More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1359 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1359  UspA domain protein  100 
 
 		 281 aa  560  1.0000000000000001e-159  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1621  UspA domain protein  32.39 
 
 		 272 aa  140  3e-32  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0101  UspA domain protein  29.07 
 
 		 273 aa  107  3e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0781  hypothetical protein  28.52 
 
 		 283 aa  106  4e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4142  UspA domain-containing protein  27.15 
 
 		 281 aa  101  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.976252 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0850  UspA domain-containing protein  25.87 
 
 		 284 aa  99  8e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.519772 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3461  hypothetical protein  28.52 
 
 		 281 aa  97.8  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.148579 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5068  Universal stress protein  25.96 
 
 		 284 aa  95.1  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4258  universal stress protein  26.39 
 
 		 281 aa  94.7  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0395352  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1910  UspA domain-containing protein  25.17 
 
 		 283 aa  95.1  1e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5171  UspA domain-containing protein  25.86 
 
 		 283 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1154  hypothetical protein  24.83 
 
 		 286 aa  94.4  2e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2763  hypothetical protein  24.66 
 
 		 285 aa  89.7  5e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.723641  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07090  universal stress protein, UspA  25.42 
 
 		 284 aa  87  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.540561  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1166  UspA domain protein  23.63 
 
 		 283 aa  86.7  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00957514 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0791  UspA domain-containing protein  24.32 
 
 		 285 aa  85.5  8e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1050  UspA domain protein  23.1 
 
 		 284 aa  85.5  9e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.192596  hitchhiker  0.000149596 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0944  UspA-related nucleotide-binding protein  26.48 
 
 		 283 aa  84.7  0.000000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0763002  normal  0.265915 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2101  UspA domain-containing protein  23 
 
 		 312 aa  84.3  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2720  UspA domain-containing protein  24.24 
 
 		 284 aa  82.4  0.000000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.532159 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0187  UspA domain-containing protein  23.88 
 
 		 284 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1994  UspA domain-containing protein  23.88 
 
 		 284 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0032  UspA domain protein  26.1 
 
 		 279 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0182  universal stress protein  24.91 
 
 		 281 aa  80.9  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1574  UspA domain protein  25.86 
 
 		 287 aa  80.5  0.00000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4471  universal stress protein UspA  25.86 
 
 		 287 aa  80.5  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000777431  hitchhiker  0.00999732 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4601  universal stress protein UspA  25.86 
 
 		 287 aa  80.5  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000321646  normal  0.0139056 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1226  hypothetical protein  20.27 
 
 		 287 aa  78.6  0.0000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.594173  normal  0.462548 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1852  UspA domain-containing protein  22.65 
 
 		 283 aa  77.4  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.323758  hitchhiker  0.00188787 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1137  UspA domain-containing protein  23.18 
 
 		 307 aa  78.2  0.0000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2785  hypothetical protein  26.92 
 
 		 283 aa  77.4  0.0000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.364827 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0342  putative universal stress protein  23.84 
 
 		 286 aa  76.6  0.0000000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2562  universal stress protein  25.17 
 
 		 281 aa  75.5  0.0000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.643339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1227  UspA domain-containing protein  23.63 
 
 		 284 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0260  UspA-related nucleotide-binding protein  26.22 
 
 		 278 aa  74.7  0.000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1630  universal stress protein  25.78 
 
 		 278 aa  70.5  0.00000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1702  UspA domain protein  24.3 
 
 		 278 aa  69.3  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0948  UspA domain-containing protein  26.4 
 
 		 290 aa  67  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00710468  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1581  UspA domain-containing protein  25.08 
 
 		 288 aa  66.6  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.582811 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  25.9 
 
 		 300 aa  66.2  0.0000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  24.34 
 
 		 415 aa  64.7  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0292  UspA domain protein  25.58 
 
 		 303 aa  64.3  0.000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.838221  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3659  UspA domain-containing protein  26.13 
 
 		 293 aa  64.3  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3238  universal stress protein  28.09 
 
 		 297 aa  63.9  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  27.98 
 
 		 320 aa  63.9  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1759  universal stress protein  25.33 
 
 		 298 aa  63.2  0.000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1986  UspA domain protein  23.68 
 
 		 317 aa  62.8  0.000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0690  universal stress protein family  28.57 
 
 		 140 aa  62.8  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0108874  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4648  universal stress protein family  27.86 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000011295  unclonable  2.43078e-26 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1912  UspA domain protein  22.73 
 
 		 288 aa  62.4  0.000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  32.21 
 
 		 145 aa  62.4  0.000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3447  UspA domain-containing protein  30.26 
 
 		 296 aa  62.4  0.000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728231  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0568  UspA domain-containing protein  28.57 
 
 		 140 aa  62  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1816  UspA domain-containing protein  22.73 
 
 		 288 aa  61.6  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00317647  normal  0.851658 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1412  hypothetical protein  26.25 
 
 		 305 aa  60.8  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.48566  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3813  UspA domain protein  25.42 
 
 		 283 aa  61.2  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0722  universal stress protein  27.14 
 
 		 140 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0566  universal stress protein  27.14 
 
 		 140 aa  60.5  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  32.81 
 
 		 128 aa  60.8  0.00000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0866  UspA domain protein  30.23 
 
 		 280 aa  60.5  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.111703  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  30.72 
 
 		 151 aa  60.5  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  31.54 
 
 		 145 aa  60.5  0.00000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2050  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  30.28 
 
 		 143 aa  60.5  0.00000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.450915  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  24.92 
 
 		 307 aa  60.5  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0776  UspA domain protein  23.4 
 
 		 308 aa  60.5  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0622  universal stress protein  27.14 
 
 		 140 aa  60.1  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0565  universal stress protein  27.14 
 
 		 140 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0783  universal stress protein family  27.14 
 
 		 140 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0654  universal stress protein  27.14 
 
 		 140 aa  60.1  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0711  universal stress protein family  27.14 
 
 		 140 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0445079 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  31.54 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  26.24 
 
 		 297 aa  59.7  0.00000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  28.19 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2190  UspA domain-containing protein  33.77 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30750  universal stress protein UspA-like protein  23.36 
 
 		 305 aa  59.3  0.00000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.537439  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1242  UspA domain protein  21.68 
 
 		 294 aa  59.3  0.00000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.683026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2564  UspA domain protein  26.3 
 
 		 282 aa  58.9  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.143275  normal  0.0151057 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1532  UspA domain-containing protein  23.08 
 
 		 289 aa  58.5  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0337  UspA domain protein  25.08 
 
 		 283 aa  58.5  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000175107  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  31.25 
 
 		 149 aa  58.2  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0174  UspA domain-containing protein  27.21 
 
 		 286 aa  57.8  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0137308  normal  0.254776 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3451  UspA domain-containing protein  24.03 
 
 		 293 aa  57.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4822  UspA domain-containing protein  25.17 
 
 		 289 aa  58.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4014  UspA domain protein  27.61 
 
 		 136 aa  58.2  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3452  UspA domain-containing protein  26.84 
 
 		 289 aa  57.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0884  UspA domain protein  26.2 
 
 		 310 aa  58.2  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.314663 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19610  universal stress protein UspA-like protein  23.03 
 
 		 306 aa  57  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.697757  normal  0.0279477 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  31.54 
 
 		 145 aa  57.4  0.0000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1135  universal stress protein  24.5 
 
 		 281 aa  56.2  0.0000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00245865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0400  universal stress family protein  22.87 
 
 		 341 aa  55.8  0.0000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0415  UspA domain protein  27.31 
 
 		 296 aa  55.8  0.0000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.189257 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2000  UspA domain protein  25.31 
 
 		 302 aa  55.8  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0511167  hitchhiker  0.00443199 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  30.86 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1891  UspA domain-containing protein  24.39 
 
 		 277 aa  55.5  0.0000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5362  UspA domain-containing protein  24.48 
 
 		 341 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4981  hypothetical protein  24.48 
 
 		 341 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196038  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5069  UspA domain-containing protein  24.48 
 
 		 341 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4992  UspA domain-containing protein  22.33 
 
 		 293 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.969556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2042  hypothetical protein  24.31 
 
 		 284 aa  54.7  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.845392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  27.73 
 
 		 281 aa  54.7  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>