More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1272 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_1272  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 145 aa  283  4e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3459  hypothetical protein  73.1 
 
 		 145 aa  215  1e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.450632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2198  hypothetical protein  64.83 
 
 		 145 aa  171  1.9999999999999998e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.76051  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4356  UspA domain-containing protein  56.55 
 
 		 145 aa  166  1e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244024  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1732  UspA domain protein  63.01 
 
 		 146 aa  164  2.9999999999999998e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1929  UspA domain-containing protein  63.01 
 
 		 146 aa  164  2.9999999999999998e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3154  UspA domain-containing protein  59.54 
 
 		 145 aa  147  5e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.759591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0644  UspA domain-containing protein  59.31 
 
 		 145 aa  141  3e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.577691 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3655  UspA domain protein  54.86 
 
 		 147 aa  135  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.850888  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2088  UspA domain-containing protein  40.14 
 
 		 153 aa  102  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0358891 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2524  UspA domain-containing protein  38.89 
 
 		 149 aa  97.1  7e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3338  UspA domain-containing protein  35.42 
 
 		 144 aa  91.3  4e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5738  UspA domain-containing protein  39.31 
 
 		 155 aa  89.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.192477 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4485  UspA domain-containing protein  39.31 
 
 		 155 aa  89.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5121  hypothetical protein  39.31 
 
 		 155 aa  89.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2637  hypothetical protein  36.11 
 
 		 144 aa  89.7  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.163827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3137  universal stress protein  37.93 
 
 		 155 aa  88.6  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1228  UspA domain-containing protein  36.11 
 
 		 144 aa  87.8  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.156365 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1997  universal stress protein  37.84 
 
 		 144 aa  88.2  4e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0827286  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2525  universal stress family protein  37.16 
 
 		 144 aa  87  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245766  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1587  universal stress protein  37.16 
 
 		 144 aa  87  7e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.240234  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2614  universal stress protein family protein  37.16 
 
 		 144 aa  87  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.586253  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1362  universal stress family protein  37.16 
 
 		 144 aa  87  7e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2471  universal stress family protein  37.16 
 
 		 144 aa  87  7e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3223  universal stress protein  37.16 
 
 		 144 aa  87  7e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0267  universal stress protein  35.86 
 
 		 145 aa  87  7e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.793437  normal  0.0161119 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2089  universal stress protein  37.16 
 
 		 144 aa  87  7e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000150804  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5296  UspA domain-containing protein  36.55 
 
 		 158 aa  86.3  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2487  UspA domain protein  37.16 
 
 		 144 aa  86.3  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0465125  hitchhiker  0.000264577 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0463  UspA domain-containing protein  38.16 
 
 		 146 aa  85.5  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0991  hypothetical protein  35.37 
 
 		 147 aa  85.5  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1951  UspA domain-containing protein  36.11 
 
 		 144 aa  85.9  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.348575 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2081  UspA domain-containing protein  36.11 
 
 		 144 aa  85.9  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1369  UspA domain-containing protein  35.42 
 
 		 144 aa  85.5  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.981582 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1173  UspA domain-containing protein  35.57 
 
 		 147 aa  85.1  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.761945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3150  UspA domain-containing protein  36.55 
 
 		 155 aa  85.1  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5009  UspA domain-containing protein  36.55 
 
 		 156 aa  85.1  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1926  hypothetical protein  36.49 
 
 		 147 aa  84.3  4e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0052  universal stress protein  37.24 
 
 		 155 aa  84.3  5e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1650  universal stress protein  36.49 
 
 		 144 aa  84.3  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.629264  normal  0.0236614 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  40.56 
 
 		 290 aa  84.3  5e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4434  UspA domain-containing protein  35.86 
 
 		 158 aa  84  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947422 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5358  universal stress protein  35.42 
 
 		 144 aa  83.6  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.974267  normal  0.233102 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  36.49 
 
 		 156 aa  84  7e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3368  hypothetical protein  39.04 
 
 		 146 aa  83.6  8e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  36.99 
 
 		 144 aa  83.6  8e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  36.49 
 
 		 153 aa  83.2  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1016  UspA domain-containing protein  37.58 
 
 		 149 aa  83.2  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.597353  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3792  UspA domain protein  36 
 
 		 151 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4869  UspA domain protein  36 
 
 		 151 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0991837 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0038  universal stress family protein  36.55 
 
 		 155 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.98264  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0036  universal stress protein  37.24 
 
 		 155 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1387  hypothetical protein  34.03 
 
 		 144 aa  82.8  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00373989  normal  0.527764 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1284  UspA domain protein  38.78 
 
 		 147 aa  82.8  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1352  UspA domain protein  35.62 
 
 		 146 aa  82.8  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.012903 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0032  universal stress protein  36.55 
 
 		 155 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0038  universal stress protein  36.55 
 
 		 155 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283622  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1465  universal stress protein  36.55 
 
 		 155 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1567  universal stress protein  36.91 
 
 		 164 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.84315  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4451  universal stress protein UspA  34.67 
 
 		 161 aa  82  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.15852  normal  0.144884 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1185  universal stress protein  36.55 
 
 		 155 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1676  hypothetical protein  37.67 
 
 		 143 aa  82  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.631803 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  34.72 
 
 		 145 aa  80.9  0.000000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  35.42 
 
 		 145 aa  80.9  0.000000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0442  universal stress protein  37.58 
 
 		 200 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3206  UspA domain protein  37.24 
 
 		 151 aa  80.5  0.000000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.158502 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4273  UspA domain protein  38.1 
 
 		 155 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.664066 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2815  UspA domain protein  34.9 
 
 		 147 aa  80.5  0.000000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0183337  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0788  UspA domain-containing protein  33.11 
 
 		 147 aa  80.5  0.000000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.523142 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  35.86 
 
 		 148 aa  80.1  0.000000000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  32.87 
 
 		 164 aa  80.1  0.000000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  34.72 
 
 		 145 aa  80.1  0.000000000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4308  hypothetical protein  34.23 
 
 		 147 aa  80.1  0.000000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00896563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2068  UspA domain-containing protein  35.42 
 
 		 144 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.960208  normal  0.914393 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  31.94 
 
 		 158 aa  79.7  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6028  hypothetical protein  35.42 
 
 		 144 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.999121  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2049  UspA domain-containing protein  35.42 
 
 		 144 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.765605  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  33.79 
 
 		 180 aa  79.3  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0432  UspA domain protein  34.72 
 
 		 144 aa  79.3  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2829  UspA domain protein  33.56 
 
 		 169 aa  79.3  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0510043  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1196  UspA domain-containing protein  35.42 
 
 		 142 aa  78.2  0.00000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196709  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0997  UspA domain protein  32.43 
 
 		 147 aa  78.6  0.00000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1081  UspA domain-containing protein  32.43 
 
 		 147 aa  78.6  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0952859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  37.33 
 
 		 163 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  33.33 
 
 		 144 aa  78.6  0.00000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  33.57 
 
 		 150 aa  77.8  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  36.73 
 
 		 155 aa  77.8  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4260  UspA domain protein  37.91 
 
 		 148 aa  78.2  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.290835  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  34.03 
 
 		 145 aa  78.2  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  31.25 
 
 		 150 aa  77.4  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  40.69 
 
 		 280 aa  77.8  0.00000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0848  hypothetical protein  33.33 
 
 		 142 aa  77.8  0.00000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957853  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0228  UspA domain protein  36.99 
 
 		 144 aa  77.4  0.00000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.115538 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  34.72 
 
 		 148 aa  77.4  0.00000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1112  hypothetical protein  33.1 
 
 		 144 aa  77  0.00000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.619921  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6200  UspA domain-containing protein  38.67 
 
 		 163 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371788  normal  0.304824 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1821  UspA domain-containing protein  34.46 
 
 		 147 aa  77  0.00000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1954  hypothetical protein  31.94 
 
 		 144 aa  77  0.00000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4660  putative universal stress protein (Usp)  33.97 
 
 		 144 aa  77  0.00000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.969367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0916  hypothetical protein  30.82 
 
 		 173 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>