More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2577 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  100 
 
 
148 aa  287  4e-77  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  56.74 
 
 
152 aa  151  2.9999999999999998e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  53.52 
 
 
158 aa  145  1.0000000000000001e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  52.82 
 
 
159 aa  144  4.0000000000000006e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  51.75 
 
 
180 aa  137  3.9999999999999997e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  45.39 
 
 
150 aa  119  9.999999999999999e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  41.67 
 
 
150 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  44.29 
 
 
147 aa  104  5e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  40.28 
 
 
145 aa  104  5e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  39.58 
 
 
150 aa  103  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  38.89 
 
 
145 aa  102  1e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  39.58 
 
 
145 aa  102  2e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  39.86 
 
 
145 aa  101  3e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  40.43 
 
 
148 aa  101  3e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  41.96 
 
 
151 aa  100  7e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  43.36 
 
 
152 aa  100  9e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  41.26 
 
 
286 aa  97.8  4e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  38.57 
 
 
148 aa  97.4  6e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  41.84 
 
 
149 aa  96.3  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2586  universal stress protein  41.48 
 
 
141 aa  95.5  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0483395  normal  0.125899 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  37.41 
 
 
157 aa  95.9  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3405  UspA domain protein  44.06 
 
 
150 aa  95.5  2e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  43.17 
 
 
144 aa  95.5  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  40.44 
 
 
143 aa  95.1  3e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0848  hypothetical protein  39.29 
 
 
142 aa  94.4  5e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957853  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  41.96 
 
 
297 aa  94  6e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  37.86 
 
 
147 aa  93.6  8e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0965  UspA domain protein  41.73 
 
 
152 aa  93.2  1e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  40.14 
 
 
156 aa  92.4  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0432  UspA domain protein  39.58 
 
 
144 aa  91.7  3e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3733  UspA domain protein  42.07 
 
 
151 aa  91.7  3e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.217159  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1196  UspA domain-containing protein  38.97 
 
 
142 aa  90.9  6e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196709  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  39.58 
 
 
208 aa  90.5  7e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1573  UspA domain protein  39.86 
 
 
149 aa  90.5  7e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  42.18 
 
 
307 aa  90.5  7e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  38.57 
 
 
156 aa  90.1  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1388  UspA domain protein  39.86 
 
 
145 aa  89.7  1e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.120958  normal  0.124251 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  41.13 
 
 
300 aa  89  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  38.51 
 
 
287 aa  89.4  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1334  hypothetical protein  40 
 
 
154 aa  89  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0586772  normal  0.952223 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0228  UspA domain protein  41.26 
 
 
144 aa  87.8  4e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.115538 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  37.75 
 
 
155 aa  87.4  6e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1382  UspA domain-containing protein  35.71 
 
 
142 aa  86.7  9e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.378027 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2547  UspA domain protein  40 
 
 
306 aa  86.3  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1311  UspA domain protein  39.31 
 
 
187 aa  85.5  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.519886  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1307  UspA domain protein  41.5 
 
 
153 aa  85.5  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.476613  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0570  UspA domain protein  39.61 
 
 
141 aa  84.7  4e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.932953  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0833  UspA domain protein  37.58 
 
 
169 aa  84.7  4e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.139589  normal  0.670884 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1489  UspA domain-containing protein  39.13 
 
 
137 aa  84.3  5e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.854212 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  42.14 
 
 
280 aa  84.3  5e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4273  UspA domain protein  40.41 
 
 
155 aa  84.3  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.664066 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  40.14 
 
 
305 aa  83.6  8e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  39.73 
 
 
290 aa  83.6  9e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  36.11 
 
 
156 aa  83.2  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4350  UspA domain protein  39.01 
 
 
294 aa  82.8  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.252521  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  36.73 
 
 
149 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0904  hypothetical protein  33.78 
 
 
157 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381712  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7012  UspA domain-containing protein  36.67 
 
 
156 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305575  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0607  putative universal stress-related protein  41.1 
 
 
155 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.135512 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3456  UspA domain-containing protein  37.93 
 
 
164 aa  82.8  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0198744  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4745  hypothetical protein  36.73 
 
 
151 aa  82  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.829975  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5163  UspA domain protein  38.46 
 
 
145 aa  82  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.262292  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1308  UspA domain protein  36.17 
 
 
145 aa  82.4  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.437188  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4434  UspA domain-containing protein  40.41 
 
 
158 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.947422 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2016  universal stress protein UspA-like protein  35.33 
 
 
148 aa  81.6  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  34.29 
 
 
145 aa  82  0.000000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0038  universal stress family protein  40.69 
 
 
155 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.98264  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1117  UspA domain-containing protein  35.62 
 
 
156 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656052  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  42.47 
 
 
281 aa  82  0.000000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0032  universal stress protein  40.69 
 
 
155 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1706  universal stress protein  39.02 
 
 
130 aa  81.6  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0360451  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1570  UspA domain protein  35.57 
 
 
154 aa  81.3  0.000000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1230  UspA domain-containing protein  34.78 
 
 
137 aa  81.3  0.000000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1185  universal stress protein  40.69 
 
 
155 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1465  universal stress protein  40.69 
 
 
155 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0038  universal stress protein  40.69 
 
 
155 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283622  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  40.67 
 
 
142 aa  80.9  0.000000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0036  universal stress protein  40.69 
 
 
155 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  38.19 
 
 
148 aa  80.9  0.000000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  38.73 
 
 
148 aa  80.5  0.000000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  34.03 
 
 
145 aa  80.9  0.000000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5381  UspA domain-containing protein  37.33 
 
 
162 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2204  UspA domain protein  35.51 
 
 
150 aa  80.1  0.000000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3681  UspA domain protein  40.56 
 
 
301 aa  79.3  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0916  hypothetical protein  37.58 
 
 
173 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3164  UspA domain protein  37.09 
 
 
156 aa  79.7  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5580  UspA domain protein  37.42 
 
 
168 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.88885  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  36.18 
 
 
153 aa  79.7  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0224  UspA domain protein  40.56 
 
 
151 aa  79.7  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.483112  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0052  universal stress protein  40 
 
 
155 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3055  UspA domain protein  38.89 
 
 
142 aa  79  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  36.11 
 
 
170 aa  79  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  36.11 
 
 
170 aa  79  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1853  universal stress protein  35.86 
 
 
168 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.499137  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1083  UspA domain-containing protein  33.77 
 
 
449 aa  79.3  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000280681  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3827  putative universal stress protein  36.36 
 
 
187 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3346  hypothetical protein  35.86 
 
 
156 aa  79  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0885774  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  33.57 
 
 
145 aa  79.3  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0762  UspA domain protein  38.73 
 
 
146 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0337  UspA domain-containing protein  35.51 
 
 
137 aa  79  0.00000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>