More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1229 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_1229  hypothetical protein  100 
 
 		 146 aa  288  1e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  36.3 
 
 		 143 aa  85.9  2e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2821  hypothetical protein  38.36 
 
 		 149 aa  85.5  3e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.253372  normal  0.0804711 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  36.99 
 
 		 141 aa  82.8  0.000000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  37.23 
 
 		 142 aa  82.4  0.000000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  37.67 
 
 		 138 aa  79.3  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  32.64 
 
 		 139 aa  77.8  0.00000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  34.72 
 
 		 145 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5163  UspA domain protein  36.73 
 
 		 145 aa  78.2  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.262292  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  33.78 
 
 		 290 aa  76.3  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  36.99 
 
 		 138 aa  76.6  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  33.11 
 
 		 158 aa  75.9  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4616  UspA domain protein  31.51 
 
 		 141 aa  73.6  0.0000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1766  UspA domain-containing protein  29.66 
 
 		 166 aa  72.8  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.81708  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1801  UspA domain-containing protein  29.66 
 
 		 166 aa  72.8  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  32.45 
 
 		 159 aa  73.2  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4568  hypothetical protein  30.86 
 
 		 173 aa  72  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4652  hypothetical protein  34.18 
 
 		 180 aa  72.4  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.741195 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  30.14 
 
 		 140 aa  71.2  0.000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1760  hypothetical protein  33.55 
 
 		 148 aa  70.5  0.000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  32.67 
 
 		 153 aa  69.7  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  32.67 
 
 		 150 aa  69.3  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3438  UspA domain protein  33.33 
 
 		 144 aa  68.6  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0631  UspA domain protein  31.48 
 
 		 160 aa  68.2  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113911  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0384  UspA domain protein  32 
 
 		 142 aa  68.6  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150335  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  28.1 
 
 		 156 aa  66.2  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 153 aa  66.6  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0351  UspA domain-containing protein  34 
 
 		 147 aa  66.2  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0480  UspA domain protein  35.17 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1231  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  29.66 
 
 		 162 aa  65.5  0.0000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0928925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1678  UspA domain-containing protein  32.88 
 
 		 155 aa  65.1  0.0000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.222334  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3816  UspA domain protein  31.76 
 
 		 142 aa  65.1  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0222227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  33.56 
 
 		 143 aa  65.1  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1273  universal stress protein  27.4 
 
 		 166 aa  64.7  0.0000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1517  UspA domain protein  33.09 
 
 		 148 aa  64.7  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.346414  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1230  UspA domain-containing protein  33.8 
 
 		 137 aa  64.3  0.0000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1272  UspA domain-containing protein  34.23 
 
 		 145 aa  64.3  0.0000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0486  UspA domain-containing protein  27.7 
 
 		 162 aa  63.9  0.0000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000206197  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0916  hypothetical protein  28.76 
 
 		 173 aa  63.9  0.0000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  33.11 
 
 		 156 aa  63.5  0.0000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2073  UspA domain protein  36.48 
 
 		 161 aa  62.8  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.338106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5355  UspA domain protein  32.45 
 
 		 148 aa  62.8  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  31.33 
 
 		 152 aa  63.2  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  32.41 
 
 		 288 aa  63.2  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  29.25 
 
 		 153 aa  63.5  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  31.29 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  26.9 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  25.34 
 
 		 145 aa  62  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  27.4 
 
 		 145 aa  62.4  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1196  UspA domain-containing protein  31.25 
 
 		 142 aa  62  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196709  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1447  UspA domain protein  33.11 
 
 		 147 aa  62.8  0.000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1307  UspA domain protein  31.51 
 
 		 153 aa  62  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.476613  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5241  UspA domain protein  30.41 
 
 		 154 aa  61.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.639442 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1744  UspA domain protein  36.17 
 
 		 296 aa  61.6  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2210  universal stress protein UspA  34.01 
 
 		 149 aa  61.6  0.000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0848  hypothetical protein  30.67 
 
 		 142 aa  61.2  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  31.13 
 
 		 154 aa  61.2  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  31.94 
 
 		 286 aa  60.8  0.000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  30.34 
 
 		 137 aa  61.2  0.000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1945  UspA domain-containing protein  30.67 
 
 		 139 aa  60.8  0.000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2050  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  30.26 
 
 		 143 aa  60.8  0.000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.450915  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  26.03 
 
 		 145 aa  60.5  0.000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3301  UspA domain-containing protein  28.77 
 
 		 152 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3459  hypothetical protein  35.51 
 
 		 145 aa  60.5  0.000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.450632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0914  UspA domain protein  30.07 
 
 		 154 aa  60.5  0.000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.446701 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1290  UspA domain-containing protein  28.77 
 
 		 165 aa  60.5  0.000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.466439  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0502  universal stress protein family  28.08 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4760  universal stress protein  28.08 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4523  universal stress protein  28.08 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4359  universal stress protein  28.08 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4370  universal stress protein  28.08 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4754  universal stress protein family  28.08 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00141211  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4875  universal stress protein  28.08 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4743  universal stress protein family  28.08 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4455  UspA domain-containing protein  28.77 
 
 		 152 aa  60.1  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0391704  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0309  hypothetical protein  29.73 
 
 		 142 aa  60.1  0.00000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2091  UspA domain-containing protein  30.72 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.10254  normal  0.0585614 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4733  universal stress protein family  28.08 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1585  UspA domain protein  34.93 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  31.72 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  28.67 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  29.63 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0589  universal stress protein  27.82 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.558284  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2474  hypothetical protein  29.05 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  33.56 
 
 		 128 aa  58.9  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4276  UspA domain-containing protein  32.41 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.413814  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0128  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  29.14 
 
 		 164 aa  58.9  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000319103  hitchhiker  0.0000000012302 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1848  UspA family nucleotide-binding protein  30.41 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2701  UspA domain protein  27.33 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3643  UspA domain protein  29.41 
 
 		 141 aa  58.5  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0969583  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2467  UspA domain-containing protein  30.3 
 
 		 175 aa  58.2  0.00000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0954  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  27.89 
 
 		 141 aa  57.8  0.00000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3922  UspA domain protein  33.33 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0180  UspA domain-containing protein  30 
 
 		 160 aa  58.2  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149543  normal  0.974446 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4368  UspA domain protein  29.81 
 
 		 175 aa  57.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.2229 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0826  universal stress protein  27.08 
 
 		 165 aa  57.8  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  28 
 
 		 300 aa  57.8  0.00000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0959  UspA domain protein  33.56 
 
 		 131 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0112634  normal  0.295172 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2298  UspA domain-containing protein  30.46 
 
 		 164 aa  57.8  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178234  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>