210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4937 on replicon NC_009717
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009717  Xaut_4937  UspA domain-containing protein  100 
 
 
279 aa  559  1e-158  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.144949  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3584  hypothetical protein  45.16 
 
 
278 aa  231  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1452  UspA domain protein  43.46 
 
 
282 aa  199  6e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1732  hypothetical protein  40.71 
 
 
284 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0582534  normal  0.0358146 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3567  hypothetical protein  40.07 
 
 
284 aa  186  5e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.920255  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1733  UspA domain protein  37.63 
 
 
276 aa  149  4e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.328326 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0708  hypothetical protein  34.27 
 
 
279 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.560113  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2431  universal stress protein family protein  34.27 
 
 
279 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0754  universal stress family protein  34.27 
 
 
279 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.576046  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1233  universal stress family protein  34.27 
 
 
279 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.705496  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1159  universal stress family protein  34.27 
 
 
279 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1719  universal stress family protein  34.27 
 
 
279 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1566  universal stress protein family protein  34.27 
 
 
279 aa  142  6e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.57632  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6312  UspA domain protein  32.87 
 
 
281 aa  137  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1854  hypothetical protein  33.57 
 
 
278 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.796292  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1133  UspA domain-containing protein  34.36 
 
 
279 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5581  UspA domain protein  33.1 
 
 
276 aa  129  6e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.351015  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0578  UspA domain-containing protein  32.03 
 
 
279 aa  129  7.000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.1138  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1568  universal stress protein family protein  34.72 
 
 
278 aa  127  3e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.801358  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0706  hypothetical protein  34.27 
 
 
278 aa  123  3e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.566487  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2429  universal stress protein family protein  34.27 
 
 
278 aa  123  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1231  universal stress family protein  34.27 
 
 
279 aa  123  3e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.709922  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1157  universal stress family protein  34.27 
 
 
279 aa  123  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1135  UspA domain-containing protein  36.68 
 
 
277 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5815  UspA domain-containing protein  31.82 
 
 
279 aa  120  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.123141 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3817  UspA domain-containing protein  30.77 
 
 
279 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16777  normal  0.520429 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1852  hypothetical protein  32.87 
 
 
275 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4285  UspA domain-containing protein  30.07 
 
 
279 aa  117  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.870275  normal  0.299211 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0446  hypothetical protein  31.25 
 
 
274 aa  115  6e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.179985  normal  0.962231 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5579  UspA domain protein  31 
 
 
278 aa  115  6e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.961326 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1592  UspA domain protein  30.88 
 
 
280 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.757336  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5897  UspA domain-containing protein  29.72 
 
 
279 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.793802  normal  0.290079 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0348  hypothetical protein  30.21 
 
 
274 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00425417 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1948  hypothetical protein  32.66 
 
 
279 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1416  UspA domain protein  31.41 
 
 
280 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.700604  normal  0.217237 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4566  UspA domain protein  32.06 
 
 
279 aa  108  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.564371  normal  0.196949 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4433  UspA domain protein  32.06 
 
 
279 aa  108  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3435  putative UspA stress protein  30.95 
 
 
278 aa  108  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.34254  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4282  UspA domain-containing protein  32.04 
 
 
277 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.132109 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2220  UspA domain-containing protein  29.18 
 
 
277 aa  107  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3814  UspA domain-containing protein  31.69 
 
 
277 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.360617  normal  0.615146 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1339  hypothetical protein  29.97 
 
 
280 aa  106  4e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.305203  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6199  UspA domain-containing protein  31.69 
 
 
277 aa  105  6e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320687  normal  0.442079 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3114  hypothetical protein  28.83 
 
 
265 aa  105  7e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.936734  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2134  UspA domain-containing protein  29.97 
 
 
281 aa  105  7e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5814  UspA domain-containing protein  32.98 
 
 
278 aa  105  8e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.128092 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2546  hypothetical protein  31.23 
 
 
279 aa  105  9e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.109309  normal  0.809091 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0427  UspA domain-containing protein  31.03 
 
 
271 aa  105  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2605  hypothetical protein  30.96 
 
 
279 aa  104  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.490664  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0430  UspA domain-containing protein  34.04 
 
 
269 aa  104  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1142  hypothetical protein  33.68 
 
 
279 aa  103  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6135  UspA domain protein  33.68 
 
 
270 aa  103  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0185  hypothetical protein  40.91 
 
 
279 aa  103  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.123321 
 
 
-
 
NC_004310  BR1047  hypothetical protein  34.22 
 
 
281 aa  102  6e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1012  hypothetical protein  34.22 
 
 
281 aa  102  6e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2231  hypothetical protein  36.43 
 
 
278 aa  102  7e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3434  hypothetical protein  30.31 
 
 
275 aa  102  7e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.406558 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6131  UspA domain-containing protein  31.12 
 
 
271 aa  102  9e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267021  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1926  hypothetical protein  28.42 
 
 
277 aa  102  9e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.295242  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0423  UspA domain protein  30.63 
 
 
271 aa  101  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.892038  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0952  universal stress protein UspA  26.16 
 
 
264 aa  100  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.511261  normal  0.862568 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1849  UspA domain-containing protein  30.24 
 
 
277 aa  101  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7779  putative UspA  33.04 
 
 
242 aa  101  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0208146  normal  0.10666 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4518  universal stress protein UspA family  31.03 
 
 
282 aa  100  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0105068  decreased coverage  0.00495689 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2617  UspA domain-containing protein  29.45 
 
 
271 aa  100  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213655  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2630  UspA domain-containing protein  31.4 
 
 
272 aa  99.4  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4709  hypothetical protein  29.73 
 
 
278 aa  99  8e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2621  UspA domain-containing protein  32.74 
 
 
268 aa  98.6  9e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.55549  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4520  Universal stress protein UspA family UspA14  30.74 
 
 
274 aa  98.6  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0108751  decreased coverage  0.00456228 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5229  UspA domain protein  32.64 
 
 
271 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.000806741  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1143  hypothetical protein  40 
 
 
276 aa  97.4  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3885  UspA domain protein  29.55 
 
 
271 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0886728  normal  0.0599221 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0440  UspA domain-containing protein  30.34 
 
 
272 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.713184  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3500  UspA domain-containing protein  31.72 
 
 
270 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2238  hypothetical protein  29.63 
 
 
280 aa  97.1  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.289135  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1168  hypothetical protein  30.23 
 
 
279 aa  96.7  4e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0939  UspA domain-containing protein  30.72 
 
 
287 aa  96.7  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.799371  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3807  UspA domain protein  31.49 
 
 
270 aa  96.7  4e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0266  UspA domain-containing protein  32.39 
 
 
260 aa  96.7  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.194417  normal  0.123671 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3883  UspA domain protein  31.36 
 
 
270 aa  96.3  6e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.29253  normal  0.0935727 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0097  UspA domain protein  31.1 
 
 
271 aa  95.9  7e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1024  universal stress protein UspA  36.47 
 
 
279 aa  95.5  8e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3179  UspA domain-containing protein  37.32 
 
 
279 aa  94.7  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.983564  normal  0.0746884 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2974  UspA domain-containing protein  27.14 
 
 
266 aa  95.1  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.206792  normal  0.319712 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4817  UspA domain protein  31.1 
 
 
271 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0381  UspA domain protein  27.18 
 
 
274 aa  94.7  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0466978  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1605  UspA domain-containing protein  36.62 
 
 
280 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.591971  normal  0.475521 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0533  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
282 aa  94.4  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.298494 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0697  universal stress protein  34.5 
 
 
282 aa  93.6  3e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6175  UspA domain protein  33.67 
 
 
280 aa  94  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2352  UspA domain-containing protein  34.5 
 
 
282 aa  93.6  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.229476  normal  0.139893 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1035  universal stress protein UspA  31.16 
 
 
274 aa  92.4  7e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8718  UspA domain protein  37.5 
 
 
280 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2880  UspA domain-containing protein  30.69 
 
 
271 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0194  UspA domain-containing protein  30.43 
 
 
270 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2567  UspA domain-containing protein  32.28 
 
 
270 aa  90.1  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.0044371  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2353  UspA domain-containing protein  29.9 
 
 
276 aa  89.4  6e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366598  normal  0.604347 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5900  UspA domain-containing protein  32.52 
 
 
278 aa  89  8e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.556152  normal  0.106065 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1935  hypothetical protein  27.21 
 
 
272 aa  88.2  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.774934  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0017  hypothetical protein  30.28 
 
 
280 aa  88.6  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0334555  normal  0.756521 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>