More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_5069 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4981  hypothetical protein  100 
 
 
341 aa  689    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196038  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5069  UspA domain-containing protein  100 
 
 
341 aa  689    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5362  UspA domain-containing protein  99.12 
 
 
341 aa  682    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12063  hypothetical protein  50.51 
 
 
294 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1125  UspA domain-containing protein  48.15 
 
 
294 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1097  hypothetical protein  47.81 
 
 
294 aa  242  7.999999999999999e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1114  UspA domain-containing protein  47.81 
 
 
294 aa  242  7.999999999999999e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.98551 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12037  hypothetical protein  47.18 
 
 
295 aa  232  8.000000000000001e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4382  UspA domain-containing protein  46.86 
 
 
295 aa  224  2e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1415  UspA domain-containing protein  45.18 
 
 
295 aa  217  2e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.542243  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4992  UspA domain-containing protein  44.07 
 
 
293 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.969556  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1104  hypothetical protein  46.33 
 
 
295 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3411  hypothetical protein  47.12 
 
 
298 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.59136  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1121  UspA domain-containing protein  46.33 
 
 
295 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3474  UspA domain-containing protein  47.12 
 
 
298 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408629  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1133  UspA domain-containing protein  46.33 
 
 
295 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.292295  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3422  UspA domain-containing protein  47.12 
 
 
298 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.230237 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12642  hypothetical protein  42.37 
 
 
297 aa  211  2e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0713  UspA domain-containing protein  46.62 
 
 
294 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.247578 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0719  hypothetical protein  46.28 
 
 
294 aa  209  4e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0733  UspA domain-containing protein  46.28 
 
 
294 aa  209  4e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0946433 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1378  UspA domain-containing protein  45.24 
 
 
297 aa  207  3e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.406073 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1386  UspA domain-containing protein  43.24 
 
 
293 aa  205  8e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.65057 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1963  UspA domain-containing protein  44.7 
 
 
294 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351193  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1102  hypothetical protein  45.79 
 
 
292 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608802  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3621  hypothetical protein  43.24 
 
 
293 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.820337  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1119  UspA domain-containing protein  45.79 
 
 
292 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3694  UspA domain-containing protein  43.24 
 
 
293 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.34077  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3626  UspA domain-containing protein  42.91 
 
 
293 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208272  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1131  UspA domain-containing protein  45.45 
 
 
292 aa  197  3e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.849287  normal  0.887084 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1425  UspA domain-containing protein  40.77 
 
 
297 aa  187  3e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12028  hypothetical protein  39.13 
 
 
317 aa  176  6e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000248719  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4999  UspA domain-containing protein  45.95 
 
 
296 aa  166  4e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4978  UspA domain-containing protein  38.64 
 
 
293 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3451  UspA domain-containing protein  38.97 
 
 
293 aa  157  3e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4985  UspA domain-containing protein  39.32 
 
 
275 aa  155  8e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3659  UspA domain-containing protein  37.71 
 
 
293 aa  154  2.9999999999999998e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153996  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1402  UspA domain-containing protein  39.37 
 
 
275 aa  152  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1800  UspA domain protein  36.49 
 
 
347 aa  149  6e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0593055  normal  0.0659308 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4804  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  36.01 
 
 
299 aa  144  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1801  UspA domain protein  45.13 
 
 
373 aa  142  8e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00612057  normal  0.112863 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3658  UspA domain-containing protein  34.33 
 
 
296 aa  133  3.9999999999999996e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0641627  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1892  UspA domain-containing protein  36.05 
 
 
294 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.281928  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23130  universal stress protein UspA-like protein  34.45 
 
 
323 aa  130  2.0000000000000002e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.688964  normal  0.113593 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3475  UspA domain-containing protein  38.38 
 
 
291 aa  130  4.0000000000000003e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1806  UspA domain protein  39.47 
 
 
393 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0998568  normal  0.120471 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3905  UspA domain protein  38.16 
 
 
301 aa  125  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.166049  normal  0.0332237 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5439  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  38.97 
 
 
284 aa  125  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.132119 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4831  hypothetical protein  32.09 
 
 
292 aa  124  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.335515  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4681  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  39.86 
 
 
288 aa  123  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3447  UspA domain-containing protein  31.49 
 
 
296 aa  122  8e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728231  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5216  UspA domain-containing protein  36.12 
 
 
298 aa  122  9e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.366232  normal  0.453672 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3476  UspA domain-containing protein  31.8 
 
 
296 aa  122  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1145  UspA domain protein  36.16 
 
 
301 aa  122  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1111  UspA domain protein  35.08 
 
 
321 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213436  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4829  universal stress protein  38.68 
 
 
285 aa  120  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595112  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4807  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  32.65 
 
 
288 aa  120  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.839178 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1891  UspA domain-containing protein  34.27 
 
 
277 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1808  UspA domain protein  34 
 
 
304 aa  119  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00234923  normal  0.0693032 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1647  UspA domain-containing protein  36.32 
 
 
287 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0769263  normal  0.795067 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0884  UspA domain protein  36.52 
 
 
310 aa  117  3.9999999999999997e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.314663 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3433  UspA domain-containing protein  32.65 
 
 
289 aa  116  5e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.604274  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2042  UspA domain protein  34.38 
 
 
277 aa  116  5e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218244  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0776  UspA domain protein  34.97 
 
 
308 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30750  universal stress protein UspA-like protein  31.83 
 
 
305 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.537439  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06810  universal stress protein UspA-like protein  33.11 
 
 
322 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.715632  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22880  universal stress protein UspA-like protein  34.44 
 
 
303 aa  114  3e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.538505  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2000  UspA domain protein  35.47 
 
 
302 aa  114  3e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0511167  hitchhiker  0.00443199 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3526  hypothetical protein  32.75 
 
 
288 aa  113  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.369083  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1532  UspA domain-containing protein  29.77 
 
 
289 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4822  UspA domain-containing protein  32.88 
 
 
289 aa  110  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1581  UspA domain-containing protein  32.88 
 
 
288 aa  110  3e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.582811 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1986  UspA domain protein  31.06 
 
 
317 aa  109  6e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2388  UspA domain-containing protein  37.63 
 
 
293 aa  109  6e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1900  UspA domain-containing protein  34.04 
 
 
277 aa  107  3e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0128633  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4870  UspA domain-containing protein  33.78 
 
 
276 aa  106  5e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2043  UspA domain protein  33.56 
 
 
291 aa  105  9e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000173989  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5184  UspA domain protein  35.59 
 
 
299 aa  105  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01830  universal stress protein UspA-like protein  36.03 
 
 
324 aa  105  1e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22920  universal stress protein UspA-like protein  40.2 
 
 
315 aa  104  3e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.27256  normal  0.365267 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3452  UspA domain-containing protein  32.07 
 
 
289 aa  103  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0948  UspA domain-containing protein  29.47 
 
 
290 aa  103  5e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00710468  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0328  hypothetical protein  34.72 
 
 
298 aa  102  7e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0338  UspA domain-containing protein  34.72 
 
 
298 aa  102  7e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.23658 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22890  universal stress protein UspA-like protein  30.59 
 
 
300 aa  102  8e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.599041  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1934  UspA domain protein  33.11 
 
 
274 aa  102  9e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.235053  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1479  UspA domain protein  36.05 
 
 
286 aa  101  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0352418  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4842  hypothetical protein  36.61 
 
 
229 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0317  UspA domain-containing protein  34.2 
 
 
298 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2760  hypothetical protein  34.54 
 
 
339 aa  100  4e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1901  UspA domain-containing protein  36.16 
 
 
295 aa  99.8  6e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184723  normal  0.100414 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0989  UspA domain-containing protein  30.77 
 
 
300 aa  99.8  6e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2334  UspA domain-containing protein  31.83 
 
 
290 aa  99.8  7e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3036  hypothetical protein  34.56 
 
 
296 aa  97.8  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.456769  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0292  UspA domain protein  30.79 
 
 
303 aa  98.2  2e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.838221  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08260  universal stress protein UspA-like protein  28.9 
 
 
309 aa  97.8  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.144181  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3533  UspA domain protein  28.92 
 
 
287 aa  98.2  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2526  UspA domain-containing protein  42.25 
 
 
296 aa  97.4  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2416  UspA domain protein  31.86 
 
 
277 aa  97.4  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000209099  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1787  universal stress protein  28.31 
 
 
345 aa  97.4  3e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>