		 280 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.305203  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1568  universal stress protein family protein  31.93 
 
 		 278 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.801358  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0185  hypothetical protein  31.54 
 
 		 279 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.123321 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2305  UspA domain-containing protein  43.45 
 
 		 308 aa  118  9e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5581  UspA domain protein  31.07 
 
 		 276 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.351015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1416  UspA domain protein  33.99 
 
 		 280 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.700604  normal  0.217237 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1592  UspA domain protein  34.15 
 
 		 280 aa  116  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.757336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1135  UspA domain-containing protein  32.86 
 
 		 277 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3035  UspA domain-containing protein  36.07 
 
 		 278 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.415696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0400  hypothetical protein  39.77 
 
 		 281 aa  112  5e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0578  UspA domain-containing protein  30.6 
 
 		 279 aa  110  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.1138  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0706  hypothetical protein  32.08 
 
 		 278 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.566487  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2429  universal stress protein family protein  32.08 
 
 		 278 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1231  universal stress family protein  32.08 
 
 		 279 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.709922  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1157  universal stress family protein  32.08 
 
 		 279 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1143  hypothetical protein  32 
 
 		 276 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1024  universal stress protein UspA  34.09 
 
 		 279 aa  109  4.0000000000000004e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1935  hypothetical protein  31.16 
 
 		 272 aa  108  7.000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.774934  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0939  UspA domain-containing protein  34.34 
 
 		 287 aa  108  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.799371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6199  UspA domain-containing protein  31.12 
 
 		 277 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320687  normal  0.442079 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4744  hypothetical protein  34.21 
 
 		 276 aa  107  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1035  universal stress protein UspA  29.64 
 
 		 274 aa  107  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2617  UspA domain-containing protein  31.58 
 
 		 271 aa  107  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0427  UspA domain-containing protein  32.28 
 
 		 271 aa  107  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3815  UspA domain protein  34.25 
 
 		 286 aa  107  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.763121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4282  UspA domain-containing protein  31.12 
 
 		 277 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.132109 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2220  UspA domain-containing protein  29.24 
 
 		 277 aa  107  3e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2567  UspA domain-containing protein  33.57 
 
 		 270 aa  107  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.0044371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3508  UspA domain-containing protein  34.25 
 
 		 286 aa  106  4e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.364633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3179  UspA domain-containing protein  31.96 
 
 		 279 aa  106  4e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.983564  normal  0.0746884 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3814  UspA domain-containing protein  30.63 
 
 		 277 aa  105  6e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.360617  normal  0.615146 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1983  UspA domain protein  35.91 
 
 		 273 aa  105  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0316321  normal  0.0164528 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3885  UspA domain protein  37.78 
 
 		 271 aa  103  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0886728  normal  0.0599221 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1852  hypothetical protein  39.22 
 
 		 275 aa  103  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4518  universal stress protein UspA family  31.14 
 
 		 282 aa  103  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0105068  decreased coverage  0.00495689 
 
 
-
 
NC_004310  BR1047  hypothetical protein  32 
 
 		 281 aa  102  9e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1012  hypothetical protein  32 
 
 		 281 aa  102  9e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6175  UspA domain protein  36.1 
 
 		 280 aa  100  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3567  hypothetical protein  35.45 
 
 		 284 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.920255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1452  UspA domain protein  38.32 
 
 		 282 aa  99.8  4e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4709  hypothetical protein  37.99 
 
 		 278 aa  99.4  6e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8718  UspA domain protein  36.02 
 
 		 280 aa  99.4  6e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2134  UspA domain-containing protein  36.47 
 
 		 281 aa  99  7e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3584  hypothetical protein  29.62 
 
 		 278 aa  97.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0697  universal stress protein  36.93 
 
 		 282 aa  97.1  3e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2238  hypothetical protein  35.2 
 
 		 280 aa  96.7  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.289135  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2352  UspA domain-containing protein  36.93 
 
 		 282 aa  97.1  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.229476  normal  0.139893 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0440  UspA domain-containing protein  34.48 
 
 		 272 aa  96.3  5e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.713184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6135  UspA domain protein  38 
 
 		 270 aa  95.5  8e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1314  UspA domain-containing protein  32.2 
 
 		 292 aa  95.5  9e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.624966  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5814  UspA domain-containing protein  31.58 
 
 		 278 aa  94.7  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.128092 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1664  UspA domain-containing protein  41.22 
 
 		 279 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.483104  normal  0.685181 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4049  hypothetical protein  30.31 
 
 		 274 aa  95.5  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.36673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3807  UspA domain protein  36.26 
 
 		 270 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3504  UspA domain-containing protein  37.64 
 
 		 286 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0778665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4817  UspA domain protein  29.63 
 
 		 271 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0423  UspA domain protein  33.09 
 
 		 271 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.892038  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5229  UspA domain protein  34.72 
 
 		 271 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.000806741  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3883  UspA domain protein  34.46 
 
 		 270 aa  94  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.29253  normal  0.0935727 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0194  UspA domain-containing protein  36.67 
 
 		 270 aa  94  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0533  UspA domain-containing protein  35.23 
 
 		 282 aa  94  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.298494 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>