167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0238 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0238  universal stress protein  100 
 
 		 283 aa  579  1e-164  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0954  universal stress protein  48.77 
 
 		 283 aa  280  2e-74  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0487  ribosomal protein S1  47.55 
 
 		 283 aa  272  4.0000000000000004e-72  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.638126  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1256  hypothetical protein  46.15 
 
 		 282 aa  249  4e-65  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0742  UspA domain-containing protein  27.34 
 
 		 286 aa  95.9  6e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.861253 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1314  UspA domain-containing protein  24.32 
 
 		 292 aa  95.1  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.624966  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1765  UspA domain-containing protein  26.44 
 
 		 315 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1529  UspA domain protein  26.1 
 
 		 287 aa  89  9e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.459492 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2101  UspA domain protein  24.75 
 
 		 287 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal  0.400879 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2612  hypothetical protein  24.81 
 
 		 291 aa  87.4  3e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.12045  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3129  UspA domain protein  24.05 
 
 		 294 aa  82.4  0.000000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.131964  normal  0.194874 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5581  UspA domain protein  31.38 
 
 		 276 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.351015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6175  UspA domain protein  33.78 
 
 		 280 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8718  UspA domain protein  33.11 
 
 		 280 aa  76.6  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1231  universal stress family protein  30.57 
 
 		 279 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.709922  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1157  universal stress family protein  30.57 
 
 		 279 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0706  hypothetical protein  30.57 
 
 		 278 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.566487  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2429  universal stress protein family protein  30.57 
 
 		 278 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4518  universal stress protein UspA family  26.17 
 
 		 282 aa  75.9  0.0000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0105068  decreased coverage  0.00495689 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4433  UspA domain protein  30.73 
 
 		 279 aa  75.9  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1605  UspA domain-containing protein  29.23 
 
 		 280 aa  75.9  0.0000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.591971  normal  0.475521 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4566  UspA domain protein  30.73 
 
 		 279 aa  75.9  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.564371  normal  0.196949 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2619  UspA domain-containing protein  24.49 
 
 		 286 aa  75.5  0.0000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.794322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3584  hypothetical protein  27.84 
 
 		 278 aa  75.1  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3571  UspA domain-containing protein  31.29 
 
 		 279 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.620295  normal  0.215578 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2305  UspA domain-containing protein  30.82 
 
 		 308 aa  74.3  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1135  UspA domain-containing protein  25.6 
 
 		 277 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2248  hypothetical protein  24.52 
 
 		 277 aa  73.2  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0939  UspA domain-containing protein  28.49 
 
 		 287 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.799371  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0185  hypothetical protein  29.47 
 
 		 279 aa  72.8  0.000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.123321 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0427  UspA domain-containing protein  24.41 
 
 		 271 aa  72.4  0.000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4937  UspA domain-containing protein  28.74 
 
 		 279 aa  72.4  0.000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.144949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1568  universal stress protein family protein  30.53 
 
 		 278 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.801358  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1046  UspA domain protein  24.48 
 
 		 279 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.308422  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0017  hypothetical protein  31.63 
 
 		 280 aa  71.6  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0334555  normal  0.756521 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2617  UspA domain-containing protein  25.41 
 
 		 271 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1168  hypothetical protein  28.86 
 
 		 279 aa  70.9  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3435  putative UspA stress protein  28.18 
 
 		 278 aa  71.2  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.34254  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1948  hypothetical protein  22.22 
 
 		 279 aa  70.9  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3814  UspA domain-containing protein  27.47 
 
 		 277 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.360617  normal  0.615146 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0429  UspA domain-containing protein  22.9 
 
 		 295 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.760524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6199  UspA domain-containing protein  29.89 
 
 		 277 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320687  normal  0.442079 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4282  UspA domain-containing protein  31.97 
 
 		 277 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.132109 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7779  putative UspA  27.12 
 
 		 242 aa  69.3  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0208146  normal  0.10666 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2292  UspA domain-containing protein  25.34 
 
 		 287 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0820685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3018  UspA domain-containing protein  27.75 
 
 		 277 aa  67.8  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1566  universal stress protein family protein  24.91 
 
 		 279 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.57632  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1854  hypothetical protein  24.15 
 
 		 278 aa  67  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.796292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5814  UspA domain-containing protein  28.38 
 
 		 278 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.128092 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0708  hypothetical protein  24.07 
 
 		 279 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.560113  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2431  universal stress protein family protein  24.07 
 
 		 279 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0754  universal stress family protein  24.07 
 
 		 279 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.576046  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1233  universal stress family protein  24.07 
 
 		 279 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.705496  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1159  universal stress family protein  24.07 
 
 		 279 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1719  universal stress family protein  24.07 
 
 		 279 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3179  UspA domain-containing protein  27.89 
 
 		 279 aa  66.2  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.983564  normal  0.0746884 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1024  universal stress protein UspA  27.33 
 
 		 279 aa  65.9  0.0000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3885  UspA domain protein  24.22 
 
 		 271 aa  65.9  0.0000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0886728  normal  0.0599221 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3269  UspA domain-containing protein  29.92 
 
 		 271 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.17581  normal  0.400144 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0079  UspA domain-containing protein  24.04 
 
 		 285 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.288519  normal  0.367855 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1664  UspA domain-containing protein  23.16 
 
 		 279 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.483104  normal  0.685181 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2788  UspA domain protein  28.08 
 
 		 271 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.084902  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2630  UspA domain-containing protein  25.41 
 
 		 272 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1142  hypothetical protein  29.41 
 
 		 279 aa  63.5  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5229  UspA domain protein  28.37 
 
 		 271 aa  63.5  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.000806741  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0348  hypothetical protein  25.85 
 
 		 274 aa  62.8  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00425417 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2238  hypothetical protein  24.24 
 
 		 280 aa  62.8  0.000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.289135  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0578  UspA domain-containing protein  29.12 
 
 		 279 aa  62.4  0.000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.1138  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3114  hypothetical protein  30.14 
 
 		 265 aa  62  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.936734  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2353  UspA domain-containing protein  28.42 
 
 		 276 aa  61.6  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366598  normal  0.604347 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5815  UspA domain-containing protein  27.72 
 
 		 279 aa  62  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.123141 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1143  hypothetical protein  23.29 
 
 		 276 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0446  hypothetical protein  24.69 
 
 		 274 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.179985  normal  0.962231 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4210  UspA domain-containing protein  26.7 
 
 		 280 aa  60.8  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0687  UspA domain protein  26.34 
 
 		 267 aa  60.5  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.354242  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4709  hypothetical protein  28.48 
 
 		 278 aa  60.1  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4520  Universal stress protein UspA family UspA14  27.06 
 
 		 274 aa  60.1  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0108751  decreased coverage  0.00456228 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1849  UspA domain-containing protein  25.97 
 
 		 277 aa  60.1  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6103  UspA domain-containing protein  32.65 
 
 		 271 aa  60.1  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0269268 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6131  UspA domain-containing protein  25.71 
 
 		 271 aa  60.1  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4215  UspA domain-containing protein  26.35 
 
 		 281 aa  59.7  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.322139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3893  UspA domain protein  25.51 
 
 		 311 aa  59.3  0.00000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.531117  normal  0.217481 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1732  hypothetical protein  22.84 
 
 		 284 aa  58.9  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0582534  normal  0.0358146 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2546  hypothetical protein  26.23 
 
 		 279 aa  58.9  0.00000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.109309  normal  0.809091 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0440  UspA domain-containing protein  22.7 
 
 		 272 aa  58.9  0.00000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.713184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1367  hypothetical protein  23.94 
 
 		 276 aa  58.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1852  hypothetical protein  27.75 
 
 		 275 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0952  universal stress protein UspA  28.28 
 
 		 264 aa  58.2  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.511261  normal  0.862568 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1133  UspA domain-containing protein  26.78 
 
 		 279 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1926  hypothetical protein  29.45 
 
 		 277 aa  58.2  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.295242  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1935  hypothetical protein  25.99 
 
 		 272 aa  58.2  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.774934  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1305  UspA domain protein  24.23 
 
 		 287 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186426  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1592  UspA domain protein  25.45 
 
 		 280 aa  57.4  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.757336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6135  UspA domain protein  25.87 
 
 		 270 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1300  UspA domain protein  25.34 
 
 		 278 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.085168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6312  UspA domain protein  22.64 
 
 		 281 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4744  hypothetical protein  26.32 
 
 		 276 aa  56.2  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3508  UspA domain-containing protein  27.08 
 
 		 286 aa  55.8  0.0000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.364633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3815  UspA domain protein  27.08 
 
 		 286 aa  55.8  0.0000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.763121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3817  UspA domain-containing protein  25.68 
 
 		 279 aa  55.5  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16777  normal  0.520429 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>