186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0828 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0828  UspA domain protein  100 
 
 		 277 aa  550  1e-156  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0482749 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3018  UspA domain-containing protein  61.73 
 
 		 277 aa  342  2.9999999999999997e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2101  UspA domain protein  44.44 
 
 		 287 aa  222  6e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal  0.400879 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2292  UspA domain-containing protein  44.1 
 
 		 287 aa  221  7e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0820685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1765  UspA domain-containing protein  44.1 
 
 		 315 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1529  UspA domain protein  44.44 
 
 		 287 aa  219  5e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.459492 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1664  UspA domain-containing protein  47.7 
 
 		 279 aa  218  7e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.483104  normal  0.685181 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1046  UspA domain protein  43.82 
 
 		 279 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.308422  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1314  UspA domain-containing protein  33.9 
 
 		 292 aa  135  5e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.624966  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2612  hypothetical protein  34.03 
 
 		 291 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.12045  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3129  UspA domain protein  31.51 
 
 		 294 aa  116  5e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.131964  normal  0.194874 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0742  UspA domain-containing protein  34.49 
 
 		 286 aa  113  3e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.861253 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1133  UspA domain-containing protein  30.48 
 
 		 279 aa  107  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0939  UspA domain-containing protein  32.07 
 
 		 287 aa  105  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.799371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0446  hypothetical protein  31.27 
 
 		 274 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.179985  normal  0.962231 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5229  UspA domain protein  34.36 
 
 		 271 aa  102  8e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.000806741  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0708  hypothetical protein  31.86 
 
 		 279 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.560113  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2431  universal stress protein family protein  31.86 
 
 		 279 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5815  UspA domain-containing protein  28.77 
 
 		 279 aa  101  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.123141 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0754  universal stress family protein  31.86 
 
 		 279 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.576046  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1233  universal stress family protein  31.86 
 
 		 279 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.705496  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1159  universal stress family protein  31.86 
 
 		 279 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1719  universal stress family protein  31.86 
 
 		 279 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2353  UspA domain-containing protein  37.84 
 
 		 276 aa  100  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366598  normal  0.604347 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1849  UspA domain-containing protein  35.1 
 
 		 277 aa  99.8  5e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5579  UspA domain protein  29.35 
 
 		 278 aa  99.4  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.961326 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1566  universal stress protein family protein  30.98 
 
 		 279 aa  99  7e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.57632  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1948  hypothetical protein  35.91 
 
 		 279 aa  98.2  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0348  hypothetical protein  39.6 
 
 		 274 aa  96.7  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00425417 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2248  hypothetical protein  35.29 
 
 		 277 aa  97.1  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7779  putative UspA  33.14 
 
 		 242 aa  97.1  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0208146  normal  0.10666 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1305  UspA domain protein  31.72 
 
 		 287 aa  96.3  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186426  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1143  hypothetical protein  36.36 
 
 		 276 aa  95.1  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3269  UspA domain-containing protein  39.64 
 
 		 271 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.17581  normal  0.400144 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0194  UspA domain-containing protein  32.45 
 
 		 270 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1983  UspA domain protein  32.95 
 
 		 273 aa  94.7  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0316321  normal  0.0164528 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2788  UspA domain protein  34.83 
 
 		 271 aa  93.2  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.084902  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0400  hypothetical protein  33.16 
 
 		 281 aa  92.8  5e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2619  UspA domain-containing protein  29.9 
 
 		 286 aa  92.8  6e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.794322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1605  UspA domain-containing protein  37.25 
 
 		 280 aa  92.4  7e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.591971  normal  0.475521 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1555  UspA domain protein  30.14 
 
 		 270 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0952  universal stress protein UspA  32.95 
 
 		 264 aa  91.3  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.511261  normal  0.862568 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2617  UspA domain-containing protein  29.3 
 
 		 271 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1355  UspA domain-containing protein  30.5 
 
 		 313 aa  92  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.574813 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0427  UspA domain-containing protein  28.91 
 
 		 271 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0395  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 270 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.275124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3114  hypothetical protein  32.77 
 
 		 265 aa  90.5  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.936734  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3885  UspA domain protein  34.09 
 
 		 271 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0886728  normal  0.0599221 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0079  UspA domain-containing protein  29.47 
 
 		 285 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.288519  normal  0.367855 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1854  hypothetical protein  28.82 
 
 		 278 aa  89.7  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.796292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0381  UspA domain protein  35.57 
 
 		 274 aa  89.7  5e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0466978  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6131  UspA domain-containing protein  29.69 
 
 		 271 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3817  UspA domain-containing protein  28.28 
 
 		 279 aa  88.2  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16777  normal  0.520429 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2567  UspA domain-containing protein  30.42 
 
 		 270 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.0044371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1733  UspA domain protein  35.15 
 
 		 276 aa  87.8  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.328326 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1926  hypothetical protein  27.82 
 
 		 277 aa  86.7  4e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.295242  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1452  UspA domain protein  34.34 
 
 		 282 aa  86.7  4e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6135  UspA domain protein  35.12 
 
 		 270 aa  86.7  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0185  hypothetical protein  32.39 
 
 		 279 aa  85.5  8e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.123321 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0697  universal stress protein  35.63 
 
 		 282 aa  85.5  8e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0430  UspA domain-containing protein  36.9 
 
 		 269 aa  85.5  8e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3584  hypothetical protein  34.52 
 
 		 278 aa  85.5  8e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2352  UspA domain-containing protein  35.63 
 
 		 282 aa  85.5  8e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.229476  normal  0.139893 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4520  Universal stress protein UspA family UspA14  29.27 
 
 		 274 aa  85.5  9e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0108751  decreased coverage  0.00456228 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0533  UspA domain-containing protein  35.06 
 
 		 282 aa  85.5  9e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.298494 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1142  hypothetical protein  35.11 
 
 		 279 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4282  UspA domain-containing protein  29.15 
 
 		 277 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.132109 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4518  universal stress protein UspA family  35.16 
 
 		 282 aa  84.3  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0105068  decreased coverage  0.00495689 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1339  hypothetical protein  31.66 
 
 		 280 aa  84  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.305203  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1366  hypothetical protein  26.2 
 
 		 277 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1300  UspA domain protein  35.8 
 
 		 278 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.085168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6175  UspA domain protein  31.17 
 
 		 280 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4285  UspA domain-containing protein  27.59 
 
 		 279 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.870275  normal  0.299211 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0423  UspA domain protein  34.88 
 
 		 271 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.892038  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4817  UspA domain protein  29.39 
 
 		 271 aa  83.2  0.000000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0097  UspA domain protein  29.39 
 
 		 271 aa  83.6  0.000000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4709  hypothetical protein  30.56 
 
 		 278 aa  82.8  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8718  UspA domain protein  31.17 
 
 		 280 aa  82.4  0.000000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6199  UspA domain-containing protein  28.81 
 
 		 277 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320687  normal  0.442079 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1568  universal stress protein family protein  27.55 
 
 		 278 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.801358  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0429  UspA domain-containing protein  33.73 
 
 		 295 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.760524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1345  hypothetical protein  30.94 
 
 		 277 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2238  hypothetical protein  34.19 
 
 		 280 aa  82  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.289135  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3814  UspA domain-containing protein  29.37 
 
 		 277 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.360617  normal  0.615146 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6312  UspA domain protein  28.33 
 
 		 281 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4210  UspA domain-containing protein  36.3 
 
 		 280 aa  81.3  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3435  putative UspA stress protein  32.76 
 
 		 278 aa  81.3  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.34254  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4566  UspA domain protein  32.2 
 
 		 279 aa  80.5  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.564371  normal  0.196949 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4724  UspA domain protein  32.04 
 
 		 277 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4433  UspA domain protein  32.2 
 
 		 279 aa  80.5  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4050  hypothetical protein  26.5 
 
 		 277 aa  79.7  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.946948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1135  UspA domain-containing protein  36.3 
 
 		 277 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6103  UspA domain-containing protein  36.16 
 
 		 271 aa  80.1  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0269268 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0706  hypothetical protein  33.7 
 
 		 278 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.566487  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2429  universal stress protein family protein  33.7 
 
 		 278 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1168  hypothetical protein  38.78 
 
 		 279 aa  79.3  0.00000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1231  universal stress family protein  33.7 
 
 		 279 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.709922  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1157  universal stress family protein  33.7 
 
 		 279 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2231  hypothetical protein  31.55 
 
 		 278 aa  79.3  0.00000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5581  UspA domain protein  27.49 
 
 		 276 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.351015  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>