More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0781 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_0781  hypothetical protein  100 
 
 		 283 aa  565  1e-160  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0850  UspA domain-containing protein  53.17 
 
 		 284 aa  288  9e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.519772 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5068  Universal stress protein  50.7 
 
 		 284 aa  283  3.0000000000000004e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4142  UspA domain-containing protein  48.75 
 
 		 281 aa  258  1e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.976252 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3461  hypothetical protein  49.11 
 
 		 281 aa  255  6e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.148579 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4258  universal stress protein  47.69 
 
 		 281 aa  248  8e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0395352  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2763  hypothetical protein  44.68 
 
 		 285 aa  247  1e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.723641  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2720  UspA domain-containing protein  44.72 
 
 		 284 aa  224  1e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.532159 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1910  UspA domain-containing protein  40.91 
 
 		 283 aa  213  1.9999999999999998e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2785  hypothetical protein  44.56 
 
 		 283 aa  206  3e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.364827 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1166  UspA domain protein  40.21 
 
 		 283 aa  205  6e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00957514 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1852  UspA domain-containing protein  36.75 
 
 		 283 aa  196  5.000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.323758  hitchhiker  0.00188787 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4471  universal stress protein UspA  39.01 
 
 		 287 aa  193  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000777431  hitchhiker  0.00999732 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4601  universal stress protein UspA  39.01 
 
 		 287 aa  193  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000321646  normal  0.0139056 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1574  UspA domain protein  39.01 
 
 		 287 aa  193  3e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0791  UspA domain-containing protein  37.32 
 
 		 285 aa  191  1e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1227  UspA domain-containing protein  38.03 
 
 		 284 aa  187  2e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5171  UspA domain-containing protein  37.46 
 
 		 283 aa  185  7e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0187  UspA domain-containing protein  36.62 
 
 		 284 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0182  universal stress protein  36.49 
 
 		 281 aa  182  4.0000000000000006e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1994  UspA domain-containing protein  36.62 
 
 		 284 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2101  UspA domain-containing protein  33.81 
 
 		 312 aa  182  5.0000000000000004e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1912  UspA domain protein  37.1 
 
 		 288 aa  170  2e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0944  UspA-related nucleotide-binding protein  37.76 
 
 		 283 aa  170  3e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0763002  normal  0.265915 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1816  UspA domain-containing protein  37.46 
 
 		 288 aa  169  3e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00317647  normal  0.851658 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1050  UspA domain protein  36.81 
 
 		 284 aa  167  2e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.192596  hitchhiker  0.000149596 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1154  hypothetical protein  34.75 
 
 		 286 aa  160  2e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07090  universal stress protein, UspA  35.92 
 
 		 284 aa  155  9e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.540561  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1137  UspA domain-containing protein  35.76 
 
 		 307 aa  150  2e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1226  hypothetical protein  31.8 
 
 		 287 aa  149  4e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.594173  normal  0.462548 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2562  universal stress protein  32.87 
 
 		 281 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.643339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0342  putative universal stress protein  29.72 
 
 		 286 aa  144  2e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1359  UspA domain protein  28.52 
 
 		 281 aa  106  4e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0260  UspA-related nucleotide-binding protein  24.82 
 
 		 278 aa  92.8  6e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0101  UspA domain protein  30.64 
 
 		 273 aa  89  7e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0174  UspA domain-containing protein  24.48 
 
 		 286 aa  87.4  2e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0137308  normal  0.254776 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2042  hypothetical protein  23.49 
 
 		 284 aa  86.7  4e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.845392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2345  hypothetical protein  23.13 
 
 		 284 aa  85.5  9e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.450021 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2241  hypothetical protein  37.38 
 
 		 126 aa  77.4  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.499289 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1630  universal stress protein  21.15 
 
 		 278 aa  75.1  0.000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3626  UspA domain-containing protein  27.9 
 
 		 293 aa  73.2  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3621  hypothetical protein  27.47 
 
 		 293 aa  72.4  0.000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.820337  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3694  UspA domain-containing protein  27.47 
 
 		 293 aa  72.4  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.34077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0032  UspA domain protein  25.1 
 
 		 279 aa  71.6  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1143  hypothetical protein  31.84 
 
 		 276 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0185  hypothetical protein  31.15 
 
 		 279 aa  67.4  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.123321 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4433  UspA domain protein  28.64 
 
 		 279 aa  65.9  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4566  UspA domain protein  28.64 
 
 		 279 aa  65.9  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.564371  normal  0.196949 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1135  UspA domain-containing protein  28.41 
 
 		 277 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1854  hypothetical protein  35.76 
 
 		 278 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.796292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  29.26 
 
 		 288 aa  63.5  0.000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4744  hypothetical protein  30.82 
 
 		 276 aa  62.8  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  33.59 
 
 		 128 aa  62.4  0.000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1641  UspA domain-containing protein  30.93 
 
 		 294 aa  62.4  0.000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6312  UspA domain protein  34.67 
 
 		 281 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0337  UspA domain protein  24.09 
 
 		 283 aa  62  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000175107  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3238  universal stress protein  26.18 
 
 		 297 aa  61.6  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  25.96 
 
 		 300 aa  61.6  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4285  UspA domain-containing protein  32.05 
 
 		 279 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.870275  normal  0.299211 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1133  UspA domain-containing protein  35.53 
 
 		 279 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3584  hypothetical protein  26.17 
 
 		 278 aa  60.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3817  UspA domain-containing protein  36.18 
 
 		 279 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16777  normal  0.520429 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  26.24 
 
 		 286 aa  60.1  0.00000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  29.2 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4050  hypothetical protein  33.78 
 
 		 277 aa  59.3  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.946948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2305  UspA domain-containing protein  30.43 
 
 		 308 aa  59.3  0.00000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2454  UspA domain-containing protein  34.21 
 
 		 291 aa  58.9  0.00000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.821699  normal  0.675849 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5815  UspA domain-containing protein  31.4 
 
 		 279 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.123141 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1566  universal stress protein family protein  33.33 
 
 		 279 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.57632  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3112  UspA domain-containing protein  28.5 
 
 		 290 aa  58.9  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.615607  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1355  UspA domain-containing protein  28.57 
 
 		 313 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.574813 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  25.29 
 
 		 290 aa  58.2  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3885  UspA domain protein  29.17 
 
 		 271 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0886728  normal  0.0599221 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4520  Universal stress protein UspA family UspA14  32.89 
 
 		 274 aa  57.8  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0108751  decreased coverage  0.00456228 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0612  UspA domain-containing protein  27.78 
 
 		 287 aa  57.4  0.0000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0708  hypothetical protein  30.19 
 
 		 279 aa  57  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.560113  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2431  universal stress protein family protein  30.19 
 
 		 279 aa  57  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3035  UspA domain-containing protein  31.25 
 
 		 278 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.415696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1719  universal stress family protein  30.19 
 
 		 279 aa  57  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1300  UspA domain protein  27 
 
 		 278 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.085168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2109  UspA domain-containing protein  32.56 
 
 		 128 aa  57.4  0.0000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2248  hypothetical protein  36.36 
 
 		 277 aa  57.4  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0754  universal stress family protein  30.19 
 
 		 279 aa  57  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.576046  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1233  universal stress family protein  30.19 
 
 		 279 aa  57  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.705496  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1159  universal stress family protein  30.19 
 
 		 279 aa  57  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1555  UspA domain protein  28.44 
 
 		 270 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2231  hypothetical protein  34.13 
 
 		 278 aa  56.6  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  27.96 
 
 		 281 aa  56.6  0.0000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0776  UspA domain protein  29.53 
 
 		 570 aa  57  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  30.24 
 
 		 283 aa  56.2  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3700  hypothetical protein  28.78 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.84186  normal  0.539513 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0939  UspA domain-containing protein  28.72 
 
 		 287 aa  56.2  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.799371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1744  UspA domain protein  30.22 
 
 		 296 aa  55.8  0.0000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3813  UspA domain protein  30.16 
 
 		 283 aa  55.8  0.0000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5897  UspA domain-containing protein  32.69 
 
 		 279 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.793802  normal  0.290079 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4709  hypothetical protein  30.1 
 
 		 278 aa  55.5  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0489  UspA domain-containing protein  29.17 
 
 		 272 aa  55.5  0.0000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.382692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1024  universal stress protein UspA  36.07 
 
 		 279 aa  55.1  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  26.43 
 
 		 141 aa  55.1  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4724  UspA domain protein  30.61 
 
 		 277 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>