241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0791 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_0791  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 285 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1227  UspA domain-containing protein  81.69 
 
 		 284 aa  480  1e-134  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0187  UspA domain-containing protein  81.34 
 
 		 284 aa  472  1e-132  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1994  UspA domain-containing protein  81.34 
 
 		 284 aa  472  1e-132  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1166  UspA domain protein  57.04 
 
 		 283 aa  328  8e-89  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00957514 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1050  UspA domain protein  56.49 
 
 		 284 aa  306  3e-82  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.192596  hitchhiker  0.000149596 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1852  UspA domain-containing protein  48.59 
 
 		 283 aa  280  2e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.323758  hitchhiker  0.00188787 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0182  universal stress protein  47.54 
 
 		 281 aa  269  4e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5171  UspA domain-containing protein  48.24 
 
 		 283 aa  262  4.999999999999999e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2101  UspA domain-containing protein  46.62 
 
 		 312 aa  262  6e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2562  universal stress protein  49.65 
 
 		 281 aa  258  7e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.643339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2763  hypothetical protein  46.45 
 
 		 285 aa  253  3e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.723641  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0944  UspA-related nucleotide-binding protein  49.65 
 
 		 283 aa  248  1e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0763002  normal  0.265915 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2720  UspA domain-containing protein  48.07 
 
 		 284 aa  238  1e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.532159 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07090  universal stress protein, UspA  46.67 
 
 		 284 aa  232  5e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.540561  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1910  UspA domain-containing protein  43.66 
 
 		 283 aa  230  2e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1912  UspA domain protein  39.79 
 
 		 288 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1816  UspA domain-containing protein  40.14 
 
 		 288 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00317647  normal  0.851658 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0850  UspA domain-containing protein  36.93 
 
 		 284 aa  195  8.000000000000001e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.519772 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1137  UspA domain-containing protein  37.15 
 
 		 307 aa  192  5e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0781  hypothetical protein  37.32 
 
 		 283 aa  191  1e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1226  hypothetical protein  36.75 
 
 		 287 aa  188  7e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.594173  normal  0.462548 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5068  Universal stress protein  37.19 
 
 		 284 aa  186  3e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4471  universal stress protein UspA  36.01 
 
 		 287 aa  186  5e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000777431  hitchhiker  0.00999732 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4601  universal stress protein UspA  36.01 
 
 		 287 aa  186  5e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000321646  normal  0.0139056 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1574  UspA domain protein  36.01 
 
 		 287 aa  186  5e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3461  hypothetical protein  36.14 
 
 		 281 aa  180  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.148579 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4142  UspA domain-containing protein  35.79 
 
 		 281 aa  177  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.976252 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1154  hypothetical protein  36.04 
 
 		 286 aa  174  9.999999999999999e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4258  universal stress protein  36.36 
 
 		 281 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0395352  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2785  hypothetical protein  35.09 
 
 		 283 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.364827 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0174  UspA domain-containing protein  31.8 
 
 		 286 aa  138  7.999999999999999e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0137308  normal  0.254776 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2042  hypothetical protein  30.28 
 
 		 284 aa  125  8.000000000000001e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.845392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2345  hypothetical protein  29.23 
 
 		 284 aa  121  9.999999999999999e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.450021 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0260  UspA-related nucleotide-binding protein  28.52 
 
 		 278 aa  118  9e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0342  putative universal stress protein  28.33 
 
 		 286 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0101  UspA domain protein  27.7 
 
 		 273 aa  96.3  5e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1359  UspA domain protein  24.32 
 
 		 281 aa  85.5  8e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4566  UspA domain protein  29.41 
 
 		 279 aa  73.2  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.564371  normal  0.196949 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4433  UspA domain protein  29.41 
 
 		 279 aa  73.2  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1630  universal stress protein  20.07 
 
 		 278 aa  71.6  0.00000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0032  UspA domain protein  29.34 
 
 		 279 aa  70.9  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1300  UspA domain protein  31.28 
 
 		 278 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.085168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1355  UspA domain-containing protein  30.9 
 
 		 313 aa  66.6  0.0000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.574813 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1555  UspA domain protein  30.9 
 
 		 270 aa  65.5  0.0000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  28 
 
 		 283 aa  65.1  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2567  UspA domain-containing protein  31.87 
 
 		 270 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.0044371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  28.38 
 
 		 155 aa  58.5  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  26.32 
 
 		 415 aa  57.4  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0194  UspA domain-containing protein  28.74 
 
 		 270 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0185  hypothetical protein  27.81 
 
 		 279 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.123321 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0571  hypothetical protein  30.56 
 
 		 259 aa  57  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1621  UspA domain protein  23.26 
 
 		 272 aa  57.4  0.0000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3571  UspA domain-containing protein  31.29 
 
 		 279 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.620295  normal  0.215578 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  25.36 
 
 		 297 aa  56.6  0.0000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3435  putative UspA stress protein  28.86 
 
 		 278 aa  57  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.34254  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4709  hypothetical protein  27.81 
 
 		 278 aa  56.2  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0446  hypothetical protein  28.86 
 
 		 274 aa  56.2  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.179985  normal  0.962231 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1605  UspA domain-containing protein  29.93 
 
 		 280 aa  56.2  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.591971  normal  0.475521 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0427  UspA domain-containing protein  28.02 
 
 		 271 aa  55.8  0.0000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6131  UspA domain-containing protein  29.38 
 
 		 271 aa  55.8  0.0000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8718  UspA domain protein  30.2 
 
 		 280 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2617  UspA domain-containing protein  28.82 
 
 		 271 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0348  hypothetical protein  28.67 
 
 		 274 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00425417 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1983  UspA domain protein  28.39 
 
 		 273 aa  55.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0316321  normal  0.0164528 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3269  UspA domain-containing protein  31.06 
 
 		 271 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.17581  normal  0.400144 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1024  universal stress protein UspA  28.1 
 
 		 279 aa  54.7  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2241  hypothetical protein  32.63 
 
 		 126 aa  53.9  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.499289 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2238  hypothetical protein  28.33 
 
 		 280 aa  53.9  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.289135  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0395  UspA domain-containing protein  28 
 
 		 270 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.275124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2788  UspA domain protein  29.21 
 
 		 271 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.084902  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2107  UspA domain-containing protein  26.37 
 
 		 291 aa  53.5  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  23.49 
 
 		 307 aa  53.1  0.000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2231  hypothetical protein  28.21 
 
 		 278 aa  53.1  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0440  UspA domain-containing protein  27.78 
 
 		 272 aa  53.1  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.713184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5229  UspA domain protein  29.56 
 
 		 271 aa  53.1  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.000806741  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  27.23 
 
 		 288 aa  52.8  0.000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0423  UspA domain protein  28.98 
 
 		 271 aa  52.4  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.892038  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  24.11 
 
 		 141 aa  52.4  0.000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3813  UspA domain protein  27.59 
 
 		 283 aa  52.4  0.000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0381  UspA domain protein  28 
 
 		 274 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0466978  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  23.66 
 
 		 300 aa  51.6  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6175  UspA domain protein  29.53 
 
 		 280 aa  52  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0939  UspA domain-containing protein  26.04 
 
 		 287 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.799371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  30.86 
 
 		 145 aa  52.4  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1849  UspA domain-containing protein  28.41 
 
 		 277 aa  51.6  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2134  UspA domain-containing protein  28.74 
 
 		 281 aa  51.6  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  29.63 
 
 		 145 aa  50.8  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  27.78 
 
 		 281 aa  51.6  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1948  hypothetical protein  30.52 
 
 		 279 aa  50.8  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2248  hypothetical protein  30.41 
 
 		 277 aa  51.2  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4210  UspA domain-containing protein  30.83 
 
 		 280 aa  51.6  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0989  UspA domain-containing protein  28.26 
 
 		 300 aa  51.6  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1862  UspA domain-containing protein  24.63 
 
 		 293 aa  51.2  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.23265  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1142  hypothetical protein  26.32 
 
 		 279 aa  50.4  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2630  UspA domain-containing protein  27.17 
 
 		 272 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44930  Usp-like protein  27.78 
 
 		 294 aa  50.8  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2647  UspA domain protein  25.94 
 
 		 272 aa  50.4  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.104677  normal  0.902645 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2727  universal stress protein  26.47 
 
 		 140 aa  50.1  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3815  UspA domain protein  28.19 
 
 		 286 aa  49.7  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.763121  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>