More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0032 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0032  UspA domain protein  100 
 
 		 279 aa  559  1e-158  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1702  UspA domain protein  32.52 
 
 		 278 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0260  UspA-related nucleotide-binding protein  25.89 
 
 		 278 aa  83.6  0.000000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0101  UspA domain protein  28.32 
 
 		 273 aa  82.8  0.000000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1359  UspA domain protein  26.1 
 
 		 281 aa  81.3  0.00000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0850  UspA domain-containing protein  31.14 
 
 		 284 aa  80.9  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.519772 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5068  Universal stress protein  28.31 
 
 		 284 aa  76.3  0.0000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3461  hypothetical protein  25.86 
 
 		 281 aa  73.9  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.148579 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4142  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 281 aa  73.2  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.976252 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1133  UspA domain-containing protein  28.52 
 
 		 279 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0781  hypothetical protein  25.1 
 
 		 283 aa  71.6  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4258  universal stress protein  33.93 
 
 		 281 aa  70.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0395352  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0791  UspA domain-containing protein  29.34 
 
 		 285 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0187  UspA domain-containing protein  26.87 
 
 		 284 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1227  UspA domain-containing protein  30.49 
 
 		 284 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1994  UspA domain-containing protein  26.87 
 
 		 284 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2248  hypothetical protein  27.75 
 
 		 277 aa  70.1  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2720  UspA domain-containing protein  30.17 
 
 		 284 aa  70.5  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.532159 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3584  hypothetical protein  27.67 
 
 		 278 aa  70.1  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1621  UspA domain protein  23.16 
 
 		 272 aa  67.4  0.0000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2612  hypothetical protein  29.55 
 
 		 291 aa  67.8  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.12045  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0427  UspA domain-containing protein  27.87 
 
 		 271 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4744  hypothetical protein  26.28 
 
 		 276 aa  67.4  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0944  UspA-related nucleotide-binding protein  29.05 
 
 		 283 aa  66.6  0.0000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0763002  normal  0.265915 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2107  UspA domain-containing protein  29.28 
 
 		 291 aa  66.2  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1574  UspA domain protein  25.69 
 
 		 287 aa  66.2  0.0000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4471  universal stress protein UspA  25.69 
 
 		 287 aa  66.2  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000777431  hitchhiker  0.00999732 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4601  universal stress protein UspA  25.69 
 
 		 287 aa  66.2  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000321646  normal  0.0139056 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07090  universal stress protein, UspA  26.76 
 
 		 284 aa  65.9  0.0000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.540561  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0952  universal stress protein UspA  25.44 
 
 		 264 aa  65.9  0.0000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.511261  normal  0.862568 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1910  UspA domain-containing protein  23.94 
 
 		 283 aa  65.1  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0342  putative universal stress protein  26.83 
 
 		 286 aa  65.1  0.000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3238  universal stress protein  35.66 
 
 		 297 aa  64.7  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1555  UspA domain protein  29.37 
 
 		 270 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1630  universal stress protein  21.72 
 
 		 278 aa  64.3  0.000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1355  UspA domain-containing protein  27.74 
 
 		 313 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.574813 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2617  UspA domain-containing protein  27.87 
 
 		 271 aa  62.8  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5171  UspA domain-containing protein  25.53 
 
 		 283 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0266  UspA domain-containing protein  28.1 
 
 		 260 aa  62  0.000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.194417  normal  0.123671 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0194  UspA domain-containing protein  27.97 
 
 		 270 aa  62  0.000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1142  hypothetical protein  25.95 
 
 		 279 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1050  UspA domain protein  28.07 
 
 		 284 aa  61.6  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.192596  hitchhiker  0.000149596 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2880  UspA domain-containing protein  28.67 
 
 		 271 aa  62  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2353  UspA domain-containing protein  28.47 
 
 		 276 aa  60.8  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366598  normal  0.604347 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2788  UspA domain protein  26.71 
 
 		 271 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.084902  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2763  hypothetical protein  28.66 
 
 		 285 aa  60.8  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.723641  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1605  UspA domain-containing protein  31.07 
 
 		 280 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.591971  normal  0.475521 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3814  UspA domain-containing protein  26.9 
 
 		 277 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.360617  normal  0.615146 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4282  UspA domain-containing protein  26.55 
 
 		 277 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.132109 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6199  UspA domain-containing protein  26.55 
 
 		 277 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320687  normal  0.442079 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0489  UspA domain-containing protein  28.23 
 
 		 272 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.382692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0253  UspA domain-containing protein  28.79 
 
 		 130 aa  60.5  0.00000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.157205 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0185  hypothetical protein  27.57 
 
 		 279 aa  60.1  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.123321 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1852  UspA domain-containing protein  29.49 
 
 		 283 aa  60.1  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.323758  hitchhiker  0.00188787 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0182  universal stress protein  24.66 
 
 		 281 aa  60.1  0.00000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1300  UspA domain protein  27.21 
 
 		 278 aa  59.7  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.085168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2562  universal stress protein  27.22 
 
 		 281 aa  59.7  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.643339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4937  UspA domain-containing protein  24.83 
 
 		 279 aa  59.3  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.144949  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4566  UspA domain protein  29.02 
 
 		 279 aa  59.3  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.564371  normal  0.196949 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4050  hypothetical protein  23.61 
 
 		 277 aa  59.3  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.946948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4433  UspA domain protein  29.02 
 
 		 279 aa  59.3  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6175  UspA domain protein  27.94 
 
 		 280 aa  59.3  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  30.4 
 
 		 128 aa  59.3  0.00000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2220  UspA domain-containing protein  25.35 
 
 		 277 aa  58.5  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5815  UspA domain-containing protein  25.69 
 
 		 279 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.123141 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1226  hypothetical protein  24.14 
 
 		 287 aa  58.9  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.594173  normal  0.462548 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8718  UspA domain protein  29.63 
 
 		 280 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1366  hypothetical protein  25.17 
 
 		 277 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1679  hypothetical protein  31.43 
 
 		 269 aa  57.8  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0785159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2785  hypothetical protein  27.81 
 
 		 283 aa  57.8  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.364827 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2101  UspA domain-containing protein  23.67 
 
 		 312 aa  57.8  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2109  UspA domain-containing protein  28.23 
 
 		 128 aa  57.4  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1168  hypothetical protein  26.8 
 
 		 279 aa  57  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1256  hypothetical protein  22.39 
 
 		 282 aa  57  0.0000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0706  hypothetical protein  26.1 
 
 		 278 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.566487  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2429  universal stress protein family protein  26.1 
 
 		 278 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3571  UspA domain-containing protein  29.05 
 
 		 279 aa  57  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.620295  normal  0.215578 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1157  universal stress family protein  26.1 
 
 		 279 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1231  universal stress family protein  26.1 
 
 		 279 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.709922  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1732  hypothetical protein  26.47 
 
 		 284 aa  56.2  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0582534  normal  0.0358146 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1816  UspA domain-containing protein  31.33 
 
 		 288 aa  56.2  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00317647  normal  0.851658 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1166  UspA domain protein  25.15 
 
 		 283 aa  55.8  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00957514 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1912  UspA domain protein  31.33 
 
 		 288 aa  55.8  0.0000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3114  hypothetical protein  23.16 
 
 		 265 aa  55.5  0.0000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.936734  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0923  UspA domain protein  27.69 
 
 		 130 aa  55.5  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.840316  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1017  UspA domain-containing protein  28.15 
 
 		 138 aa  54.7  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0550941 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2454  UspA domain-containing protein  28.93 
 
 		 291 aa  55.5  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.821699  normal  0.675849 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5581  UspA domain protein  26.9 
 
 		 276 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.351015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0097  UspA domain protein  30 
 
 		 271 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4210  UspA domain-containing protein  28.35 
 
 		 280 aa  54.3  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1592  UspA domain protein  33.33 
 
 		 280 aa  54.7  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.757336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4817  UspA domain protein  30 
 
 		 271 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3718  UspA domain protein  27.35 
 
 		 278 aa  54.3  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2231  hypothetical protein  28.74 
 
 		 278 aa  54.7  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1983  UspA domain protein  33.07 
 
 		 273 aa  54.3  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0316321  normal  0.0164528 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1143  hypothetical protein  26.6 
 
 		 276 aa  53.9  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1416  UspA domain protein  32.54 
 
 		 280 aa  53.5  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.700604  normal  0.217237 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3435  putative UspA stress protein  23.65 
 
 		 278 aa  53.9  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.34254  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  32.28 
 
 		 281 aa  53.9  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1948  hypothetical protein  23.61 
 
 		 279 aa  53.9  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>