More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0825 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  100 
 
 
164 aa  330  7.000000000000001e-90  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0826  universal stress protein  54.55 
 
 
165 aa  161  3e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  48.97 
 
 
150 aa  155  3e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  47.95 
 
 
150 aa  153  1e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  51.77 
 
 
151 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  46.62 
 
 
150 aa  140  7e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  43.15 
 
 
149 aa  137  7.999999999999999e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2586  universal stress protein  45.07 
 
 
141 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0483395  normal  0.125899 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  44.59 
 
 
156 aa  134  8e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  45.45 
 
 
147 aa  133  9.999999999999999e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  43.36 
 
 
145 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  42.57 
 
 
148 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  41.61 
 
 
157 aa  128  3e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  44.37 
 
 
148 aa  122  2e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  39.29 
 
 
145 aa  122  3e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  39.29 
 
 
145 aa  120  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  38.57 
 
 
145 aa  116  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  41.1 
 
 
148 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  35.97 
 
 
180 aa  109  1.0000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  42.36 
 
 
156 aa  107  6e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  39.13 
 
 
290 aa  105  3e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  38.41 
 
 
147 aa  104  5e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1706  universal stress protein  41.67 
 
 
130 aa  102  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0360451  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  41.3 
 
 
143 aa  102  3e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  37.86 
 
 
144 aa  102  3e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0780  UspA domain protein  36.17 
 
 
142 aa  101  5e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608906  normal  0.0365188 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3218  universal stress protein  41.07 
 
 
120 aa  100  8e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0127245 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  37.93 
 
 
155 aa  100  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1308  UspA domain protein  37.93 
 
 
145 aa  99.4  2e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.437188  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  41.13 
 
 
139 aa  99  3e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  39.44 
 
 
143 aa  98.6  3e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3164  UspA domain protein  35.66 
 
 
156 aa  98.2  4e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  33.81 
 
 
152 aa  97.8  5e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1196  UspA domain-containing protein  35 
 
 
142 aa  96.7  1e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196709  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  32.61 
 
 
158 aa  94  7e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  34.75 
 
 
307 aa  93.2  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  33.58 
 
 
159 aa  93.2  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4356  UspA domain-containing protein  36.36 
 
 
145 aa  91.7  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244024  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  36.11 
 
 
153 aa  91.3  5e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  33.12 
 
 
288 aa  90.9  6e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0228  UspA domain protein  37.5 
 
 
144 aa  90.1  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.115538 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0848  hypothetical protein  36.23 
 
 
142 aa  90.1  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957853  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  30.82 
 
 
297 aa  89.7  1e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
144 aa  89.7  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2278  UspA domain protein  37.06 
 
 
143 aa  89  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  33.1 
 
 
208 aa  88.6  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  35.42 
 
 
144 aa  88.2  4e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  36.17 
 
 
138 aa  88.2  5e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3645  UspA domain-containing protein  40.14 
 
 
151 aa  87.8  6e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000262927  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1858  UspA domain protein  35.46 
 
 
147 aa  86.7  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  31.25 
 
 
287 aa  87  1e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  35 
 
 
141 aa  87  1e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0309  hypothetical protein  32.86 
 
 
142 aa  86.3  2e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1519  UspA domain-containing protein  33.56 
 
 
148 aa  85.9  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0716802  normal  0.348047 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  37.14 
 
 
152 aa  85.1  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1573  UspA domain protein  34.75 
 
 
149 aa  85.5  3e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3028  hypothetical protein  35.37 
 
 
151 aa  85.5  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0763744  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  31.79 
 
 
300 aa  85.5  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0432  UspA domain protein  34.06 
 
 
144 aa  85.5  3e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0515  universal stress protein  37.41 
 
 
151 aa  85.1  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.0014722  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2198  hypothetical protein  34.97 
 
 
145 aa  85.1  4e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.76051  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2088  UspA domain-containing protein  31.79 
 
 
153 aa  85.1  4e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0358891 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  41.84 
 
 
151 aa  84.3  6e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  32.14 
 
 
207 aa  84.3  7e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5916  UspA domain-containing protein  31.08 
 
 
157 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585154  normal  0.579135 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0997  UspA domain protein  33.56 
 
 
147 aa  83.2  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3070  hypothetical protein  35.71 
 
 
300 aa  83.6  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2204  UspA domain protein  34.44 
 
 
150 aa  83.6  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1081  UspA domain-containing protein  33.56 
 
 
147 aa  83.2  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0952859  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2705  UspA domain protein  36.05 
 
 
151 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000991163 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1511  UspA domain protein  36.05 
 
 
151 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1388  UspA domain protein  33.33 
 
 
145 aa  82.8  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.120958  normal  0.124251 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  36.88 
 
 
153 aa  83.2  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1117  UspA domain-containing protein  34.39 
 
 
156 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656052  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1862  UspA domain protein  35.92 
 
 
141 aa  82  0.000000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0496809 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  34 
 
 
283 aa  82  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2183  hypothetical protein  28.82 
 
 
176 aa  82  0.000000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0570  UspA domain protein  34.56 
 
 
141 aa  82.4  0.000000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.932953  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7012  UspA domain-containing protein  35.37 
 
 
156 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305575  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  29.5 
 
 
156 aa  81.6  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0480  UspA domain protein  32.12 
 
 
144 aa  81.6  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  33.09 
 
 
142 aa  81.6  0.000000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3055  UspA domain protein  30.28 
 
 
142 aa  81.6  0.000000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4348  UspA domain protein  30.34 
 
 
149 aa  81.3  0.000000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0947911  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3815  UspA domain-containing protein  32.88 
 
 
167 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.911542  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  32.88 
 
 
163 aa  81.3  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1659  UspA domain protein  35.57 
 
 
147 aa  79.7  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.452952  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  33.55 
 
 
147 aa  80.5  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1134  UspA domain-containing protein  31.13 
 
 
167 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3085  hypothetical protein  38.51 
 
 
303 aa  79.7  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2059  UspA domain protein  31.97 
 
 
156 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3944  hitchhiker  0.00218931 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1272  UspA domain-containing protein  32.87 
 
 
145 aa  80.1  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  33.33 
 
 
280 aa  79.3  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1382  UspA domain-containing protein  30.94 
 
 
142 aa  79  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.378027 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6185  UspA domain-containing protein  29.37 
 
 
157 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.552133  normal  0.212632 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3403  UspA domain protein  33.33 
 
 
301 aa  79.3  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1601  hypothetical protein  31.13 
 
 
150 aa  79.7  0.00000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.239792  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  35.21 
 
 
140 aa  79.3  0.00000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  31.72 
 
 
281 aa  78.6  0.00000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1567  universal stress protein  31.25 
 
 
164 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.84315  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>