211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1679 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1679  hypothetical protein  100 
 
 		 269 aa  526  1e-148  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0785159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0571  hypothetical protein  37.92 
 
 		 259 aa  167  2e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2974  UspA domain-containing protein  36.4 
 
 		 266 aa  135  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.206792  normal  0.319712 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0266  UspA domain-containing protein  36.5 
 
 		 260 aa  125  5e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.194417  normal  0.123671 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1133  UspA domain-containing protein  32.62 
 
 		 279 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1849  UspA domain-containing protein  30.5 
 
 		 277 aa  102  4e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0708  hypothetical protein  31.65 
 
 		 279 aa  102  8e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.560113  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2431  universal stress protein family protein  31.65 
 
 		 279 aa  102  8e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0754  universal stress family protein  31.65 
 
 		 279 aa  102  8e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.576046  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1233  universal stress family protein  31.65 
 
 		 279 aa  102  8e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.705496  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1159  universal stress family protein  31.65 
 
 		 279 aa  102  8e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1719  universal stress family protein  31.65 
 
 		 279 aa  102  8e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1566  universal stress protein family protein  31.65 
 
 		 279 aa  101  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.57632  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5579  UspA domain protein  30.58 
 
 		 278 aa  99  7e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.961326 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2617  UspA domain-containing protein  30.25 
 
 		 271 aa  99  8e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5897  UspA domain-containing protein  31.67 
 
 		 279 aa  98.2  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.793802  normal  0.290079 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0395  UspA domain-containing protein  32.85 
 
 		 270 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.275124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6312  UspA domain protein  28.67 
 
 		 281 aa  97.4  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0427  UspA domain-containing protein  30.6 
 
 		 271 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3817  UspA domain-containing protein  30.5 
 
 		 279 aa  95.5  7e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16777  normal  0.520429 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5815  UspA domain-containing protein  31.32 
 
 		 279 aa  95.1  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.123141 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1854  hypothetical protein  31.29 
 
 		 278 aa  94.4  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.796292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2567  UspA domain-containing protein  32.73 
 
 		 270 aa  92  9e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.0044371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4285  UspA domain-containing protein  30.04 
 
 		 279 aa  89  7e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.870275  normal  0.299211 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4744  hypothetical protein  31.38 
 
 		 276 aa  88.6  9e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1555  UspA domain protein  32.86 
 
 		 270 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1355  UspA domain-containing protein  32.86 
 
 		 313 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.574813 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0952  universal stress protein UspA  27.84 
 
 		 264 aa  86.3  5e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.511261  normal  0.862568 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1852  hypothetical protein  29.47 
 
 		 275 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3584  hypothetical protein  27.34 
 
 		 278 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3114  hypothetical protein  27.44 
 
 		 265 aa  82.8  0.000000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.936734  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4723  UspA domain protein  36.49 
 
 		 278 aa  82.8  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.973873  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1135  UspA domain-containing protein  30.18 
 
 		 277 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1568  universal stress protein family protein  28.72 
 
 		 278 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.801358  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5581  UspA domain protein  26.45 
 
 		 276 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.351015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1231  universal stress family protein  29.02 
 
 		 279 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.709922  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1157  universal stress family protein  29.02 
 
 		 279 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0706  hypothetical protein  29.02 
 
 		 278 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.566487  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2429  universal stress protein family protein  29.02 
 
 		 278 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1765  UspA domain-containing protein  27.12 
 
 		 315 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1339  hypothetical protein  30.34 
 
 		 280 aa  80.5  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.305203  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2101  UspA domain protein  26.78 
 
 		 287 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal  0.400879 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5814  UspA domain-containing protein  30.31 
 
 		 278 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.128092 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1366  hypothetical protein  24.82 
 
 		 277 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0939  UspA domain-containing protein  28.28 
 
 		 287 aa  79.7  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.799371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1143  hypothetical protein  37.86 
 
 		 276 aa  79.3  0.00000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2546  hypothetical protein  27.14 
 
 		 279 aa  79.3  0.00000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.109309  normal  0.809091 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0440  UspA domain-containing protein  29.2 
 
 		 272 aa  79  0.00000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.713184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4049  hypothetical protein  33.18 
 
 		 274 aa  79  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.36673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4709  hypothetical protein  35.57 
 
 		 278 aa  78.6  0.00000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1529  UspA domain protein  26.44 
 
 		 287 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.459492 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1346  hypothetical protein  33.09 
 
 		 274 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.658073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2630  UspA domain-containing protein  29.93 
 
 		 272 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2220  UspA domain-containing protein  34.01 
 
 		 277 aa  77.4  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2612  hypothetical protein  31.97 
 
 		 291 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.12045  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1345  hypothetical protein  24.64 
 
 		 277 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0430  UspA domain-containing protein  35.59 
 
 		 269 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1168  hypothetical protein  29.66 
 
 		 279 aa  77  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1300  UspA domain protein  30.64 
 
 		 278 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.085168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3883  UspA domain protein  35.76 
 
 		 270 aa  76.6  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.29253  normal  0.0935727 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1367  hypothetical protein  31.16 
 
 		 276 aa  75.9  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2231  hypothetical protein  28.68 
 
 		 278 aa  76.3  0.0000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1305  UspA domain protein  27.55 
 
 		 287 aa  75.5  0.0000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186426  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0185  hypothetical protein  33.54 
 
 		 279 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.123321 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1142  hypothetical protein  29.59 
 
 		 279 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4050  hypothetical protein  26.3 
 
 		 277 aa  74.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.946948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1948  hypothetical protein  35.71 
 
 		 279 aa  74.3  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0533  UspA domain-containing protein  28.04 
 
 		 282 aa  74.3  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.298494 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6199  UspA domain-containing protein  28.52 
 
 		 277 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320687  normal  0.442079 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3571  UspA domain-containing protein  39.62 
 
 		 279 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.620295  normal  0.215578 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4518  universal stress protein UspA family  29.31 
 
 		 282 aa  73.9  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0105068  decreased coverage  0.00495689 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3814  UspA domain-containing protein  28.01 
 
 		 277 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.360617  normal  0.615146 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0079  UspA domain-containing protein  29.15 
 
 		 285 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.288519  normal  0.367855 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3434  hypothetical protein  25.71 
 
 		 275 aa  73.6  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.406558 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1926  hypothetical protein  25.8 
 
 		 277 aa  73.2  0.000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.295242  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2353  UspA domain-containing protein  28.37 
 
 		 276 aa  72.8  0.000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366598  normal  0.604347 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1664  UspA domain-containing protein  27.02 
 
 		 279 aa  72.8  0.000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.483104  normal  0.685181 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0489  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 272 aa  72.4  0.000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.382692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2305  UspA domain-containing protein  34.23 
 
 		 308 aa  72.4  0.000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0429  UspA domain-containing protein  29.1 
 
 		 295 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.760524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0400  hypothetical protein  32.37 
 
 		 281 aa  71.6  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0697  universal stress protein  30.56 
 
 		 282 aa  70.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1935  hypothetical protein  28.47 
 
 		 272 aa  71.2  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.774934  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4520  Universal stress protein UspA family UspA14  35.77 
 
 		 274 aa  71.2  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0108751  decreased coverage  0.00456228 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4282  UspA domain-containing protein  27.7 
 
 		 277 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.132109 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4566  UspA domain protein  28.51 
 
 		 279 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.564371  normal  0.196949 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3018  UspA domain-containing protein  26.21 
 
 		 277 aa  71.2  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2352  UspA domain-containing protein  30.56 
 
 		 282 aa  70.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.229476  normal  0.139893 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4433  UspA domain protein  28.51 
 
 		 279 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0446  hypothetical protein  35.17 
 
 		 274 aa  70.5  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.179985  normal  0.962231 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2788  UspA domain protein  29.34 
 
 		 271 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.084902  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2621  UspA domain-containing protein  33.74 
 
 		 268 aa  70.1  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.55549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6135  UspA domain protein  34.56 
 
 		 270 aa  70.1  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6131  UspA domain-containing protein  32 
 
 		 271 aa  69.3  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0348  hypothetical protein  35.37 
 
 		 274 aa  69.3  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00425417 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1913  hypothetical protein  31.54 
 
 		 278 aa  68.9  0.00000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.082206  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5229  UspA domain protein  31.82 
 
 		 271 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.000806741  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3366  UspA domain-containing protein  29.7 
 
 		 264 aa  67.8  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6103  UspA domain-containing protein  41.3 
 
 		 271 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0269268 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7779  putative UspA  36 
 
 		 242 aa  67.8  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0208146  normal  0.10666 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>