More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0174 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_0174  UspA domain protein  100 
 
 
144 aa  285  1e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.102969  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0631  UspA domain protein  40.14 
 
 
160 aa  86.7  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113911  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1585  UspA domain protein  39.46 
 
 
142 aa  83.6  9e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2411  UspA domain protein  37.06 
 
 
146 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000128611  normal  0.369799 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  35.86 
 
 
141 aa  75.5  0.0000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1409  UspA domain protein  37.76 
 
 
140 aa  73.6  0.0000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.554815 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1529  UspA domain protein  31.47 
 
 
141 aa  71.2  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3816  UspA domain protein  31.03 
 
 
142 aa  70.9  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0222227  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  32 
 
 
143 aa  68.9  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 
144 aa  68.9  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0568  UspA domain-containing protein  30.77 
 
 
140 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0566  universal stress protein  29.37 
 
 
140 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0722  universal stress protein  29.37 
 
 
140 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3847  UspA domain protein  31.76 
 
 
145 aa  67.4  0.00000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000916772  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0081  UspA domain protein  32.67 
 
 
143 aa  67  0.00000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324283  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0622  universal stress protein  29.37 
 
 
140 aa  67  0.00000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0565  universal stress protein  29.37 
 
 
140 aa  67  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0783  universal stress protein family  29.37 
 
 
140 aa  67  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0654  universal stress protein  29.37 
 
 
140 aa  67  0.00000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0711  universal stress protein family  29.37 
 
 
140 aa  67  0.00000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0445079 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0690  universal stress protein family  30.07 
 
 
140 aa  67  0.00000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0108874  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2199  universal stress protein  32.17 
 
 
139 aa  67  0.00000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4648  universal stress protein family  29.37 
 
 
140 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000011295  unclonable  2.43078e-26 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2222  hypothetical protein  30.2 
 
 
156 aa  65.1  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.544254  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  29.45 
 
 
139 aa  64.7  0.0000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  31.94 
 
 
128 aa  64.7  0.0000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2727  universal stress protein  34.25 
 
 
140 aa  64.7  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1768  UspA domain-containing protein  31.29 
 
 
140 aa  64.7  0.0000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1803  UspA domain protein  33.33 
 
 
143 aa  64.3  0.0000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  34.27 
 
 
143 aa  64.3  0.0000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2109  UspA domain-containing protein  33.79 
 
 
128 aa  63.5  0.0000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  33.57 
 
 
149 aa  63.2  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  32.89 
 
 
142 aa  62.8  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1591  hypothetical protein  33.1 
 
 
141 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1517  UspA domain protein  30.07 
 
 
148 aa  61.6  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.346414  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1759  universal stress protein  34.09 
 
 
298 aa  61.2  0.000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3264  UspA domain protein  31.97 
 
 
141 aa  61.6  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2716  UspA domain protein  28.67 
 
 
154 aa  61.6  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  30.61 
 
 
145 aa  61.2  0.000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1945  UspA domain-containing protein  31.47 
 
 
139 aa  60.8  0.000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  30.87 
 
 
150 aa  60.5  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3866  hypothetical protein  29.86 
 
 
152 aa  60.8  0.000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.108165  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  29.93 
 
 
145 aa  60.5  0.000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1559  UspA domain protein  28.67 
 
 
147 aa  59.7  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.411505 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2474  hypothetical protein  29.86 
 
 
141 aa  60.1  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01240  universal stress protein UspA-like protein  36 
 
 
144 aa  59.7  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8721  UspA domain protein  35.53 
 
 
166 aa  59.7  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0485057  normal  0.0484371 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  27.27 
 
 
164 aa  59.3  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2278  UspA domain protein  30.41 
 
 
143 aa  58.9  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1659  UspA domain-containing protein  28.57 
 
 
140 aa  58.9  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0833  UspA domain protein  31.14 
 
 
169 aa  58.9  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.139589  normal  0.670884 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  29.86 
 
 
151 aa  58.5  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3085  hypothetical protein  36.84 
 
 
303 aa  58.5  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  29.93 
 
 
145 aa  58.5  0.00000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  30.56 
 
 
147 aa  57.8  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1017  UspA domain-containing protein  31.47 
 
 
138 aa  58.2  0.00000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0550941 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3808  UspA domain protein  30.2 
 
 
147 aa  57.4  0.00000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3218  universal stress protein  37.08 
 
 
120 aa  57.4  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0127245 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2401  UspA domain-containing protein  28.47 
 
 
140 aa  57.4  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.499037 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1124  UspA domain-containing protein  26.39 
 
 
282 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  33.11 
 
 
139 aa  57.4  0.00000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1230  UspA domain-containing protein  29.05 
 
 
137 aa  57.4  0.00000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1939  UspA domain-containing protein  30.87 
 
 
157 aa  56.6  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2210  universal stress protein UspA  30.82 
 
 
149 aa  57  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1821  UspA domain-containing protein  30.56 
 
 
147 aa  56.2  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1924  UspA domain-containing protein  35.14 
 
 
142 aa  56.6  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.164923 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0253  UspA domain-containing protein  30.56 
 
 
130 aa  56.2  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.157205 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0391  UspA domain-containing protein  31.51 
 
 
142 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.308438 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3922  UspA domain protein  32.89 
 
 
142 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  27.08 
 
 
150 aa  55.5  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0550  UspA domain-containing protein  38.57 
 
 
140 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1659  UspA domain protein  30.14 
 
 
147 aa  55.8  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.452952  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  29.05 
 
 
137 aa  55.8  0.0000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  30.56 
 
 
145 aa  55.8  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4616  UspA domain protein  27.97 
 
 
141 aa  55.5  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3063  hypothetical protein  43.84 
 
 
297 aa  55.1  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  31.25 
 
 
148 aa  54.7  0.0000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0023  universal stress protein  26.76 
 
 
137 aa  54.7  0.0000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  34.01 
 
 
288 aa  54.7  0.0000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1933  UspA domain-containing protein  29.66 
 
 
141 aa  54.7  0.0000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4822  UspA domain-containing protein  31.13 
 
 
289 aa  54.7  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  25.17 
 
 
147 aa  54.7  0.0000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0420  UspA domain protein  31.87 
 
 
164 aa  54.7  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.249948  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0351  UspA domain-containing protein  32.26 
 
 
147 aa  54.7  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0384  UspA domain protein  32.19 
 
 
142 aa  54.7  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150335  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1519  UspA domain-containing protein  32.41 
 
 
148 aa  54.3  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0716802  normal  0.348047 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1677  hypothetical protein  31.54 
 
 
146 aa  54.3  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.884231 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1308  UspA domain protein  30.61 
 
 
145 aa  53.9  0.0000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.437188  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1529  hypothetical protein  30.77 
 
 
136 aa  53.9  0.0000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  30.56 
 
 
140 aa  53.9  0.0000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1331  universal stress protein UspA  31.72 
 
 
140 aa  53.9  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2528  UspA domain protein  31.72 
 
 
140 aa  53.9  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.508947  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0589  universal stress protein  30.46 
 
 
140 aa  53.5  0.0000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.558284  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0788  UspA domain-containing protein  31.25 
 
 
147 aa  53.5  0.0000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.523142 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2714  UspA domain protein  25.87 
 
 
154 aa  53.5  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0337  UspA domain protein  27.21 
 
 
283 aa  53.5  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000175107  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  27.78 
 
 
147 aa  53.5  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  27.27 
 
 
142 aa  53.1  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2624  UspA domain protein  31.03 
 
 
140 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3645  UspA domain-containing protein  27.39 
 
 
151 aa  52  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000262927  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>