206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1366 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007778  RPB_1366  hypothetical protein  100 
 
 
277 aa  566  1e-160  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1345  hypothetical protein  92.42 
 
 
277 aa  517  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4724  UspA domain protein  82.67 
 
 
277 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4050  hypothetical protein  67.51 
 
 
277 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.946948  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3114  hypothetical protein  36.79 
 
 
265 aa  196  3e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.936734  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0348  hypothetical protein  38.16 
 
 
274 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00425417 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0952  universal stress protein UspA  35.38 
 
 
264 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.511261  normal  0.862568 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2353  UspA domain-containing protein  38.3 
 
 
276 aa  188  8e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366598  normal  0.604347 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1926  hypothetical protein  37.06 
 
 
277 aa  187  1e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.295242  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0446  hypothetical protein  37.32 
 
 
274 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.179985  normal  0.962231 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0381  UspA domain protein  36.33 
 
 
274 aa  182  7e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0466978  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5579  UspA domain protein  35.11 
 
 
278 aa  159  6e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.961326 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1854  hypothetical protein  34.89 
 
 
278 aa  151  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.796292  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4285  UspA domain-containing protein  34.29 
 
 
279 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.870275  normal  0.299211 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6312  UspA domain protein  34.98 
 
 
281 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2788  UspA domain protein  41.18 
 
 
271 aa  146  5e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.084902  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3817  UspA domain-containing protein  33.57 
 
 
279 aa  142  4e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16777  normal  0.520429 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0708  hypothetical protein  33.93 
 
 
279 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.560113  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2431  universal stress protein family protein  33.93 
 
 
279 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1566  universal stress protein family protein  34.64 
 
 
279 aa  138  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.57632  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1948  hypothetical protein  33.46 
 
 
279 aa  138  1e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5897  UspA domain-containing protein  31.06 
 
 
279 aa  138  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.793802  normal  0.290079 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0754  universal stress family protein  33.93 
 
 
279 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.576046  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1233  universal stress family protein  33.93 
 
 
279 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.705496  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1159  universal stress family protein  33.93 
 
 
279 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1719  universal stress family protein  33.93 
 
 
279 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1133  UspA domain-containing protein  31.82 
 
 
279 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5815  UspA domain-containing protein  35.34 
 
 
279 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.123141 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0017  hypothetical protein  41.42 
 
 
280 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0334555  normal  0.756521 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1142  hypothetical protein  44 
 
 
279 aa  130  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4566  UspA domain protein  33.33 
 
 
279 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.564371  normal  0.196949 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4433  UspA domain protein  33.33 
 
 
279 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0185  hypothetical protein  31.65 
 
 
279 aa  126  3e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.123321 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1168  hypothetical protein  32.62 
 
 
279 aa  126  5e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6103  UspA domain-containing protein  41.12 
 
 
271 aa  124  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0269268 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3435  putative UspA stress protein  31.72 
 
 
278 aa  124  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.34254  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1339  hypothetical protein  35.89 
 
 
280 aa  123  3e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.305203  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2248  hypothetical protein  41.22 
 
 
277 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1135  UspA domain-containing protein  32.14 
 
 
277 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5581  UspA domain protein  30.85 
 
 
276 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.351015  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1568  universal stress protein family protein  32.4 
 
 
278 aa  119  6e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.801358  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3035  UspA domain-containing protein  37.44 
 
 
278 aa  119  7e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.415696  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1416  UspA domain protein  32.84 
 
 
280 aa  118  7.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.700604  normal  0.217237 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2605  hypothetical protein  29.59 
 
 
279 aa  118  9e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.490664  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7779  putative UspA  37.71 
 
 
242 aa  118  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0208146  normal  0.10666 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1605  UspA domain-containing protein  38.95 
 
 
280 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.591971  normal  0.475521 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1592  UspA domain protein  32.35 
 
 
280 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.757336  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2305  UspA domain-containing protein  42.07 
 
 
308 aa  115  6e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0400  hypothetical protein  39.77 
 
 
281 aa  114  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2220  UspA domain-containing protein  30.69 
 
 
277 aa  113  4.0000000000000004e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0706  hypothetical protein  32.3 
 
 
278 aa  112  6e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.566487  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2429  universal stress protein family protein  32.3 
 
 
278 aa  112  6e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1231  universal stress family protein  32.3 
 
 
279 aa  112  6e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.709922  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1157  universal stress family protein  32.3 
 
 
279 aa  112  6e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3179  UspA domain-containing protein  33.86 
 
 
279 aa  111  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.983564  normal  0.0746884 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4282  UspA domain-containing protein  32.76 
 
 
277 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.132109 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6199  UspA domain-containing protein  32.41 
 
 
277 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320687  normal  0.442079 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2617  UspA domain-containing protein  31.82 
 
 
271 aa  109  6e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213655  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3814  UspA domain-containing protein  32.29 
 
 
277 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.360617  normal  0.615146 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0939  UspA domain-containing protein  34.34 
 
 
287 aa  108  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.799371  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1024  universal stress protein UspA  33.52 
 
 
279 aa  107  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1035  universal stress protein UspA  30 
 
 
274 aa  107  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0427  UspA domain-containing protein  31.58 
 
 
271 aa  107  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0578  UspA domain-containing protein  30.25 
 
 
279 aa  107  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.1138  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2567  UspA domain-containing protein  33.21 
 
 
270 aa  107  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.0044371  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3567  hypothetical protein  37.04 
 
 
284 aa  106  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.920255  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3885  UspA domain protein  38.12 
 
 
271 aa  106  3e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0886728  normal  0.0599221 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1983  UspA domain protein  36.81 
 
 
273 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0316321  normal  0.0164528 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4709  hypothetical protein  37.85 
 
 
278 aa  103  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1852  hypothetical protein  37.91 
 
 
275 aa  102  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5229  UspA domain protein  34.98 
 
 
271 aa  102  5e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.000806741  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1143  hypothetical protein  38.46 
 
 
276 aa  102  6e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4518  universal stress protein UspA family  30.8 
 
 
282 aa  102  6e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0105068  decreased coverage  0.00495689 
 
 
-
 
NC_004310  BR1047  hypothetical protein  31.98 
 
 
281 aa  102  9e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1935  hypothetical protein  31.18 
 
 
272 aa  102  9e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.774934  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1012  hypothetical protein  31.98 
 
 
281 aa  102  9e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1452  UspA domain protein  39.29 
 
 
282 aa  101  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2454  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
291 aa  100  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.821699  normal  0.675849 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4744  hypothetical protein  32.7 
 
 
276 aa  100  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5814  UspA domain-containing protein  31.01 
 
 
278 aa  99.4  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.128092 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0697  universal stress protein  36.93 
 
 
282 aa  99.4  6e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2352  UspA domain-containing protein  36.93 
 
 
282 aa  99.4  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.229476  normal  0.139893 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0423  UspA domain protein  33.33 
 
 
271 aa  99  7e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.892038  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1849  UspA domain-containing protein  30.86 
 
 
277 aa  99  7e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3584  hypothetical protein  28.67 
 
 
278 aa  99  8e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0194  UspA domain-containing protein  37.02 
 
 
270 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0533  UspA domain-containing protein  31.41 
 
 
282 aa  97.8  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.298494 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3815  UspA domain protein  32.08 
 
 
286 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.763121  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1314  UspA domain-containing protein  33.9 
 
 
292 aa  97.8  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.624966  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2134  UspA domain-containing protein  35.47 
 
 
281 aa  97.4  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3508  UspA domain-containing protein  35.81 
 
 
286 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.364633  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2612  hypothetical protein  36.61 
 
 
291 aa  96.7  4e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.12045  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0440  UspA domain-containing protein  36.05 
 
 
272 aa  96.7  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.713184  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4049  hypothetical protein  29.79 
 
 
274 aa  95.9  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.36673  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4817  UspA domain protein  29.89 
 
 
271 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0097  UspA domain protein  30 
 
 
271 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6175  UspA domain protein  31.92 
 
 
280 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1664  UspA domain-containing protein  40.54 
 
 
279 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.483104  normal  0.685181 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2231  hypothetical protein  28.68 
 
 
278 aa  94  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1305  UspA domain protein  34.27 
 
 
287 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186426  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>