213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0533 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0533  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 282 aa  560  1.0000000000000001e-159  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.298494 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0697  universal stress protein  92.91 
 
 		 282 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2352  UspA domain-containing protein  92.91 
 
 		 282 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.229476  normal  0.139893 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1849  UspA domain-containing protein  55.52 
 
 		 277 aa  311  6.999999999999999e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2546  hypothetical protein  52.13 
 
 		 279 aa  295  6e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.109309  normal  0.809091 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2231  hypothetical protein  33.68 
 
 		 278 aa  126  4.0000000000000003e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1854  hypothetical protein  33.9 
 
 		 278 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.796292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0348  hypothetical protein  33.96 
 
 		 274 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00425417 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2612  hypothetical protein  43.58 
 
 		 291 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.12045  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0423  UspA domain protein  40.2 
 
 		 271 aa  113  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.892038  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5815  UspA domain-containing protein  31.72 
 
 		 279 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.123141 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0708  hypothetical protein  32.53 
 
 		 279 aa  113  5e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.560113  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2431  universal stress protein family protein  32.53 
 
 		 279 aa  113  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0754  universal stress family protein  32.53 
 
 		 279 aa  113  5e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.576046  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1233  universal stress family protein  32.53 
 
 		 279 aa  113  5e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.705496  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1159  universal stress family protein  32.53 
 
 		 279 aa  113  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1719  universal stress family protein  32.53 
 
 		 279 aa  113  5e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2353  UspA domain-containing protein  36.3 
 
 		 276 aa  112  9e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366598  normal  0.604347 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3567  hypothetical protein  34.36 
 
 		 284 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.920255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6312  UspA domain protein  32.99 
 
 		 281 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1566  universal stress protein family protein  32.53 
 
 		 279 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.57632  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3584  hypothetical protein  36.93 
 
 		 278 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1733  UspA domain protein  32.72 
 
 		 276 aa  111  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.328326 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2617  UspA domain-containing protein  41.57 
 
 		 271 aa  109  6e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2788  UspA domain protein  41.44 
 
 		 271 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.084902  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0381  UspA domain protein  36.36 
 
 		 274 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0466978  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0446  hypothetical protein  31.41 
 
 		 274 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.179985  normal  0.962231 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3435  putative UspA stress protein  32.08 
 
 		 278 aa  107  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.34254  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5579  UspA domain protein  32.65 
 
 		 278 aa  107  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.961326 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3114  hypothetical protein  37.5 
 
 		 265 aa  106  4e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.936734  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0427  UspA domain-containing protein  40.45 
 
 		 271 aa  105  7e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1133  UspA domain-containing protein  31.62 
 
 		 279 aa  105  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1452  UspA domain protein  36.57 
 
 		 282 aa  105  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1568  universal stress protein family protein  33.1 
 
 		 278 aa  103  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.801358  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1926  hypothetical protein  38.36 
 
 		 277 aa  102  5e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.295242  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0706  hypothetical protein  42.22 
 
 		 278 aa  102  6e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.566487  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2429  universal stress protein family protein  42.22 
 
 		 278 aa  102  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1231  universal stress family protein  42.22 
 
 		 279 aa  102  6e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.709922  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1157  universal stress family protein  42.22 
 
 		 279 aa  102  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2238  hypothetical protein  33.46 
 
 		 280 aa  102  7e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.289135  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0952  universal stress protein UspA  34.81 
 
 		 264 aa  102  1e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.511261  normal  0.862568 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6131  UspA domain-containing protein  41.57 
 
 		 271 aa  101  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7779  putative UspA  34.62 
 
 		 242 aa  101  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0208146  normal  0.10666 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5897  UspA domain-containing protein  31.53 
 
 		 279 aa  100  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.793802  normal  0.290079 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4285  UspA domain-containing protein  31.06 
 
 		 279 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.870275  normal  0.299211 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1732  hypothetical protein  31.96 
 
 		 284 aa  99.8  4e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0582534  normal  0.0358146 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1948  hypothetical protein  36 
 
 		 279 aa  99.8  5e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1605  UspA domain-containing protein  39.78 
 
 		 280 aa  99  7e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.591971  normal  0.475521 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4050  hypothetical protein  31.46 
 
 		 277 aa  98.2  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.946948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3814  UspA domain-containing protein  32.18 
 
 		 277 aa  98.2  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.360617  normal  0.615146 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3817  UspA domain-containing protein  31.06 
 
 		 279 aa  98.2  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16777  normal  0.520429 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0578  UspA domain-containing protein  35.59 
 
 		 279 aa  98.2  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.1138  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0742  UspA domain-containing protein  38.46 
 
 		 286 aa  98.2  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.861253 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1366  hypothetical protein  31.41 
 
 		 277 aa  97.8  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4724  UspA domain protein  36.87 
 
 		 277 aa  97.8  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5814  UspA domain-containing protein  36.15 
 
 		 278 aa  97.4  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.128092 
 
 
-
 
NC_004310  BR1047  hypothetical protein  36.09 
 
 		 281 aa  97.1  3e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1012  hypothetical protein  36.09 
 
 		 281 aa  97.1  3e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1142  hypothetical protein  32.65 
 
 		 279 aa  96.7  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2248  hypothetical protein  32.07 
 
 		 277 aa  96.3  5e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1300  UspA domain protein  38.46 
 
 		 278 aa  96.3  5e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.085168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5229  UspA domain protein  37.43 
 
 		 271 aa  95.9  6e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.000806741  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1135  UspA domain-containing protein  32.99 
 
 		 277 aa  95.9  7e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2134  UspA domain-containing protein  34.39 
 
 		 281 aa  95.5  8e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1143  hypothetical protein  39.46 
 
 		 276 aa  95.1  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4709  hypothetical protein  39.89 
 
 		 278 aa  94.7  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2630  UspA domain-containing protein  32.99 
 
 		 272 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0440  UspA domain-containing protein  31.19 
 
 		 272 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.713184  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1592  UspA domain protein  31.07 
 
 		 280 aa  95.1  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.757336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3179  UspA domain-containing protein  39.35 
 
 		 279 aa  94.4  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.983564  normal  0.0746884 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2605  hypothetical protein  35.63 
 
 		 279 aa  94.7  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.490664  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6199  UspA domain-containing protein  31.83 
 
 		 277 aa  94  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320687  normal  0.442079 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0194  UspA domain-containing protein  38.59 
 
 		 270 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4282  UspA domain-containing protein  32.99 
 
 		 277 aa  94.4  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.132109 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4937  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 279 aa  94.4  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.144949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1416  UspA domain protein  31.43 
 
 		 280 aa  94  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.700604  normal  0.217237 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1345  hypothetical protein  35.23 
 
 		 277 aa  94  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2974  UspA domain-containing protein  29.68 
 
 		 266 aa  94  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.206792  normal  0.319712 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4817  UspA domain protein  37.85 
 
 		 271 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1355  UspA domain-containing protein  35.14 
 
 		 313 aa  93.2  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.574813 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0097  UspA domain protein  37.85 
 
 		 271 aa  93.2  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1555  UspA domain protein  41.1 
 
 		 270 aa  93.2  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3129  UspA domain protein  31.68 
 
 		 294 aa  92.8  6e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.131964  normal  0.194874 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1024  universal stress protein UspA  37.14 
 
 		 279 aa  92  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1852  hypothetical protein  36.81 
 
 		 275 aa  90.9  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4520  Universal stress protein UspA family UspA14  38.56 
 
 		 274 aa  90.9  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0108751  decreased coverage  0.00456228 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6135  UspA domain protein  38.01 
 
 		 270 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2880  UspA domain-containing protein  36.67 
 
 		 271 aa  89.7  5e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3508  UspA domain-containing protein  31.25 
 
 		 286 aa  89.7  5e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.364633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0409  UspA domain-containing protein  40.74 
 
 		 286 aa  89.7  5e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3885  UspA domain protein  38.33 
 
 		 271 aa  89.4  6e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0886728  normal  0.0599221 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2982  UspA domain-containing protein  34.66 
 
 		 279 aa  89.4  7e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3018  UspA domain-containing protein  36.21 
 
 		 277 aa  89  8e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0395  UspA domain-containing protein  39.56 
 
 		 270 aa  89  8e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.275124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2454  UspA domain-containing protein  32.64 
 
 		 291 aa  88.6  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.821699  normal  0.675849 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0266  UspA domain-containing protein  38.15 
 
 		 260 aa  88.6  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.194417  normal  0.123671 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4744  hypothetical protein  33.04 
 
 		 276 aa  87.4  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1314  UspA domain-containing protein  34.27 
 
 		 292 aa  87.4  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.624966  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3571  UspA domain-containing protein  37.18 
 
 		 279 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.620295  normal  0.215578 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2567  UspA domain-containing protein  38.12 
 
 		 270 aa  87  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.0044371  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>