105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1154 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1154  hypothetical protein  100 
 
 		 286 aa  584  1e-166  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1226  hypothetical protein  74.56 
 
 		 287 aa  437  9.999999999999999e-123  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.594173  normal  0.462548 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1137  UspA domain-containing protein  51.75 
 
 		 307 aa  271  1e-71  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1166  UspA domain protein  40.57 
 
 		 283 aa  212  5.999999999999999e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00957514 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1227  UspA domain-containing protein  38.52 
 
 		 284 aa  188  7e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0187  UspA domain-containing protein  38.38 
 
 		 284 aa  188  9e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1994  UspA domain-containing protein  38.38 
 
 		 284 aa  188  9e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5171  UspA domain-containing protein  39.79 
 
 		 283 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07090  universal stress protein, UspA  38.81 
 
 		 284 aa  183  2.0000000000000003e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.540561  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0182  universal stress protein  37.5 
 
 		 281 aa  182  7e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2763  hypothetical protein  36.4 
 
 		 285 aa  181  9.000000000000001e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.723641  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2101  UspA domain-containing protein  34.6 
 
 		 312 aa  176  5e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0791  UspA domain-containing protein  36.04 
 
 		 285 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2562  universal stress protein  37.63 
 
 		 281 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.643339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1852  UspA domain-containing protein  35.82 
 
 		 283 aa  172  3.9999999999999995e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.323758  hitchhiker  0.00188787 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1050  UspA domain protein  37.1 
 
 		 284 aa  170  2e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.192596  hitchhiker  0.000149596 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0944  UspA-related nucleotide-binding protein  38.65 
 
 		 283 aa  166  5.9999999999999996e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0763002  normal  0.265915 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2720  UspA domain-containing protein  34.98 
 
 		 284 aa  163  3e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.532159 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0781  hypothetical protein  34.75 
 
 		 283 aa  160  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4471  universal stress protein UspA  33.68 
 
 		 287 aa  157  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000777431  hitchhiker  0.00999732 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4601  universal stress protein UspA  33.68 
 
 		 287 aa  157  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000321646  normal  0.0139056 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1574  UspA domain protein  33.68 
 
 		 287 aa  157  2e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1910  UspA domain-containing protein  30.14 
 
 		 283 aa  154  1e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4142  UspA domain-containing protein  34.04 
 
 		 281 aa  154  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.976252 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0850  UspA domain-containing protein  32.51 
 
 		 284 aa  151  1e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.519772 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4258  universal stress protein  33.69 
 
 		 281 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0395352  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3461  hypothetical protein  32.86 
 
 		 281 aa  142  5e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.148579 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1912  UspA domain protein  30.24 
 
 		 288 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1816  UspA domain-containing protein  30.58 
 
 		 288 aa  140  3e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00317647  normal  0.851658 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5068  Universal stress protein  31.01 
 
 		 284 aa  134  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2785  hypothetical protein  34.26 
 
 		 283 aa  122  5e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.364827 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0342  putative universal stress protein  26.04 
 
 		 286 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2042  hypothetical protein  26.6 
 
 		 284 aa  105  8e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.845392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2345  hypothetical protein  26.95 
 
 		 284 aa  105  8e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.450021 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0174  UspA domain-containing protein  22.89 
 
 		 286 aa  95.5  9e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0137308  normal  0.254776 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0260  UspA-related nucleotide-binding protein  24.11 
 
 		 278 aa  95.1  1e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1359  UspA domain protein  24.83 
 
 		 281 aa  94.4  2e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0101  UspA domain protein  31.1 
 
 		 273 aa  77.8  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1630  universal stress protein  18.82 
 
 		 278 aa  64.3  0.000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  37.35 
 
 		 139 aa  58.5  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  26.78 
 
 		 300 aa  52  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4433  UspA domain protein  28.07 
 
 		 279 aa  51.6  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4566  UspA domain protein  28.07 
 
 		 279 aa  51.6  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.564371  normal  0.196949 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  35.09 
 
 		 164 aa  50.8  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1274  UspA domain-containing protein  38.78 
 
 		 145 aa  51.2  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.331528 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3943  UspA domain protein  30.12 
 
 		 148 aa  50.1  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  27.5 
 
 		 288 aa  48.9  0.00009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1083  UspA domain-containing protein  22.94 
 
 		 449 aa  47.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000280681  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1407  universal stress protein  36.84 
 
 		 161 aa  47.4  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.192272  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1300  UspA domain protein  24.26 
 
 		 278 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.085168  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0185  hypothetical protein  25.86 
 
 		 279 aa  47  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.123321 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3070  hypothetical protein  28.05 
 
 		 300 aa  46.6  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  25.77 
 
 		 304 aa  46.2  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0708  hypothetical protein  40.43 
 
 		 279 aa  45.8  0.0008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.560113  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2431  universal stress protein family protein  40.43 
 
 		 279 aa  45.8  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0754  universal stress family protein  40.43 
 
 		 279 aa  45.8  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.576046  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1233  universal stress family protein  40.43 
 
 		 279 aa  45.8  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.705496  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1159  universal stress family protein  40.43 
 
 		 279 aa  45.8  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1719  universal stress family protein  40.43 
 
 		 279 aa  45.8  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1566  universal stress protein family protein  40.43 
 
 		 279 aa  45.4  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.57632  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4050  hypothetical protein  27.4 
 
 		 277 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.946948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  32.14 
 
 		 144 aa  45.8  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0644  UspA domain-containing protein  40.82 
 
 		 145 aa  45.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.577691 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  31.65 
 
 		 140 aa  45.4  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0866  UspA domain protein  23.64 
 
 		 280 aa  45.4  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.111703  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  23.63 
 
 		 290 aa  45.1  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1024  universal stress protein UspA  26.49 
 
 		 279 aa  44.3  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1854  hypothetical protein  40 
 
 		 278 aa  45.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.796292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0674  UspA domain-containing protein  41.3 
 
 		 143 aa  45.1  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5897  UspA domain-containing protein  35.42 
 
 		 279 aa  44.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.793802  normal  0.290079 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2617  UspA domain-containing protein  27.54 
 
 		 271 aa  44.3  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5579  UspA domain protein  36.17 
 
 		 278 aa  44.3  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.961326 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6312  UspA domain protein  40 
 
 		 281 aa  44.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0381  UspA domain protein  27.22 
 
 		 274 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0466978  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1702  UspA domain protein  24.05 
 
 		 278 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2788  UspA domain protein  26.95 
 
 		 271 aa  44.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.084902  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  35.42 
 
 		 320 aa  44.7  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2792  UspA domain protein  26.21 
 
 		 144 aa  44.3  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1142  hypothetical protein  42.37 
 
 		 279 aa  43.9  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  30.36 
 
 		 150 aa  43.9  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3368  hypothetical protein  32.79 
 
 		 146 aa  43.9  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3817  UspA domain-containing protein  36.17 
 
 		 279 aa  43.9  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16777  normal  0.520429 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  32.14 
 
 		 141 aa  43.9  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2708  UspA domain-containing protein  32.1 
 
 		 277 aa  44.3  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0505017  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4285  UspA domain-containing protein  36.17 
 
 		 279 aa  43.9  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.870275  normal  0.299211 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1504  hypothetical protein  32.56 
 
 		 151 aa  43.5  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  33.93 
 
 		 156 aa  43.5  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  27.18 
 
 		 147 aa  43.5  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  26.02 
 
 		 156 aa  43.5  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1759  universal stress protein  23.13 
 
 		 298 aa  43.1  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2248  hypothetical protein  28.78 
 
 		 277 aa  43.1  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1331  UspA domain-containing protein  24.12 
 
 		 303 aa  43.1  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  36.84 
 
 		 148 aa  43.1  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1744  UspA domain protein  27.85 
 
 		 296 aa  43.1  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0826  universal stress protein  32.73 
 
 		 165 aa  42.7  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1249  hypothetical protein  30.56 
 
 		 154 aa  42.7  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.17939  normal  0.197708 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2353  UspA domain-containing protein  25.69 
 
 		 276 aa  42.7  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366598  normal  0.604347 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0833  UspA domain protein  38.3 
 
 		 169 aa  43.1  0.006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.139589  normal  0.670884 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2880  UspA domain-containing protein  26.25 
 
 		 271 aa  42.7  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  25 
 
 		 276 aa  42.7  0.008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>