139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1137 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1137  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 307 aa  640    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1154  hypothetical protein  51.75 
 
 		 286 aa  295  6e-79  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1226  hypothetical protein  50 
 
 		 287 aa  291  7e-78  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.594173  normal  0.462548 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1166  UspA domain protein  39.37 
 
 		 283 aa  217  2e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00957514 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0791  UspA domain-containing protein  37.15 
 
 		 285 aa  210  3e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0187  UspA domain-containing protein  37.5 
 
 		 284 aa  205  7e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1994  UspA domain-containing protein  37.5 
 
 		 284 aa  205  7e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1227  UspA domain-containing protein  37.15 
 
 		 284 aa  202  6e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0182  universal stress protein  37.37 
 
 		 281 aa  201  9.999999999999999e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2101  UspA domain-containing protein  36.21 
 
 		 312 aa  194  1e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5171  UspA domain-containing protein  37.98 
 
 		 283 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07090  universal stress protein, UspA  38.75 
 
 		 284 aa  191  2e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.540561  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2763  hypothetical protein  33.68 
 
 		 285 aa  189  4e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.723641  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2562  universal stress protein  36.59 
 
 		 281 aa  185  8e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.643339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1910  UspA domain-containing protein  32.06 
 
 		 283 aa  185  9e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1852  UspA domain-containing protein  35.17 
 
 		 283 aa  184  1.0000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.323758  hitchhiker  0.00188787 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1050  UspA domain protein  37.15 
 
 		 284 aa  183  4.0000000000000006e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.192596  hitchhiker  0.000149596 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2720  UspA domain-containing protein  35.64 
 
 		 284 aa  181  1e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.532159 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0944  UspA-related nucleotide-binding protein  37.63 
 
 		 283 aa  179  4e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0763002  normal  0.265915 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0781  hypothetical protein  35.76 
 
 		 283 aa  172  6.999999999999999e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1912  UspA domain protein  31.72 
 
 		 288 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1816  UspA domain-containing protein  32.07 
 
 		 288 aa  163  3e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00317647  normal  0.851658 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4471  universal stress protein UspA  33.67 
 
 		 287 aa  162  5.0000000000000005e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000777431  hitchhiker  0.00999732 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4601  universal stress protein UspA  33.67 
 
 		 287 aa  162  5.0000000000000005e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000321646  normal  0.0139056 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1574  UspA domain protein  33.67 
 
 		 287 aa  162  5.0000000000000005e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0850  UspA domain-containing protein  33.79 
 
 		 284 aa  162  9e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.519772 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4142  UspA domain-containing protein  31.01 
 
 		 281 aa  150  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.976252 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5068  Universal stress protein  31.74 
 
 		 284 aa  146  5e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3461  hypothetical protein  30.1 
 
 		 281 aa  146  5e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.148579 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4258  universal stress protein  30.31 
 
 		 281 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0395352  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2042  hypothetical protein  30 
 
 		 284 aa  135  9e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.845392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2345  hypothetical protein  29.66 
 
 		 284 aa  134  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.450021 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0174  UspA domain-containing protein  27.59 
 
 		 286 aa  132  9e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0137308  normal  0.254776 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2785  hypothetical protein  34.13 
 
 		 283 aa  123  4e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.364827 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0342  putative universal stress protein  28.38 
 
 		 286 aa  118  9.999999999999999e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0260  UspA-related nucleotide-binding protein  26.64 
 
 		 278 aa  97.8  2e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1359  UspA domain protein  23.51 
 
 		 281 aa  94.7  2e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0101  UspA domain protein  26.16 
 
 		 273 aa  73.2  0.000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  26.14 
 
 		 288 aa  62.8  0.000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  29.37 
 
 		 140 aa  58.5  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1083  UspA domain-containing protein  23.62 
 
 		 449 aa  56.2  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000280681  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3885  UspA domain protein  24.38 
 
 		 271 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0886728  normal  0.0599221 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0032  UspA domain protein  22.41 
 
 		 279 aa  54.3  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1630  universal stress protein  17.75 
 
 		 278 aa  54.3  0.000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  22.86 
 
 		 283 aa  53.9  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  21.03 
 
 		 274 aa  53.9  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  23.33 
 
 		 304 aa  53.1  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5381  UspA domain-containing protein  25.17 
 
 		 162 aa  52.8  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  21.38 
 
 		 276 aa  52  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1440  hypothetical protein  23.45 
 
 		 159 aa  50.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5714  UspA domain-containing protein  23.94 
 
 		 159 aa  50.4  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.445064 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6388  UspA domain-containing protein  23.45 
 
 		 159 aa  50.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.686835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7052  UspA domain-containing protein  23.45 
 
 		 159 aa  50.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3435  putative UspA stress protein  28.36 
 
 		 278 aa  49.7  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.34254  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1300  UspA domain protein  22.45 
 
 		 278 aa  49.7  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.085168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6467  UspA domain-containing protein  23.94 
 
 		 159 aa  49.7  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.276818 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6944  universal stress protein  23.94 
 
 		 157 aa  49.3  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00046035  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  22.83 
 
 		 307 aa  49.3  0.00008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4566  UspA domain protein  20.45 
 
 		 279 aa  49.3  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.564371  normal  0.196949 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1355  UspA domain-containing protein  23.85 
 
 		 313 aa  49.3  0.00008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.574813 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2880  UspA domain-containing protein  26.13 
 
 		 271 aa  49.3  0.00008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4433  UspA domain protein  20.45 
 
 		 279 aa  49.3  0.00008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  24.61 
 
 		 300 aa  49.3  0.00009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  24.34 
 
 		 290 aa  48.9  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1854  hypothetical protein  26.06 
 
 		 278 aa  48.9  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.796292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1097  hypothetical protein  20.13 
 
 		 294 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1114  UspA domain-containing protein  20.13 
 
 		 294 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.98551 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6312  UspA domain protein  24.83 
 
 		 281 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1024  universal stress protein UspA  27.21 
 
 		 279 aa  47.4  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3346  hypothetical protein  27.97 
 
 		 156 aa  47.4  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0885774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4350  UspA domain protein  21.04 
 
 		 294 aa  47.8  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.252521  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1555  UspA domain protein  23.39 
 
 		 270 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3794  UspA domain protein  23.43 
 
 		 301 aa  47.4  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00697323 
 
 
-
 
NC_002950  PG0245  universal stress protein  22.19 
 
 		 370 aa  47  0.0004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  25 
 
 		 144 aa  47  0.0004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1125  UspA domain-containing protein  19.81 
 
 		 294 aa  47  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  22.46 
 
 		 415 aa  47  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  22.75 
 
 		 280 aa  46.6  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17970  universal stress protein family  26.71 
 
 		 142 aa  46.2  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1859  putative universal stress protein  23.45 
 
 		 157 aa  46.2  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  25.6 
 
 		 151 aa  45.8  0.0009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2617  UspA domain-containing protein  22.42 
 
 		 271 aa  45.8  0.0009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  23.45 
 
 		 156 aa  45.8  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2547  UspA domain protein  19.75 
 
 		 306 aa  45.4  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  23.96 
 
 		 297 aa  45.4  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0442  universal stress protein  27.78 
 
 		 200 aa  45.8  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1913  hypothetical protein  24.14 
 
 		 278 aa  45.8  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.082206  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3114  hypothetical protein  25.56 
 
 		 265 aa  45.8  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.936734  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1378  UspA domain-containing protein  21.1 
 
 		 297 aa  45.4  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.406073 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  22.4 
 
 		 128 aa  45.1  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2564  UspA domain protein  20.22 
 
 		 282 aa  45.8  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.143275  normal  0.0151057 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0427  UspA domain-containing protein  21.21 
 
 		 271 aa  45.8  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  25.71 
 
 		 139 aa  45.1  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3584  hypothetical protein  25.62 
 
 		 278 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  22.92 
 
 		 141 aa  44.7  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3164  UspA domain protein  20.53 
 
 		 156 aa  44.7  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6565  UspA domain-containing protein  23.53 
 
 		 161 aa  44.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.363872  normal  0.275495 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5580  UspA domain protein  28.25 
 
 		 168 aa  44.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.88885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2314  UspA domain protein  27.78 
 
 		 153 aa  45.1  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2401  UspA domain-containing protein  23.29 
 
 		 140 aa  44.3  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.499037 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>