More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0674 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_0674  UspA domain-containing protein  100 
 
 
143 aa  281  3.0000000000000004e-75  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1768  UspA domain-containing protein  44.29 
 
 
140 aa  101  3e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1659  UspA domain-containing protein  45.39 
 
 
140 aa  92  2e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  36 
 
 
143 aa  81.3  0.000000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  38.57 
 
 
139 aa  79.3  0.00000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  36.24 
 
 
145 aa  78.6  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  35.57 
 
 
145 aa  77.4  0.00000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  37.24 
 
 
141 aa  77.4  0.00000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  35.57 
 
 
145 aa  75.5  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  38.85 
 
 
140 aa  75.5  0.0000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  32.21 
 
 
148 aa  72.8  0.000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1585  UspA domain protein  38.1 
 
 
142 aa  72  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1272  UspA domain-containing protein  36.23 
 
 
138 aa  72.8  0.000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.828897 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4186  UspA domain protein  32.72 
 
 
182 aa  71.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4225  UspA domain protein  32.72 
 
 
182 aa  71.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.109852  normal  0.228049 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0870  UspA domain protein  34.29 
 
 
140 aa  71.2  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  34.23 
 
 
145 aa  70.9  0.000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4785  UspA domain protein  33.11 
 
 
157 aa  70.9  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1509  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  30.82 
 
 
142 aa  69.7  0.00000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.767189  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5095  UspA domain protein  42.17 
 
 
177 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1249  hypothetical protein  35.81 
 
 
154 aa  68.6  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.17939  normal  0.197708 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4775  UspA domain protein  35.66 
 
 
141 aa  67.8  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1134  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
167 aa  67  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0384  UspA domain protein  36.36 
 
 
142 aa  66.2  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150335  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1567  universal stress protein  31.69 
 
 
164 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.84315  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3816  UspA domain protein  32.39 
 
 
142 aa  65.9  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0222227  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  31.97 
 
 
156 aa  65.1  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  31.97 
 
 
144 aa  63.9  0.0000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0081  UspA domain protein  31.33 
 
 
143 aa  63.5  0.0000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324283  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  34.75 
 
 
147 aa  63.2  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  29.53 
 
 
151 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0442  universal stress protein  34 
 
 
200 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  30.99 
 
 
139 aa  62.8  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3922  UspA domain protein  37.75 
 
 
142 aa  63.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1986  UspA domain protein  33.1 
 
 
317 aa  62  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2155  UspA domain-containing protein  32.39 
 
 
291 aa  62  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2278  UspA domain protein  29.66 
 
 
143 aa  62.4  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4652  hypothetical protein  33.97 
 
 
180 aa  62.8  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.741195 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  27.34 
 
 
208 aa  62.8  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  33.79 
 
 
148 aa  62.8  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  30.99 
 
 
138 aa  62  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2467  UspA domain-containing protein  32.48 
 
 
175 aa  62.8  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  31.79 
 
 
157 aa  62  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0631  UspA domain protein  33.33 
 
 
160 aa  61.6  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113911  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0780  UspA domain protein  31.03 
 
 
142 aa  61.2  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608906  normal  0.0365188 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  29.53 
 
 
305 aa  61.6  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1933  UspA domain-containing protein  29.05 
 
 
141 aa  61.2  0.000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1848  UspA family nucleotide-binding protein  33.33 
 
 
147 aa  61.2  0.000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0758  UspA domain protein  29.34 
 
 
162 aa  61.2  0.000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.16073  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1017  UspA domain-containing protein  34.27 
 
 
138 aa  61.2  0.000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0550941 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1664  UspA domain-containing protein  29.49 
 
 
156 aa  60.8  0.000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30750  universal stress protein UspA-like protein  30.41 
 
 
305 aa  60.8  0.000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.537439  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5580  UspA domain protein  29.93 
 
 
168 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.88885  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1529  UspA domain protein  30.94 
 
 
141 aa  60.8  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  32.41 
 
 
145 aa  60.8  0.000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1945  UspA domain-containing protein  30.22 
 
 
139 aa  60.8  0.000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3164  UspA domain protein  30.14 
 
 
156 aa  60.5  0.000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1016  UspA domain-containing protein  30.2 
 
 
149 aa  60.5  0.000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.597353  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  29.93 
 
 
153 aa  60.5  0.000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5277  UspA domain protein  28.97 
 
 
308 aa  60.5  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  28.47 
 
 
151 aa  60.5  0.000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0690  universal stress protein family  29.93 
 
 
140 aa  60.1  0.000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0108874  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2199  universal stress protein  32.62 
 
 
139 aa  59.7  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0144  universal stress protein  34 
 
 
156 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  28.87 
 
 
150 aa  60.1  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4648  universal stress protein family  29.25 
 
 
140 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000011295  unclonable  2.43078e-26 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0170  universal stress protein  34 
 
 
200 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1035  universal stress protein  34 
 
 
156 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.883979  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4434  UspA domain protein  33.33 
 
 
166 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2771  universal stress protein  34 
 
 
156 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.778243  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  30.61 
 
 
150 aa  59.7  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2628  universal stress family protein  34 
 
 
156 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1315  universal stress protein  34 
 
 
156 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4567  UspA domain protein  33.33 
 
 
166 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.233455  normal  0.128301 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2648  universal stress protein  30.99 
 
 
309 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0566  universal stress protein  31.91 
 
 
140 aa  59.3  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1083  UspA domain-containing protein  24.83 
 
 
449 aa  58.9  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000280681  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5241  UspA domain protein  32.26 
 
 
154 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.639442 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3987  UspA domain protein  41.86 
 
 
164 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1853  universal stress protein  31.97 
 
 
168 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.499137  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  29.58 
 
 
138 aa  59.3  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3827  putative universal stress protein  34.48 
 
 
187 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0622  universal stress protein  31.91 
 
 
140 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0565  universal stress protein  31.91 
 
 
140 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0711  universal stress protein family  31.91 
 
 
140 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0445079 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2727  universal stress protein  31.29 
 
 
140 aa  58.5  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0654  universal stress protein  31.91 
 
 
140 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1573  UspA domain protein  30.07 
 
 
149 aa  58.5  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0783  universal stress protein family  31.91 
 
 
140 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  30.28 
 
 
150 aa  58.2  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  27.15 
 
 
149 aa  58.2  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0589  universal stress protein  31.69 
 
 
140 aa  58.2  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.558284  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7012  UspA domain-containing protein  29.93 
 
 
156 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305575  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0568  UspA domain-containing protein  31.91 
 
 
140 aa  58.2  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2401  UspA domain-containing protein  36.73 
 
 
140 aa  58.2  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.499037 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4029  UspA domain protein  40.7 
 
 
164 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1409  UspA domain protein  26.53 
 
 
140 aa  57.8  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.554815 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4616  UspA domain protein  28.37 
 
 
141 aa  57.4  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1939  UspA domain-containing protein  30 
 
 
157 aa  57.4  0.00000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0722  universal stress protein  28.57 
 
 
140 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>