More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1862 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1862  UspA domain protein  100 
 
 		 141 aa  272  1.0000000000000001e-72  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0496809 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1858  UspA domain protein  52.48 
 
 		 147 aa  150  5e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0432  UspA domain protein  45.71 
 
 		 144 aa  129  2.0000000000000002e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1388  UspA domain protein  45 
 
 		 145 aa  120  7e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.120958  normal  0.124251 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1573  UspA domain protein  44.59 
 
 		 149 aa  109  1.0000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3164  UspA domain protein  42.67 
 
 		 156 aa  104  4e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  45.07 
 
 		 180 aa  102  2e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  50 
 
 		 144 aa  99  2e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  40.43 
 
 		 297 aa  97.8  4e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4249  UspA domain protein  45.58 
 
 		 133 aa  95.5  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  39.86 
 
 		 156 aa  95.9  2e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  36.36 
 
 		 145 aa  95.5  2e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  37.32 
 
 		 148 aa  95.5  2e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  41.89 
 
 		 153 aa  95.5  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3405  UspA domain protein  43.24 
 
 		 150 aa  95.1  3e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  43.66 
 
 		 290 aa  94.7  4e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1308  UspA domain protein  36.43 
 
 		 145 aa  94.4  5e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.437188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3418  UspA domain protein  46.85 
 
 		 133 aa  94  6e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  37.59 
 
 		 286 aa  93.6  7e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  40.43 
 
 		 208 aa  93.6  8e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  39.44 
 
 		 152 aa  93.6  9e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  35.92 
 
 		 145 aa  93.2  1e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  38.62 
 
 		 152 aa  93.2  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  34.97 
 
 		 145 aa  91.7  3e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  34.03 
 
 		 150 aa  91.7  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  44.14 
 
 		 159 aa  91.3  4e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  35.92 
 
 		 164 aa  91.3  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  33.79 
 
 		 150 aa  91.3  4e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3733  UspA domain protein  43.92 
 
 		 151 aa  90.1  9e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.217159  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  43.15 
 
 		 158 aa  89.7  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  34.97 
 
 		 145 aa  89  2e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0570  UspA domain protein  43.48 
 
 		 141 aa  87.4  5e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.932953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  39.01 
 
 		 156 aa  86.3  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  33.1 
 
 		 150 aa  86.7  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  37.58 
 
 		 155 aa  86.3  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  33.8 
 
 		 147 aa  85.1  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4348  UspA domain protein  38.3 
 
 		 149 aa  85.1  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0947911  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  41.26 
 
 		 307 aa  84.3  5e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  40.58 
 
 		 281 aa  83.6  8e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  32.86 
 
 		 149 aa  83.2  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  36.17 
 
 		 207 aa  82.8  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  35.21 
 
 		 141 aa  81.6  0.000000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1307  UspA domain protein  37.59 
 
 		 153 aa  81.6  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.476613  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3055  UspA domain protein  40.43 
 
 		 142 aa  81.6  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  30.67 
 
 		 151 aa  81.3  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0833  UspA domain protein  34.55 
 
 		 169 aa  80.9  0.000000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.139589  normal  0.670884 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  35.66 
 
 		 143 aa  79.7  0.00000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  38.41 
 
 		 305 aa  79.7  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0480  UspA domain protein  40.71 
 
 		 144 aa  79.7  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  30.34 
 
 		 156 aa  78.6  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  38.3 
 
 		 148 aa  79.3  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  35.86 
 
 		 144 aa  79.3  0.00000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0965  UspA domain protein  37.59 
 
 		 152 aa  78.2  0.00000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  35.04 
 
 		 139 aa  78.2  0.00000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  35.25 
 
 		 300 aa  78.2  0.00000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1196  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 		 142 aa  78.2  0.00000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196709  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3681  UspA domain protein  35.86 
 
 		 301 aa  77.8  0.00000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  34.75 
 
 		 140 aa  77.4  0.00000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  35.92 
 
 		 288 aa  76.6  0.00000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  29.05 
 
 		 157 aa  76.3  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  38.03 
 
 		 287 aa  76.3  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0826  universal stress protein  30.94 
 
 		 165 aa  75.9  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  34.03 
 
 		 143 aa  74.7  0.0000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  32.39 
 
 		 143 aa  74.3  0.0000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4014  UspA domain protein  39.01 
 
 		 136 aa  73.9  0.0000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0780  UspA domain protein  32.39 
 
 		 142 aa  73.6  0.0000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608906  normal  0.0365188 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  33.79 
 
 		 147 aa  73.9  0.0000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  36.17 
 
 		 138 aa  72.8  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2102  UspA domain protein  34.53 
 
 		 289 aa  72.4  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  31.47 
 
 		 148 aa  72.8  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  35.62 
 
 		 128 aa  72.4  0.000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  32.17 
 
 		 142 aa  72  0.000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0128  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  33.11 
 
 		 164 aa  71.6  0.000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000319103  hitchhiker  0.0000000012302 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  28.38 
 
 		 145 aa  70.5  0.000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1017  UspA domain-containing protein  34.27 
 
 		 138 aa  69.7  0.00000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0550941 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5381  UspA domain-containing protein  32.65 
 
 		 162 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5916  UspA domain-containing protein  32.19 
 
 		 157 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585154  normal  0.579135 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3813  UspA domain protein  37.86 
 
 		 283 aa  69.7  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  30.34 
 
 		 144 aa  68.9  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  36.43 
 
 		 280 aa  68.9  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  35.42 
 
 		 139 aa  68.9  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3170  UspA domain protein  37.14 
 
 		 167 aa  68.6  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  39.72 
 
 		 283 aa  68.6  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1197  hypothetical protein  35.62 
 
 		 151 aa  68.6  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0848  hypothetical protein  32.39 
 
 		 142 aa  67.8  0.00000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6185  UspA domain-containing protein  31.51 
 
 		 157 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.552133  normal  0.212632 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2586  universal stress protein  30.66 
 
 		 141 aa  66.6  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0483395  normal  0.125899 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0384  UspA domain protein  33.57 
 
 		 142 aa  66.2  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150335  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2815  UspA domain protein  34.46 
 
 		 147 aa  65.5  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0183337  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0228  UspA domain protein  33.1 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.115538 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0224  UspA domain protein  37.06 
 
 		 151 aa  65.5  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.483112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  33.33 
 
 		 148 aa  65.5  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1531  UspA domain protein  32.39 
 
 		 171 aa  64.7  0.0000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00154671  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  38.13 
 
 		 415 aa  64.7  0.0000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1768  UspA domain-containing protein  29.29 
 
 		 140 aa  64.7  0.0000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3218  universal stress protein  31.4 
 
 		 120 aa  64.3  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0127245 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0309  hypothetical protein  30.28 
 
 		 142 aa  63.9  0.0000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2851  hypothetical protein  29.77 
 
 		 137 aa  63.2  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.130052  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1083  universal stress protein family  33.11 
 
 		 145 aa  63.2  0.000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2059  UspA domain protein  30.61 
 
 		 156 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3944  hitchhiker  0.00218931 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>