More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_2008 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  100 
 
 
141 aa  278  2e-74  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  69.01 
 
 
143 aa  202  2e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  51.08 
 
 
139 aa  146  1.0000000000000001e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  51.06 
 
 
140 aa  146  1.0000000000000001e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  54.48 
 
 
144 aa  142  2e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1489  UspA domain-containing protein  47.14 
 
 
137 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.854212 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1230  UspA domain-containing protein  44.53 
 
 
137 aa  103  8e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  42.86 
 
 
137 aa  99  2e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  39.44 
 
 
142 aa  96.3  1e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  39.33 
 
 
128 aa  96.3  1e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0337  UspA domain-containing protein  41.43 
 
 
137 aa  95.9  2e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0081  UspA domain protein  43.45 
 
 
143 aa  93.2  1e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324283  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  36.99 
 
 
150 aa  93.2  1e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  41.96 
 
 
138 aa  93.2  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  31.91 
 
 
150 aa  90.9  6e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1017  UspA domain-containing protein  38.26 
 
 
138 aa  90.5  7e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0550941 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  40.56 
 
 
138 aa  90.5  8e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7012  UspA domain-containing protein  34.25 
 
 
156 aa  88.2  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305575  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1117  UspA domain-containing protein  34.25 
 
 
156 aa  87.8  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656052  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3816  UspA domain protein  36.81 
 
 
142 aa  87.8  5e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0222227  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  36.88 
 
 
147 aa  87.4  6e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  33.55 
 
 
139 aa  87.4  6e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  35 
 
 
164 aa  87  9e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1585  UspA domain protein  39.58 
 
 
142 aa  87  9e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0631  UspA domain protein  41.33 
 
 
160 aa  86.3  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113911  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  34.75 
 
 
156 aa  85.5  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  34.03 
 
 
152 aa  85.5  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  32.64 
 
 
156 aa  85.5  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  36.36 
 
 
148 aa  85.9  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5714  UspA domain-containing protein  36.99 
 
 
159 aa  85.1  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.445064 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  35.14 
 
 
180 aa  84.7  4e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6944  universal stress protein  36.3 
 
 
157 aa  84.3  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00046035  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2109  UspA domain-containing protein  40.56 
 
 
128 aa  84  6e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6467  UspA domain-containing protein  36.99 
 
 
159 aa  84  7e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.276818 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  30.82 
 
 
150 aa  83.6  9e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1229  hypothetical protein  36.99 
 
 
146 aa  82.8  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4356  UspA domain-containing protein  34.72 
 
 
145 aa  82.4  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244024  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3164  UspA domain protein  37.16 
 
 
156 aa  81.6  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7052  UspA domain-containing protein  34.93 
 
 
159 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1440  hypothetical protein  34.93 
 
 
159 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6388  UspA domain-containing protein  34.93 
 
 
159 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.686835  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  33.33 
 
 
158 aa  81.3  0.000000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  35.21 
 
 
149 aa  80.5  0.000000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5381  UspA domain-containing protein  34.93 
 
 
162 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  37.16 
 
 
155 aa  80.5  0.000000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1307  UspA domain protein  33.1 
 
 
153 aa  80.5  0.000000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.476613  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  33.79 
 
 
151 aa  79.7  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  32.48 
 
 
156 aa  79.3  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  34.46 
 
 
145 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1249  hypothetical protein  35.33 
 
 
154 aa  79  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.17939  normal  0.197708 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  36.3 
 
 
148 aa  79  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0722  universal stress protein  35.66 
 
 
140 aa  78.2  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0566  universal stress protein  33.78 
 
 
140 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0568  UspA domain-containing protein  36.36 
 
 
140 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  34.04 
 
 
290 aa  78.6  0.00000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2088  UspA domain-containing protein  37.16 
 
 
153 aa  78.6  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0358891 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0071  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  34.64 
 
 
155 aa  78.6  0.00000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000663876  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1803  UspA domain protein  33.79 
 
 
143 aa  78.6  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0711  universal stress protein family  33.78 
 
 
140 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0445079 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0622  universal stress protein  33.78 
 
 
140 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0565  universal stress protein  33.78 
 
 
140 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2528  UspA domain protein  38.26 
 
 
140 aa  78.2  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.508947  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0654  universal stress protein  33.78 
 
 
140 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  30.5 
 
 
286 aa  78.2  0.00000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1331  universal stress protein UspA  38.26 
 
 
140 aa  78.2  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0783  universal stress protein family  33.78 
 
 
140 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  39.47 
 
 
153 aa  78.2  0.00000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  33.1 
 
 
144 aa  78.2  0.00000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2624  UspA domain protein  38.26 
 
 
140 aa  78.2  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  33.57 
 
 
143 aa  78.2  0.00000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1196  UspA domain-containing protein  35.62 
 
 
142 aa  77.8  0.00000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196709  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1862  UspA domain protein  35.21 
 
 
141 aa  77.8  0.00000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0496809 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4451  universal stress protein UspA  33.33 
 
 
161 aa  77.8  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.15852  normal  0.144884 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4069  UspA domain-containing protein  32.24 
 
 
162 aa  77.4  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0307561  normal  0.903316 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1382  UspA domain-containing protein  36.3 
 
 
142 aa  77.8  0.00000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.378027 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  31.94 
 
 
144 aa  77.4  0.00000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0674  UspA domain-containing protein  37.24 
 
 
143 aa  77.4  0.00000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0690  universal stress protein family  34.46 
 
 
140 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0108874  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4648  universal stress protein family  33.78 
 
 
140 aa  77  0.00000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000011295  unclonable  2.43078e-26 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0550  UspA domain-containing protein  37.06 
 
 
140 aa  77  0.00000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1601  hypothetical protein  35.21 
 
 
150 aa  77  0.00000000000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.239792  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5818  UspA domain-containing protein  34.69 
 
 
153 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0832063 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
148 aa  76.6  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  29.17 
 
 
156 aa  75.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  33.56 
 
 
159 aa  75.5  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0174  UspA domain protein  35.86 
 
 
144 aa  75.5  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.102969  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1706  universal stress protein  37.5 
 
 
130 aa  75.9  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0360451  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5355  UspA domain protein  34.25 
 
 
148 aa  75.5  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6185  UspA domain-containing protein  32.88 
 
 
157 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.552133  normal  0.212632 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1659  UspA domain-containing protein  35 
 
 
140 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0848  hypothetical protein  34.25 
 
 
142 aa  75.9  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957853  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3150  UspA domain-containing protein  32.64 
 
 
155 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1272  UspA domain-containing protein  32.64 
 
 
145 aa  75.9  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4775  UspA domain protein  31.21 
 
 
141 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0804  UspA domain protein  39.86 
 
 
138 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.380791 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5009  UspA domain-containing protein  32.64 
 
 
156 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0309  hypothetical protein  36.99 
 
 
142 aa  75.9  0.0000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  32.37 
 
 
300 aa  75.1  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4485  UspA domain-containing protein  31.94 
 
 
155 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5738  UspA domain-containing protein  31.94 
 
 
155 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.192477 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>