More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2668 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  100 
 
 
159 aa  311  1.9999999999999998e-84  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  76.92 
 
 
158 aa  225  2e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  60.14 
 
 
180 aa  164  5e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  54.17 
 
 
152 aa  150  8.999999999999999e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  52.82 
 
 
148 aa  144  4.0000000000000006e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  42.14 
 
 
150 aa  122  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  52.14 
 
 
144 aa  122  3e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  42.14 
 
 
150 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  42.18 
 
 
148 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  40.43 
 
 
145 aa  116  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  47.71 
 
 
152 aa  114  6.9999999999999995e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  40 
 
 
145 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  39.01 
 
 
145 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  39.72 
 
 
145 aa  112  3e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  42.96 
 
 
149 aa  105  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  43.23 
 
 
156 aa  106  2e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  45.1 
 
 
307 aa  104  4e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0432  UspA domain protein  43.06 
 
 
144 aa  104  6e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  43.79 
 
 
156 aa  104  6e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  40 
 
 
147 aa  103  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  37.59 
 
 
150 aa  101  4e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1388  UspA domain protein  44.76 
 
 
145 aa  99.8  1e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.120958  normal  0.124251 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  43.92 
 
 
153 aa  99.4  2e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  43.26 
 
 
290 aa  99  2e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  40.91 
 
 
155 aa  99  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3164  UspA domain protein  43.54 
 
 
156 aa  99  3e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2586  universal stress protein  40 
 
 
141 aa  98.2  4e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0483395  normal  0.125899 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  41.43 
 
 
147 aa  98.2  4e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  38.57 
 
 
143 aa  97.4  6e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  40.41 
 
 
157 aa  97.4  7e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  36.36 
 
 
148 aa  96.7  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5163  UspA domain protein  43.36 
 
 
145 aa  96.7  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.262292  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  38.46 
 
 
151 aa  96.7  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0848  hypothetical protein  36.43 
 
 
142 aa  96.3  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957853  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  40 
 
 
208 aa  95.9  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  41.26 
 
 
286 aa  94.7  5e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  44.52 
 
 
280 aa  94.4  5e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  33.58 
 
 
164 aa  93.2  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0965  UspA domain protein  43.17 
 
 
152 aa  93.6  1e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2181  UspA domain protein  44.67 
 
 
150 aa  91.7  4e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.313206  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1307  UspA domain protein  42.14 
 
 
153 aa  91.7  4e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.476613  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1334  hypothetical protein  39.62 
 
 
154 aa  91.7  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0586772  normal  0.952223 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  34.44 
 
 
156 aa  91.3  5e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1311  UspA domain protein  40.38 
 
 
187 aa  91.3  5e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.519886  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0916  hypothetical protein  41.5 
 
 
173 aa  90.5  8e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3643  UspA domain protein  44.06 
 
 
141 aa  90.5  9e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0969583  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0833  UspA domain protein  40.61 
 
 
169 aa  90.5  9e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.139589  normal  0.670884 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  37.06 
 
 
143 aa  90.1  1e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2088  UspA domain-containing protein  37.66 
 
 
153 aa  90.1  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0358891 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1573  UspA domain protein  40.71 
 
 
149 aa  89  3e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  39.58 
 
 
154 aa  88.6  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  41.26 
 
 
297 aa  89  3e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  42.45 
 
 
283 aa  88.2  4e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  43.8 
 
 
281 aa  88.2  4e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4350  UspA domain protein  39.72 
 
 
294 aa  88.2  5e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.252521  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  39.16 
 
 
288 aa  87.4  7e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  43.57 
 
 
305 aa  87.4  7e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4014  UspA domain protein  40 
 
 
136 aa  87  9e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3405  UspA domain protein  40.56 
 
 
150 aa  87  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2887  UspA domain-containing protein  40.76 
 
 
325 aa  86.7  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535797  normal  0.92135 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  38.3 
 
 
300 aa  86.3  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0826  universal stress protein  29.93 
 
 
165 aa  86.7  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2298  UspA domain-containing protein  40 
 
 
164 aa  86.7  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178234  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2552  UspA domain protein  34.48 
 
 
147 aa  87  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4459099999999997e-20 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  38.73 
 
 
148 aa  85.9  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  40.41 
 
 
148 aa  86.3  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  37.32 
 
 
140 aa  86.3  2e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3733  UspA domain protein  38.16 
 
 
151 aa  85.1  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.217159  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0254  UspA domain protein  38.13 
 
 
288 aa  84.7  4e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.422805 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3438  UspA domain protein  39.13 
 
 
144 aa  85.1  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2198  hypothetical protein  36.36 
 
 
145 aa  84.7  5e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.76051  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0224  UspA domain protein  42.96 
 
 
151 aa  84.3  6e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.483112  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1858  UspA domain protein  39.86 
 
 
147 aa  84.3  6e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1257  UspA domain protein  41.84 
 
 
136 aa  84.3  7e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  40.29 
 
 
287 aa  84  8e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  37.41 
 
 
207 aa  84  8e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3456  UspA domain-containing protein  40.41 
 
 
164 aa  84  9e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0198744  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0228  UspA domain protein  39.86 
 
 
144 aa  83.6  9e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.115538 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3403  UspA domain protein  39.57 
 
 
301 aa  83.6  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2183  hypothetical protein  35.29 
 
 
176 aa  83.6  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4254  UspA domain protein  42.11 
 
 
149 aa  82.8  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1661  UspA domain protein  33.57 
 
 
147 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1196  UspA domain-containing protein  35 
 
 
142 aa  82.8  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196709  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3615  UspA domain protein  40 
 
 
176 aa  82.8  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0603569  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0780  UspA domain protein  33.33 
 
 
142 aa  82  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608906  normal  0.0365188 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2278  UspA domain protein  42.66 
 
 
143 aa  82  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  36.36 
 
 
144 aa  81.6  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  37.76 
 
 
142 aa  82  0.000000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3137  universal stress protein  38.31 
 
 
155 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1862  UspA domain protein  44.14 
 
 
141 aa  81.6  0.000000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0496809 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0570  UspA domain protein  42.76 
 
 
141 aa  81.6  0.000000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.932953  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  43.15 
 
 
415 aa  81.3  0.000000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  32.41 
 
 
147 aa  81.3  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5296  UspA domain-containing protein  37.5 
 
 
158 aa  81.3  0.000000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0480  UspA domain protein  40 
 
 
144 aa  80.9  0.000000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1308  UspA domain protein  39.58 
 
 
145 aa  80.1  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.437188  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  34.27 
 
 
149 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1197  hypothetical protein  38.16 
 
 
151 aa  79.7  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  36.73 
 
 
150 aa  79.7  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0702  UspA domain protein  38.96 
 
 
282 aa  79.3  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>