173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1910 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_1910  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 283 aa  574  1.0000000000000001e-163  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2720  UspA domain-containing protein  66.19 
 
 		 284 aa  374  1e-103  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.532159 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1166  UspA domain protein  46.29 
 
 		 283 aa  257  2e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00957514 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2763  hypothetical protein  45.36 
 
 		 285 aa  254  9e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.723641  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1227  UspA domain-containing protein  45.42 
 
 		 284 aa  243  3e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0187  UspA domain-containing protein  46.32 
 
 		 284 aa  242  5e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1994  UspA domain-containing protein  46.32 
 
 		 284 aa  242  5e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5171  UspA domain-containing protein  43.11 
 
 		 283 aa  240  2e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07090  universal stress protein, UspA  45.07 
 
 		 284 aa  238  1e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.540561  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1852  UspA domain-containing protein  43.11 
 
 		 283 aa  236  3e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.323758  hitchhiker  0.00188787 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0791  UspA domain-containing protein  43.66 
 
 		 285 aa  230  2e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0182  universal stress protein  39.58 
 
 		 281 aa  229  3e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1050  UspA domain protein  46.9 
 
 		 284 aa  227  2e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.192596  hitchhiker  0.000149596 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2101  UspA domain-containing protein  40.21 
 
 		 312 aa  226  3e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0781  hypothetical protein  40.91 
 
 		 283 aa  213  1.9999999999999998e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2562  universal stress protein  38.68 
 
 		 281 aa  212  3.9999999999999995e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.643339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0850  UspA domain-containing protein  37.85 
 
 		 284 aa  206  3e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.519772 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0944  UspA-related nucleotide-binding protein  40.64 
 
 		 283 aa  193  3e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0763002  normal  0.265915 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5068  Universal stress protein  36.46 
 
 		 284 aa  189  4e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1574  UspA domain protein  37.81 
 
 		 287 aa  186  3e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4471  universal stress protein UspA  37.81 
 
 		 287 aa  186  3e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000777431  hitchhiker  0.00999732 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4601  universal stress protein UspA  37.81 
 
 		 287 aa  186  3e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000321646  normal  0.0139056 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4142  UspA domain-containing protein  36.3 
 
 		 281 aa  177  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.976252 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3461  hypothetical protein  36.17 
 
 		 281 aa  176  3e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.148579 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1816  UspA domain-containing protein  36.4 
 
 		 288 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00317647  normal  0.851658 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1912  UspA domain protein  36.17 
 
 		 288 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4258  universal stress protein  35.59 
 
 		 281 aa  170  3e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0395352  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1137  UspA domain-containing protein  32.06 
 
 		 307 aa  164  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1226  hypothetical protein  31.1 
 
 		 287 aa  161  1e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.594173  normal  0.462548 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1154  hypothetical protein  30.14 
 
 		 286 aa  154  1e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2785  hypothetical protein  34.38 
 
 		 283 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.364827 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0260  UspA-related nucleotide-binding protein  26.5 
 
 		 278 aa  126  3e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0342  putative universal stress protein  25.26 
 
 		 286 aa  117  3e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0174  UspA domain-containing protein  28.52 
 
 		 286 aa  108  8.000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0137308  normal  0.254776 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2345  hypothetical protein  25.98 
 
 		 284 aa  104  1e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.450021 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2042  hypothetical protein  25.62 
 
 		 284 aa  102  5e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.845392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1359  UspA domain protein  25.17 
 
 		 281 aa  95.1  1e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1630  universal stress protein  20.49 
 
 		 278 aa  89.4  6e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0101  UspA domain protein  30.43 
 
 		 273 aa  72  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0032  UspA domain protein  23.94 
 
 		 279 aa  65.1  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1621  UspA domain protein  23.08 
 
 		 272 aa  61.6  0.00000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4709  hypothetical protein  31.05 
 
 		 278 aa  59.7  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2231  hypothetical protein  24.78 
 
 		 278 aa  53.5  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0884  UspA domain protein  25.42 
 
 		 310 aa  53.9  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.314663 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  28.89 
 
 		 147 aa  53.1  0.000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1893  UspA domain protein  29.92 
 
 		 136 aa  53.1  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.125519  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0348  hypothetical protein  24.68 
 
 		 274 aa  52.8  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00425417 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0381  UspA domain protein  24.83 
 
 		 274 aa  52.8  0.000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0466978  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2107  UspA domain-containing protein  24.34 
 
 		 291 aa  52.8  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  23.16 
 
 		 300 aa  52  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4724  UspA domain protein  24.5 
 
 		 277 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0952  universal stress protein UspA  25.68 
 
 		 264 aa  51.2  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.511261  normal  0.862568 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  25.33 
 
 		 297 aa  51.2  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2241  hypothetical protein  30.53 
 
 		 126 aa  50.4  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.499289 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1926  hypothetical protein  26.17 
 
 		 277 aa  50.8  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.295242  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30750  universal stress protein UspA-like protein  23.08 
 
 		 305 aa  50.4  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.537439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2248  hypothetical protein  30.87 
 
 		 277 aa  49.7  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  28.8 
 
 		 128 aa  50.1  0.00005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4566  UspA domain protein  26.73 
 
 		 279 aa  49.7  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.564371  normal  0.196949 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0446  hypothetical protein  27.14 
 
 		 274 aa  49.7  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.179985  normal  0.962231 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4433  UspA domain protein  26.73 
 
 		 279 aa  49.7  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  27.85 
 
 		 142 aa  49.3  0.00006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2897  UspA domain-containing protein  31.65 
 
 		 270 aa  49.7  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.185015  decreased coverage  0.00487068 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  23.53 
 
 		 153 aa  49.7  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1083  universal stress protein family  23.57 
 
 		 145 aa  49.3  0.00007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0571  hypothetical protein  31.79 
 
 		 259 aa  49.3  0.00007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1555  UspA domain protein  24.83 
 
 		 270 aa  49.3  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0959  UspA domain protein  32.89 
 
 		 144 aa  48.9  0.00009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.260464  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3813  UspA domain protein  24.48 
 
 		 283 aa  48.1  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1142  hypothetical protein  27.84 
 
 		 279 aa  48.9  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1269  UspA domain protein  25.29 
 
 		 275 aa  48.5  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0697  universal stress protein  30 
 
 		 282 aa  48.5  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4050  hypothetical protein  26.35 
 
 		 277 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.946948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3114  hypothetical protein  24.83 
 
 		 265 aa  48.5  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.936734  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3885  UspA domain protein  28.44 
 
 		 271 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0886728  normal  0.0599221 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1416  UspA domain protein  27.07 
 
 		 280 aa  48.9  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.700604  normal  0.217237 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2352  UspA domain-containing protein  30 
 
 		 282 aa  48.5  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.229476  normal  0.139893 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  27.13 
 
 		 290 aa  48.1  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1300  UspA domain protein  23.63 
 
 		 278 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.085168  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0776  UspA domain protein  22.81 
 
 		 308 aa  48.1  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8718  UspA domain protein  30.67 
 
 		 280 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0554  UspA domain-containing protein  28.25 
 
 		 265 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000788361 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2546  UspA domain protein  26.26 
 
 		 390 aa  47.8  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1111  UspA domain-containing protein  23.57 
 
 		 145 aa  47.8  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1355  UspA domain-containing protein  24.48 
 
 		 313 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.574813 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1135  UspA domain-containing protein  28.62 
 
 		 277 aa  47.4  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0427  UspA domain-containing protein  27.76 
 
 		 271 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  24.65 
 
 		 153 aa  47.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2617  UspA domain-containing protein  25.54 
 
 		 271 aa  47  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0943  UspA domain protein  30.43 
 
 		 151 aa  46.6  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0887098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3659  UspA domain-containing protein  23.51 
 
 		 293 aa  46.6  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0110  UspA domain-containing protein  26.43 
 
 		 140 aa  46.6  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0337  UspA domain protein  18.24 
 
 		 283 aa  46.2  0.0006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000175107  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3815  UspA domain protein  26.35 
 
 		 286 aa  46.2  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.763121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  21.68 
 
 		 151 aa  46.2  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1854  hypothetical protein  25.63 
 
 		 278 aa  45.8  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.796292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3457  UspA domain-containing protein  29.94 
 
 		 159 aa  46.2  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0098  UspA domain-containing protein  27.59 
 
 		 140 aa  45.8  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0148787  normal  0.288023 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1553  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  29.41 
 
 		 627 aa  45.8  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.656007 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5229  UspA domain protein  28.82 
 
 		 271 aa  45.8  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.000806741  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>