227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2612 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2612  hypothetical protein  100 
 
 		 291 aa  565  1e-160  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.12045  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3129  UspA domain protein  41.36 
 
 		 294 aa  197  1.0000000000000001e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.131964  normal  0.194874 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1314  UspA domain-containing protein  40.89 
 
 		 292 aa  180  2.9999999999999997e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.624966  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0742  UspA domain-containing protein  38.01 
 
 		 286 aa  146  5e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.861253 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2292  UspA domain-containing protein  44.5 
 
 		 287 aa  142  9e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0820685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1765  UspA domain-containing protein  37.86 
 
 		 315 aa  142  9e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1529  UspA domain protein  38.21 
 
 		 287 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.459492 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2101  UspA domain protein  37.14 
 
 		 287 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal  0.400879 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0079  UspA domain-containing protein  36.84 
 
 		 285 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.288519  normal  0.367855 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3018  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 277 aa  130  2.0000000000000002e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0939  UspA domain-containing protein  43.81 
 
 		 287 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.799371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2619  UspA domain-containing protein  35.5 
 
 		 286 aa  126  5e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.794322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0429  UspA domain-containing protein  35.5 
 
 		 295 aa  125  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.760524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1664  UspA domain-containing protein  34.46 
 
 		 279 aa  122  8e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.483104  normal  0.685181 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1133  UspA domain-containing protein  32.32 
 
 		 279 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1046  UspA domain protein  34.48 
 
 		 279 aa  118  9e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.308422  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2353  UspA domain-containing protein  31.62 
 
 		 276 aa  118  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366598  normal  0.604347 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2248  hypothetical protein  32.99 
 
 		 277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1854  hypothetical protein  36.2 
 
 		 278 aa  116  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.796292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1849  UspA domain-containing protein  31.54 
 
 		 277 aa  116  5e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1305  UspA domain protein  40.16 
 
 		 287 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186426  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0533  UspA domain-containing protein  43.58 
 
 		 282 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.298494 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0194  UspA domain-containing protein  34.69 
 
 		 270 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0017  hypothetical protein  33.78 
 
 		 280 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0334555  normal  0.756521 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1605  UspA domain-containing protein  51.03 
 
 		 280 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.591971  normal  0.475521 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1555  UspA domain protein  34.96 
 
 		 270 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1566  universal stress protein family protein  32.43 
 
 		 279 aa  112  9e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.57632  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0697  universal stress protein  43.02 
 
 		 282 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4520  Universal stress protein UspA family UspA14  39.7 
 
 		 274 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0108751  decreased coverage  0.00456228 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1256  hypothetical protein  23.08 
 
 		 282 aa  111  1.0000000000000001e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2352  UspA domain-containing protein  43.02 
 
 		 282 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.229476  normal  0.139893 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1355  UspA domain-containing protein  31.97 
 
 		 313 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.574813 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4709  hypothetical protein  42.71 
 
 		 278 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1135  UspA domain-containing protein  34.01 
 
 		 277 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2880  UspA domain-containing protein  38.3 
 
 		 271 aa  110  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0430  UspA domain-containing protein  40.53 
 
 		 269 aa  110  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1142  hypothetical protein  39.27 
 
 		 279 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1143  hypothetical protein  42.13 
 
 		 276 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0828  UspA domain protein  40.21 
 
 		 277 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0482749 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5229  UspA domain protein  36.51 
 
 		 271 aa  109  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.000806741  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5815  UspA domain-containing protein  37.56 
 
 		 279 aa  109  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.123141 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7779  putative UspA  37.85 
 
 		 242 aa  109  5e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0208146  normal  0.10666 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0708  hypothetical protein  31.65 
 
 		 279 aa  109  6e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.560113  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2431  universal stress protein family protein  31.65 
 
 		 279 aa  109  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0754  universal stress family protein  31.65 
 
 		 279 aa  109  6e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.576046  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1233  universal stress family protein  31.65 
 
 		 279 aa  109  6e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.705496  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1159  universal stress family protein  31.65 
 
 		 279 aa  109  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1719  universal stress family protein  31.65 
 
 		 279 aa  109  6e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0427  UspA domain-containing protein  34.62 
 
 		 271 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0185  hypothetical protein  37.44 
 
 		 279 aa  108  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.123321 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0578  UspA domain-containing protein  37.69 
 
 		 279 aa  107  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.1138  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0952  universal stress protein UspA  35 
 
 		 264 aa  107  3e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.511261  normal  0.862568 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3269  UspA domain-containing protein  40.38 
 
 		 271 aa  107  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.17581  normal  0.400144 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1452  UspA domain protein  38.5 
 
 		 282 aa  106  6e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2617  UspA domain-containing protein  33.97 
 
 		 271 aa  105  6e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2567  UspA domain-containing protein  31.95 
 
 		 270 aa  105  7e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.0044371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0409  UspA domain-containing protein  44.51 
 
 		 286 aa  105  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6131  UspA domain-containing protein  41.62 
 
 		 271 aa  105  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0487  ribosomal protein S1  27.72 
 
 		 283 aa  105  1e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.638126  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6312  UspA domain protein  32.88 
 
 		 281 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5579  UspA domain protein  30.94 
 
 		 278 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.961326 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4210  UspA domain-containing protein  40.56 
 
 		 280 aa  105  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1035  universal stress protein UspA  37.43 
 
 		 274 aa  104  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4566  UspA domain protein  36.98 
 
 		 279 aa  104  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.564371  normal  0.196949 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4433  UspA domain protein  36.98 
 
 		 279 aa  104  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0348  hypothetical protein  40.91 
 
 		 274 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00425417 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1568  universal stress protein family protein  32.23 
 
 		 278 aa  103  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.801358  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1300  UspA domain protein  35.29 
 
 		 278 aa  103  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.085168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5897  UspA domain-containing protein  30.2 
 
 		 279 aa  102  5e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.793802  normal  0.290079 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0097  UspA domain protein  33.76 
 
 		 271 aa  102  6e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4817  UspA domain protein  33.76 
 
 		 271 aa  102  6e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1733  UspA domain protein  39.2 
 
 		 276 aa  102  6e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.328326 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5581  UspA domain protein  34.36 
 
 		 276 aa  102  8e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.351015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6135  UspA domain protein  41.67 
 
 		 270 aa  101  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6175  UspA domain protein  40.88 
 
 		 280 aa  101  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2788  UspA domain protein  41.07 
 
 		 271 aa  101  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.084902  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3893  UspA domain protein  43.92 
 
 		 311 aa  100  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.531117  normal  0.217481 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1592  UspA domain protein  32.78 
 
 		 280 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.757336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0446  hypothetical protein  38.73 
 
 		 274 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.179985  normal  0.962231 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2238  hypothetical protein  38.89 
 
 		 280 aa  100  4e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.289135  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6199  UspA domain-containing protein  31.91 
 
 		 277 aa  99.8  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320687  normal  0.442079 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8718  UspA domain protein  45.14 
 
 		 280 aa  99.8  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3179  UspA domain-containing protein  43.06 
 
 		 279 aa  99.8  5e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.983564  normal  0.0746884 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1168  hypothetical protein  38.89 
 
 		 279 aa  99.4  6e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3508  UspA domain-containing protein  44.22 
 
 		 286 aa  99.4  6e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.364633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1935  hypothetical protein  41.62 
 
 		 272 aa  99  8e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.774934  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4282  UspA domain-containing protein  31.91 
 
 		 277 aa  99  8e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.132109 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3883  UspA domain protein  40.83 
 
 		 270 aa  99  8e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.29253  normal  0.0935727 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1852  hypothetical protein  30.27 
 
 		 275 aa  99  9e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0395  UspA domain-containing protein  32.26 
 
 		 270 aa  98.6  9e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.275124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0381  UspA domain protein  37.36 
 
 		 274 aa  98.6  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0466978  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3114  hypothetical protein  34.07 
 
 		 265 aa  98.6  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.936734  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0489  UspA domain-containing protein  38.15 
 
 		 272 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.382692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2231  hypothetical protein  31.27 
 
 		 278 aa  98.2  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3814  UspA domain-containing protein  31.58 
 
 		 277 aa  98.6  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.360617  normal  0.615146 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2454  UspA domain-containing protein  37.22 
 
 		 291 aa  98.6  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.821699  normal  0.675849 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1948  hypothetical protein  37.93 
 
 		 279 aa  97.4  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0423  UspA domain protein  38.66 
 
 		 271 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.892038  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3817  UspA domain-containing protein  31.54 
 
 		 279 aa  97.8  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16777  normal  0.520429 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3815  UspA domain protein  43.54 
 
 		 286 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.763121  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>