More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2767 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  100 
 
 		 139 aa  276  8e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  42.34 
 
 		 147 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  41.43 
 
 		 128 aa  97.1  7e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6565  UspA domain-containing protein  39.44 
 
 		 161 aa  96.3  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.363872  normal  0.275495 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1196  UspA domain-containing protein  41.26 
 
 		 142 aa  89.7  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196709  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  37.32 
 
 		 150 aa  89.4  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  33.55 
 
 		 141 aa  87.4  6e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0081  UspA domain protein  36.36 
 
 		 143 aa  87  8e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324283  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  35.17 
 
 		 143 aa  84.3  4e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  34.29 
 
 		 150 aa  84.3  6e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1249  hypothetical protein  32.21 
 
 		 154 aa  84  7e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.17939  normal  0.197708 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  37.82 
 
 		 153 aa  83.6  9e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.678787 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  35.92 
 
 		 139 aa  81.6  0.000000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  39.58 
 
 		 162 aa  81.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  33.8 
 
 		 142 aa  81.3  0.000000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  33.79 
 
 		 152 aa  80.1  0.000000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5355  UspA domain protein  33.56 
 
 		 148 aa  80.1  0.000000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  37.41 
 
 		 208 aa  80.1  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2415  UspA domain protein  38.19 
 
 		 162 aa  79.7  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2502  UspA domain protein  38.19 
 
 		 162 aa  79.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.187507  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  33.33 
 
 		 148 aa  78.6  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  34.97 
 
 		 143 aa  79  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1017  UspA domain-containing protein  34.97 
 
 		 138 aa  79.3  0.00000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0550941 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  32.37 
 
 		 207 aa  78.6  0.00000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  31.43 
 
 		 164 aa  78.2  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  34.25 
 
 		 156 aa  77.8  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  38.03 
 
 		 156 aa  77.8  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2278  UspA domain protein  35.92 
 
 		 143 aa  77.4  0.00000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  31.94 
 
 		 145 aa  77.4  0.00000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  33.33 
 
 		 150 aa  77.4  0.00000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1664  UspA domain-containing protein  35.95 
 
 		 156 aa  77.4  0.00000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  30.77 
 
 		 152 aa  77  0.00000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4069  UspA domain-containing protein  35.42 
 
 		 162 aa  77  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0307561  normal  0.903316 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  33.56 
 
 		 147 aa  76.6  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  36.17 
 
 		 138 aa  76.6  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0804  UspA domain protein  37.41 
 
 		 138 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.380791 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  32.86 
 
 		 145 aa  76.3  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0848  hypothetical protein  31.69 
 
 		 142 aa  75.5  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1231  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  33.33 
 
 		 162 aa  75.9  0.0000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0928925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  32.62 
 
 		 145 aa  75.9  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  32.19 
 
 		 151 aa  75.1  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4775  UspA domain protein  34.75 
 
 		 141 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  31.21 
 
 		 145 aa  75.1  0.0000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  34.25 
 
 		 153 aa  75.1  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  34.03 
 
 		 144 aa  75.5  0.0000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2586  universal stress protein  33.82 
 
 		 141 aa  74.7  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0483395  normal  0.125899 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0309  hypothetical protein  30.26 
 
 		 142 aa  74.3  0.0000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0384  UspA domain protein  32.24 
 
 		 142 aa  74.3  0.0000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150335  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2109  UspA domain-containing protein  34.53 
 
 		 128 aa  73.9  0.0000000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  33.33 
 
 		 180 aa  74.3  0.0000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  33.09 
 
 		 156 aa  74.3  0.0000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0780  UspA domain protein  33.8 
 
 		 142 aa  73.9  0.0000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608906  normal  0.0365188 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1858  UspA domain protein  35.14 
 
 		 147 aa  73.9  0.0000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  31.65 
 
 		 140 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2050  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  28.67 
 
 		 143 aa  73.6  0.0000000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.450915  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  30.41 
 
 		 156 aa  72.8  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0954  UspA domain protein  32.61 
 
 		 140 aa  73.2  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.548739  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0826  universal stress protein  33.57 
 
 		 165 aa  73.2  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4203  hypothetical protein  35.46 
 
 		 141 aa  73.6  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.470587 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1933  UspA domain-containing protein  32.45 
 
 		 141 aa  72.8  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  31.91 
 
 		 145 aa  73.2  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  33.33 
 
 		 157 aa  72.4  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  33.09 
 
 		 149 aa  72.4  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  37.59 
 
 		 288 aa  72.4  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  40.14 
 
 		 151 aa  72.4  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0943  UspA domain protein  32.64 
 
 		 151 aa  72  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0887098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3202  UspA domain protein  30.2 
 
 		 151 aa  71.6  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.805747  normal  0.0850987 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  34.01 
 
 		 148 aa  71.6  0.000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4616  UspA domain protein  32.39 
 
 		 141 aa  71.6  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2792  UspA domain-containing protein  34.23 
 
 		 162 aa  70.9  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.276612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3459  hypothetical protein  34.25 
 
 		 145 aa  70.9  0.000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.450632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  32.21 
 
 		 140 aa  70.9  0.000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1169  UspA family nucleotide-binding protein  31.21 
 
 		 142 aa  70.9  0.000000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0164602  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0620  UspA domain-containing protein  34.69 
 
 		 144 aa  70.5  0.000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  31.47 
 
 		 148 aa  70.1  0.000000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  32.14 
 
 		 150 aa  69.7  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  35.42 
 
 		 290 aa  69.7  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  34.72 
 
 		 138 aa  69.3  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5381  UspA domain-containing protein  34.25 
 
 		 162 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0480  UspA domain protein  30.94 
 
 		 144 aa  70.1  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  33.57 
 
 		 153 aa  70.1  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  31.29 
 
 		 143 aa  68.9  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1678  UspA domain-containing protein  30.82 
 
 		 155 aa  68.9  0.00000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.222334  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0442  universal stress protein  34.93 
 
 		 200 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4356  UspA domain-containing protein  31.94 
 
 		 145 aa  69.3  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244024  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1307  UspA domain protein  34.48 
 
 		 153 aa  68.6  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.476613  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4568  hypothetical protein  31.21 
 
 		 173 aa  68.6  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3774  UspA domain-containing protein  38.78 
 
 		 317 aa  68.2  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.143188  normal  0.471237 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03760  universal stress protein UspA-like protein  34.19 
 
 		 154 aa  68.6  0.00000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00361063  normal  0.318246 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  31.08 
 
 		 155 aa  68.6  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  31.65 
 
 		 144 aa  68.6  0.00000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1803  UspA domain protein  34.75 
 
 		 143 aa  68.2  0.00000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0276  UspA domain protein  31.72 
 
 		 138 aa  68.2  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2088  UspA domain-containing protein  31.54 
 
 		 153 aa  68.2  0.00000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0358891 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1230  UspA domain-containing protein  32.43 
 
 		 137 aa  67.8  0.00000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2521  hypothetical protein  31.94 
 
 		 142 aa  67.8  0.00000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.212811  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0224  UspA domain protein  34.97 
 
 		 151 aa  67.8  0.00000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.483112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1272  UspA domain-containing protein  31.47 
 
 		 145 aa  67.8  0.00000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  29.45 
 
 		 153 aa  67.4  0.00000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0128  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  27.52 
 
 		 164 aa  67.4  0.00000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000319103  hitchhiker  0.0000000012302 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>