More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_2339 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 128 aa  249  8.000000000000001e-66  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2109  UspA domain-containing protein  75.78 
 
 		 128 aa  178  2e-44  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  41.43 
 
 		 139 aa  97.1  7e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  39.33 
 
 		 141 aa  96.3  1e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  44.14 
 
 		 144 aa  96.7  1e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  37.41 
 
 		 139 aa  94.4  5e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  37.32 
 
 		 150 aa  93.2  1e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  40.29 
 
 		 138 aa  91.7  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  40.54 
 
 		 140 aa  91.7  3e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  37.76 
 
 		 143 aa  89.7  1e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  38.06 
 
 		 208 aa  89.4  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1017  UspA domain-containing protein  37.86 
 
 		 138 aa  87.8  5e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0550941 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  36.36 
 
 		 150 aa  87  8e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  39.44 
 
 		 180 aa  87  8e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  34.72 
 
 		 151 aa  85.5  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  38.57 
 
 		 307 aa  85.5  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0568  UspA domain-containing protein  35.71 
 
 		 140 aa  84.3  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  40.58 
 
 		 138 aa  84  7e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0690  universal stress protein family  35 
 
 		 140 aa  84  7e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0108874  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  36.49 
 
 		 156 aa  83.6  8e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1933  UspA domain-containing protein  40.14 
 
 		 141 aa  83.6  9e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4648  universal stress protein family  34.29 
 
 		 140 aa  83.6  9e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000011295  unclonable  2.43078e-26 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0566  universal stress protein  33.57 
 
 		 140 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  39.86 
 
 		 142 aa  83.2  0.000000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0722  universal stress protein  34.29 
 
 		 140 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0622  universal stress protein  33.57 
 
 		 140 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2199  universal stress protein  35.71 
 
 		 139 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0565  universal stress protein  33.57 
 
 		 140 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0711  universal stress protein family  33.57 
 
 		 140 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0445079 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0654  universal stress protein  33.57 
 
 		 140 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0783  universal stress protein family  33.57 
 
 		 140 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  37.86 
 
 		 147 aa  81.6  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  39.71 
 
 		 151 aa  81.3  0.000000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  37.76 
 
 		 143 aa  81.3  0.000000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  37.16 
 
 		 155 aa  80.9  0.000000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1274  UspA domain-containing protein  34.04 
 
 		 145 aa  80.9  0.000000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.331528 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  36.11 
 
 		 148 aa  81.3  0.000000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  33.08 
 
 		 207 aa  80.9  0.000000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  39.01 
 
 		 137 aa  80.9  0.000000000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  33.8 
 
 		 150 aa  80.5  0.000000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0253  UspA domain-containing protein  36.64 
 
 		 130 aa  80.1  0.000000000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.157205 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0337  UspA domain-containing protein  39.01 
 
 		 137 aa  80.1  0.00000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1858  UspA domain protein  35.92 
 
 		 147 aa  79.7  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  37.68 
 
 		 290 aa  79.7  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1529  UspA domain protein  37.41 
 
 		 141 aa  79  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3238  universal stress protein  40.16 
 
 		 297 aa  79  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  35.51 
 
 		 147 aa  79  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  36.88 
 
 		 148 aa  78.6  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  37.68 
 
 		 138 aa  79  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4616  UspA domain protein  32.39 
 
 		 141 aa  78.2  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2198  hypothetical protein  39.31 
 
 		 145 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.76051  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4356  UspA domain-containing protein  36.84 
 
 		 145 aa  78.2  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244024  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  34.69 
 
 		 145 aa  77.8  0.00000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  32.43 
 
 		 157 aa  78.2  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3459  hypothetical protein  39.31 
 
 		 145 aa  77.8  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.450632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0081  UspA domain protein  34.03 
 
 		 143 aa  78.2  0.00000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324283  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2821  hypothetical protein  37.93 
 
 		 149 aa  77.8  0.00000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.253372  normal  0.0804711 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1659  UspA domain protein  33.79 
 
 		 147 aa  77.4  0.00000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.452952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  34.53 
 
 		 286 aa  77.4  0.00000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3338  UspA domain-containing protein  36.81 
 
 		 144 aa  77.4  0.00000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1230  UspA domain-containing protein  36.17 
 
 		 137 aa  77.4  0.00000000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  35.46 
 
 		 159 aa  77  0.00000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2637  hypothetical protein  33.33 
 
 		 144 aa  77  0.00000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.163827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  32.86 
 
 		 149 aa  76.6  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  36.62 
 
 		 148 aa  76.6  0.0000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  35 
 
 		 148 aa  76.3  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4348  UspA domain protein  35 
 
 		 149 aa  76.3  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0947911  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0644  UspA domain-containing protein  39.73 
 
 		 145 aa  76.3  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.577691 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0923  UspA domain protein  34.62 
 
 		 130 aa  75.5  0.0000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.840316  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4745  hypothetical protein  36.73 
 
 		 151 aa  75.5  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.829975  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  37.32 
 
 		 162 aa  75.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  32.37 
 
 		 288 aa  75.5  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  36.69 
 
 		 153 aa  76.3  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2050  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  30.71 
 
 		 143 aa  75.9  0.0000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.450915  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  41.41 
 
 		 281 aa  75.5  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  36.49 
 
 		 153 aa  75.1  0.0000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1677  hypothetical protein  34.75 
 
 		 146 aa  75.1  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.884231 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  34.27 
 
 		 145 aa  75.1  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0624  UspA domain-containing protein  34.53 
 
 		 139 aa  75.1  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0804  UspA domain protein  39.42 
 
 		 138 aa  75.5  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.380791 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2742  hypothetical protein  38.26 
 
 		 157 aa  74.7  0.0000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1519  UspA domain-containing protein  35.62 
 
 		 148 aa  74.7  0.0000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0716802  normal  0.348047 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1489  UspA domain-containing protein  37.23 
 
 		 137 aa  74.7  0.0000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.854212 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0550  UspA domain-containing protein  38.57 
 
 		 140 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2611  hypothetical protein  38.46 
 
 		 152 aa  74.3  0.0000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1272  UspA domain-containing protein  37.24 
 
 		 145 aa  74.3  0.0000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1311  UspA domain protein  34.69 
 
 		 187 aa  74.3  0.0000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.519886  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  37.32 
 
 		 153 aa  73.9  0.0000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2084  UspA domain protein  32.09 
 
 		 140 aa  73.9  0.0000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0228  UspA domain protein  34.03 
 
 		 144 aa  73.9  0.0000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.115538 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  38.3 
 
 		 156 aa  73.9  0.0000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3813  UspA domain protein  39.84 
 
 		 283 aa  73.9  0.0000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0384  UspA domain protein  34.27 
 
 		 142 aa  73.9  0.0000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150335  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0943  UspA domain protein  36.55 
 
 		 151 aa  73.6  0.0000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0887098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  34.27 
 
 		 145 aa  73.6  0.0000000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1803  UspA domain protein  37.76 
 
 		 143 aa  73.6  0.0000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  33.33 
 
 		 164 aa  73.2  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1862  UspA domain protein  35.66 
 
 		 141 aa  73.2  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0496809 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1083  universal stress protein family  31.47 
 
 		 145 aa  72.4  0.000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3070  hypothetical protein  36.23 
 
 		 300 aa  72.4  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>