More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4350 on replicon NC_013744
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013744  Htur_4350  UspA domain protein  100 
 
 
294 aa  559  1e-158  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.252521  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  38.23 
 
 
290 aa  151  1e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  34.92 
 
 
307 aa  134  9.999999999999999e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  35.29 
 
 
297 aa  126  4.0000000000000003e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  34.3 
 
 
305 aa  122  5e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  33.33 
 
 
286 aa  109  6e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  35.47 
 
 
280 aa  107  3e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  32.53 
 
 
287 aa  103  4e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  32.09 
 
 
288 aa  101  1e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  30.23 
 
 
300 aa  100  3e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  34.68 
 
 
281 aa  100  4e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3813  UspA domain protein  32.78 
 
 
283 aa  99.8  5e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3403  UspA domain protein  30.87 
 
 
301 aa  98.6  1e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  32.76 
 
 
283 aa  98.2  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3681  UspA domain protein  30.13 
 
 
301 aa  93.6  4e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  31.77 
 
 
415 aa  92.8  7e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  35.92 
 
 
148 aa  89.7  5e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2887  UspA domain-containing protein  31.6 
 
 
325 aa  88.2  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535797  normal  0.92135 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  39.35 
 
 
152 aa  87.8  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  39.72 
 
 
159 aa  87.8  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0965  UspA domain protein  42.25 
 
 
152 aa  87.8  2e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  39.72 
 
 
158 aa  87.8  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  38.73 
 
 
143 aa  87.4  2e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0228  UspA domain protein  39.16 
 
 
144 aa  88.2  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.115538 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  39.16 
 
 
147 aa  86.7  5e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  37.59 
 
 
145 aa  85.5  9e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3798  UspA domain protein  30.38 
 
 
281 aa  85.5  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  37.59 
 
 
180 aa  84.3  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1573  UspA domain protein  36.24 
 
 
149 aa  84.7  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  38.93 
 
 
152 aa  84  0.000000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  34.72 
 
 
148 aa  83.6  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3176  UspA domain protein  29.68 
 
 
291 aa  84  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  39.01 
 
 
148 aa  82.8  0.000000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  36.17 
 
 
145 aa  82.4  0.000000000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  37.76 
 
 
145 aa  81.6  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2084  UspA domain protein  33.8 
 
 
140 aa  81.3  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  40.54 
 
 
155 aa  81.3  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  38.85 
 
 
149 aa  81.3  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  37.5 
 
 
145 aa  81.3  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  38.89 
 
 
148 aa  80.9  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  40.56 
 
 
144 aa  81.3  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3405  UspA domain protein  38.89 
 
 
150 aa  80.5  0.00000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0607  putative universal stress-related protein  34.87 
 
 
155 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.135512 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0327  UspA domain protein  28.52 
 
 
305 aa  79.7  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.81164 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  34.01 
 
 
150 aa  79.7  0.00000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3164  UspA domain protein  35.37 
 
 
156 aa  79.3  0.00000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3824  UspA domain protein  32.52 
 
 
295 aa  79.3  0.00000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  35 
 
 
150 aa  78.6  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1382  UspA domain-containing protein  36.88 
 
 
142 aa  78.6  0.0000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.378027 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3733  UspA domain protein  34.67 
 
 
151 aa  78.6  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.217159  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0848  hypothetical protein  34.75 
 
 
142 aa  78.6  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957853  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  36.36 
 
 
144 aa  77.4  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4273  UspA domain protein  35.76 
 
 
155 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.664066 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  31.51 
 
 
157 aa  77  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  35.37 
 
 
156 aa  77.4  0.0000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3643  UspA domain protein  36.81 
 
 
141 aa  77.4  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0969583  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  29.33 
 
 
304 aa  76.6  0.0000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  32.14 
 
 
147 aa  76.3  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  38.46 
 
 
156 aa  76.3  0.0000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1307  UspA domain protein  38.69 
 
 
153 aa  76.3  0.0000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.476613  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0833  UspA domain protein  32.16 
 
 
169 aa  75.9  0.0000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.139589  normal  0.670884 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  35.46 
 
 
150 aa  75.9  0.0000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1525  universal stress family protein  28.16 
 
 
315 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  27.8 
 
 
314 aa  75.5  0.0000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1610  universal stress family protein  28.16 
 
 
315 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0105  universal stress protein  28.43 
 
 
319 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1388  UspA domain protein  36.88 
 
 
145 aa  74.3  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.120958  normal  0.124251 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3070  hypothetical protein  28.62 
 
 
300 aa  74.7  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  37.16 
 
 
153 aa  74.3  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  32.14 
 
 
141 aa  73.6  0.000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1134  UspA domain-containing protein  34.9 
 
 
167 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2164  UspA domain protein  39.44 
 
 
154 aa  73.6  0.000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1268  universal stress protein  29.37 
 
 
315 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  35.92 
 
 
148 aa  73.6  0.000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4434  UspA domain-containing protein  31.21 
 
 
158 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.947422 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5818  UspA domain-containing protein  34.9 
 
 
153 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0832063 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  32.37 
 
 
164 aa  73.2  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1414  UspA domain-containing protein  31.49 
 
 
300 aa  73.2  0.000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1641  UspA domain-containing protein  28.62 
 
 
294 aa  73.2  0.000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  35.21 
 
 
208 aa  72.8  0.000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  36.03 
 
 
143 aa  72.8  0.000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6968  UspA domain protein  34.25 
 
 
147 aa  71.6  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483791  normal  0.0402006 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  34.51 
 
 
142 aa  72  0.00000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  32.39 
 
 
151 aa  70.9  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1677  hypothetical protein  35.21 
 
 
146 aa  71.2  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.884231 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1409  UspA domain protein  44.64 
 
 
118 aa  71.2  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.379594  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  29.08 
 
 
320 aa  70.5  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  29.63 
 
 
152 aa  70.1  0.00000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0101  UspA domain protein  30.03 
 
 
273 aa  70.5  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  32.14 
 
 
138 aa  70.1  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_002936  DET0640  universal stress protein  22.3 
 
 
287 aa  69.7  0.00000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0172387  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0224  UspA domain protein  37.25 
 
 
151 aa  69.7  0.00000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.483112  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30750  universal stress protein UspA-like protein  32.11 
 
 
305 aa  69.7  0.00000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.537439  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1803  UspA domain protein  35.46 
 
 
143 aa  69.3  0.00000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1196  UspA domain-containing protein  36.17 
 
 
142 aa  69.3  0.00000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196709  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3137  universal stress protein  30.2 
 
 
155 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3170  hypothetical protein  29.1 
 
 
294 aa  68.9  0.00000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3827  putative universal stress protein  30.2 
 
 
187 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2179  universal stress protein  32.86 
 
 
146 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0309  hypothetical protein  29.66 
 
 
142 aa  68.6  0.0000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>