176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2974 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2974  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 266 aa  531  1e-150  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.206792  normal  0.319712 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0266  UspA domain-containing protein  49.63 
 
 		 260 aa  238  5.999999999999999e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.194417  normal  0.123671 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1679  hypothetical protein  36.4 
 
 		 269 aa  125  6e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0785159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0571  hypothetical protein  34.31 
 
 		 259 aa  124  2e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2546  hypothetical protein  29.35 
 
 		 279 aa  107  3e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.109309  normal  0.809091 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1133  UspA domain-containing protein  28.47 
 
 		 279 aa  102  9e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1849  UspA domain-containing protein  29.45 
 
 		 277 aa  100  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4937  UspA domain-containing protein  27.14 
 
 		 279 aa  95.1  9e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.144949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6312  UspA domain protein  28.01 
 
 		 281 aa  94.7  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0533  UspA domain-containing protein  29.68 
 
 		 282 aa  94  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.298494 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0697  universal stress protein  31.91 
 
 		 282 aa  93.6  3e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2352  UspA domain-containing protein  31.91 
 
 		 282 aa  93.6  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.229476  normal  0.139893 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1566  universal stress protein family protein  28.98 
 
 		 279 aa  93.2  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.57632  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2231  hypothetical protein  27.8 
 
 		 278 aa  91.3  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0194  UspA domain-containing protein  32.17 
 
 		 270 aa  90.1  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0708  hypothetical protein  28.11 
 
 		 279 aa  90.1  4e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.560113  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2431  universal stress protein family protein  28.11 
 
 		 279 aa  90.1  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0754  universal stress family protein  28.11 
 
 		 279 aa  90.1  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.576046  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1233  universal stress family protein  28.11 
 
 		 279 aa  90.1  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.705496  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1159  universal stress family protein  28.11 
 
 		 279 aa  90.1  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1719  universal stress family protein  28.11 
 
 		 279 aa  90.1  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5579  UspA domain protein  28.93 
 
 		 278 aa  89  7e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.961326 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0952  universal stress protein UspA  26.64 
 
 		 264 aa  88.6  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.511261  normal  0.862568 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3584  hypothetical protein  26.62 
 
 		 278 aa  88.6  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5815  UspA domain-containing protein  28.62 
 
 		 279 aa  87  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.123141 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0423  UspA domain protein  28.85 
 
 		 271 aa  86.7  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.892038  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1568  universal stress protein family protein  30.6 
 
 		 278 aa  86.3  5e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.801358  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2567  UspA domain-containing protein  32 
 
 		 270 aa  85.9  6e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.0044371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1135  UspA domain-containing protein  29.03 
 
 		 277 aa  85.9  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0706  hypothetical protein  31.93 
 
 		 278 aa  85.5  8e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.566487  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2429  universal stress protein family protein  31.93 
 
 		 278 aa  85.5  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1231  universal stress family protein  31.93 
 
 		 279 aa  85.5  8e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.709922  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1157  universal stress family protein  31.93 
 
 		 279 aa  85.5  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5581  UspA domain protein  29.58 
 
 		 276 aa  85.5  9e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.351015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3817  UspA domain-containing protein  30.14 
 
 		 279 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16777  normal  0.520429 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1852  hypothetical protein  30.11 
 
 		 275 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1854  hypothetical protein  28.52 
 
 		 278 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.796292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4285  UspA domain-containing protein  30.85 
 
 		 279 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.870275  normal  0.299211 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2612  hypothetical protein  28.38 
 
 		 291 aa  83.2  0.000000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.12045  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1168  hypothetical protein  28.57 
 
 		 279 aa  83.2  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2880  UspA domain-containing protein  31.18 
 
 		 271 aa  82  0.000000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3114  hypothetical protein  26.09 
 
 		 265 aa  82  0.000000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.936734  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5229  UspA domain protein  32.26 
 
 		 271 aa  82  0.000000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.000806741  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2220  UspA domain-containing protein  26.74 
 
 		 277 aa  82  0.000000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5814  UspA domain-containing protein  29.29 
 
 		 278 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.128092 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1142  hypothetical protein  29.44 
 
 		 279 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3893  UspA domain protein  35.09 
 
 		 311 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.531117  normal  0.217481 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0395  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 270 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.275124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1355  UspA domain-containing protein  30.66 
 
 		 313 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.574813 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1555  UspA domain protein  30.66 
 
 		 270 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6131  UspA domain-containing protein  31.64 
 
 		 271 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1143  hypothetical protein  30.32 
 
 		 276 aa  79.7  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3571  UspA domain-containing protein  36.59 
 
 		 279 aa  79.3  0.00000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.620295  normal  0.215578 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3815  UspA domain protein  33.33 
 
 		 286 aa  79  0.00000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.763121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0348  hypothetical protein  25.81 
 
 		 274 aa  79  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00425417 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0939  UspA domain-containing protein  35.52 
 
 		 287 aa  79  0.00000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.799371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0446  hypothetical protein  26.24 
 
 		 274 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.179985  normal  0.962231 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4518  universal stress protein UspA family  32.59 
 
 		 282 aa  78.2  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0105068  decreased coverage  0.00495689 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3508  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 286 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.364633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6175  UspA domain protein  28.77 
 
 		 280 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3883  UspA domain protein  29.91 
 
 		 270 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.29253  normal  0.0935727 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0398  UspA domain-containing protein  35.8 
 
 		 286 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.21079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4050  hypothetical protein  32.5 
 
 		 277 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.946948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2605  hypothetical protein  33.52 
 
 		 279 aa  77  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.490664  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0185  hypothetical protein  25.89 
 
 		 279 aa  76.6  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.123321 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5897  UspA domain-containing protein  28.72 
 
 		 279 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.793802  normal  0.290079 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8718  UspA domain protein  33.54 
 
 		 280 aa  75.9  0.0000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1926  hypothetical protein  29.82 
 
 		 277 aa  75.5  0.0000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.295242  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3814  UspA domain-containing protein  26.71 
 
 		 277 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.360617  normal  0.615146 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1605  UspA domain-containing protein  30.64 
 
 		 280 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.591971  normal  0.475521 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4282  UspA domain-containing protein  26.71 
 
 		 277 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.132109 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1948  hypothetical protein  26.41 
 
 		 279 aa  73.9  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0017  hypothetical protein  29.6 
 
 		 280 aa  74.3  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0334555  normal  0.756521 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3434  hypothetical protein  26.33 
 
 		 275 aa  74.3  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.406558 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3129  UspA domain protein  30.85 
 
 		 294 aa  73.9  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.131964  normal  0.194874 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6199  UspA domain-containing protein  26.71 
 
 		 277 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320687  normal  0.442079 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0427  UspA domain-containing protein  29.41 
 
 		 271 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2617  UspA domain-containing protein  32.93 
 
 		 271 aa  72.8  0.000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2353  UspA domain-containing protein  34 
 
 		 276 aa  72.4  0.000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366598  normal  0.604347 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3179  UspA domain-containing protein  29.41 
 
 		 279 aa  72.4  0.000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.983564  normal  0.0746884 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4709  hypothetical protein  28.47 
 
 		 278 aa  71.2  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4433  UspA domain protein  26.88 
 
 		 279 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4520  Universal stress protein UspA family UspA14  30.14 
 
 		 274 aa  71.6  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0108751  decreased coverage  0.00456228 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4566  UspA domain protein  26.88 
 
 		 279 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.564371  normal  0.196949 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0409  UspA domain-containing protein  35.8 
 
 		 286 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3807  UspA domain protein  29.26 
 
 		 270 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1300  UspA domain protein  31.01 
 
 		 278 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.085168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2619  UspA domain-containing protein  28.97 
 
 		 286 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.794322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0429  UspA domain-containing protein  27.99 
 
 		 295 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.760524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2599  UspA domain-containing protein  33.92 
 
 		 286 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0381  UspA domain protein  30.94 
 
 		 274 aa  70.1  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0466978  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0400  hypothetical protein  31.15 
 
 		 281 aa  69.7  0.00000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3500  UspA domain-containing protein  28.72 
 
 		 270 aa  70.1  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2248  hypothetical protein  30.46 
 
 		 277 aa  69.7  0.00000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0430  UspA domain-containing protein  33.53 
 
 		 269 aa  69.7  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1733  UspA domain protein  27.21 
 
 		 276 aa  69.3  0.00000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.328326 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1305  UspA domain protein  36.44 
 
 		 287 aa  69.3  0.00000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186426  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6135  UspA domain protein  27.13 
 
 		 270 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1452  UspA domain protein  27.81 
 
 		 282 aa  68.6  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2621  UspA domain-containing protein  32.34 
 
 		 268 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.55549  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>