30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2241 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_2241  hypothetical protein  100 
 
 		 126 aa  246  7e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.499289 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2763  hypothetical protein  44.35 
 
 		 285 aa  87  9e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.723641  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2101  UspA domain-containing protein  46.81 
 
 		 312 aa  78.6  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0781  hypothetical protein  37.38 
 
 		 283 aa  77.4  0.00000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1912  UspA domain protein  42.55 
 
 		 288 aa  72  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0850  UspA domain-containing protein  37.04 
 
 		 284 aa  71.2  0.000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.519772 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1816  UspA domain-containing protein  42.55 
 
 		 288 aa  71.2  0.000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00317647  normal  0.851658 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1852  UspA domain-containing protein  32.56 
 
 		 283 aa  68.6  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.323758  hitchhiker  0.00188787 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1166  UspA domain protein  35.96 
 
 		 283 aa  68.2  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00957514 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0182  universal stress protein  36.46 
 
 		 281 aa  64.3  0.0000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5171  UspA domain-containing protein  32.99 
 
 		 283 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1050  UspA domain protein  39.05 
 
 		 284 aa  62.8  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.192596  hitchhiker  0.000149596 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2785  hypothetical protein  32.46 
 
 		 283 aa  61.2  0.000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.364827 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3461  hypothetical protein  31.78 
 
 		 281 aa  59.7  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.148579 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1227  UspA domain-containing protein  32.17 
 
 		 284 aa  60.1  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1574  UspA domain protein  37.23 
 
 		 287 aa  58.9  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0187  UspA domain-containing protein  33.04 
 
 		 284 aa  58.9  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1994  UspA domain-containing protein  33.04 
 
 		 284 aa  58.9  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4601  universal stress protein UspA  37.23 
 
 		 287 aa  58.9  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000321646  normal  0.0139056 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4471  universal stress protein UspA  37.23 
 
 		 287 aa  58.9  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000777431  hitchhiker  0.00999732 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0791  UspA domain-containing protein  32.63 
 
 		 285 aa  53.9  0.0000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5068  Universal stress protein  31.25 
 
 		 284 aa  53.5  0.0000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4258  universal stress protein  32.99 
 
 		 281 aa  52  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0395352  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0944  UspA-related nucleotide-binding protein  33.67 
 
 		 283 aa  52  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0763002  normal  0.265915 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2562  universal stress protein  30.48 
 
 		 281 aa  51.2  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.643339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4142  UspA domain-containing protein  34.02 
 
 		 281 aa  51.2  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.976252 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1910  UspA domain-containing protein  30.53 
 
 		 283 aa  50.4  0.000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07090  universal stress protein, UspA  33.68 
 
 		 284 aa  48.9  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.540561  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0342  putative universal stress protein  28.57 
 
 		 286 aa  48.1  0.00004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2720  UspA domain-containing protein  34.26 
 
 		 284 aa  45.8  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.532159 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>