More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2547 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013526  Tter_2547  UspA domain protein  100 
 
 
306 aa  591  1e-168  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2567  UspA domain protein  58.36 
 
 
325 aa  298  1e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2546  UspA domain protein  47.47 
 
 
390 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2569  UspA domain protein  42.03 
 
 
291 aa  182  8.000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2560  UspA domain protein  43 
 
 
345 aa  170  3e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1083  UspA domain-containing protein  37.22 
 
 
449 aa  159  6e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000280681  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0912  UspA domain-containing protein  36.36 
 
 
317 aa  131  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0363039 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3776  UspA domain-containing protein  35.57 
 
 
297 aa  130  3e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226753  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2107  UspA domain-containing protein  37.38 
 
 
291 aa  128  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3774  UspA domain-containing protein  36.25 
 
 
317 aa  126  5e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.143188  normal  0.471237 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0914  UspA domain-containing protein  33.67 
 
 
297 aa  123  5e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0612  UspA domain-containing protein  29.77 
 
 
287 aa  121  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  36.05 
 
 
288 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0641  UspA domain-containing protein  34.23 
 
 
314 aa  120  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.562028  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4818  UspA domain protein  35.51 
 
 
321 aa  120  3.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0832286  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0640  universal stress protein  29.77 
 
 
287 aa  118  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0172387  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1584  UspA domain protein  32.34 
 
 
295 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_580  universal stress protein family  28.43 
 
 
287 aa  118  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1762  UspA domain-containing protein  35.71 
 
 
324 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3176  UspA domain protein  35.79 
 
 
291 aa  103  3e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  30.54 
 
 
300 aa  100  3e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  33.12 
 
 
304 aa  99.4  6e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0674  universal stress protein  28.68 
 
 
296 aa  99  9e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3794  UspA domain protein  31.8 
 
 
301 aa  95.9  7e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00697323 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  33.12 
 
 
320 aa  95.1  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  32.69 
 
 
305 aa  94.4  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1111  UspA domain-containing protein  39.72 
 
 
145 aa  94.4  2e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1083  universal stress protein family  39.72 
 
 
145 aa  94  3e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1268  universal stress protein  30.52 
 
 
315 aa  91.3  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  32.19 
 
 
297 aa  90.9  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0943  UspA domain protein  38.93 
 
 
151 aa  89.7  5e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0887098  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2887  UspA domain-containing protein  32.17 
 
 
325 aa  89.7  5e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535797  normal  0.92135 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  30.95 
 
 
281 aa  87.8  2e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  32.2 
 
 
415 aa  88.2  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  29.55 
 
 
286 aa  87.4  3e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  30.87 
 
 
290 aa  87.4  3e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  23.59 
 
 
274 aa  87  4e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  40 
 
 
148 aa  86.3  7e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  30.51 
 
 
307 aa  85.9  8e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3549  UspA domain protein  28.34 
 
 
278 aa  84  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.270172 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1610  universal stress family protein  27.99 
 
 
315 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1525  universal stress family protein  27.99 
 
 
315 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0105  universal stress protein  27.99 
 
 
319 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  23.84 
 
 
276 aa  82.4  0.000000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  27.67 
 
 
287 aa  81.6  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0289  UspA domain protein  26.25 
 
 
289 aa  80.5  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1321  universal stress protein UspA  40.76 
 
 
169 aa  80.5  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3063  hypothetical protein  31.95 
 
 
297 aa  79.7  0.00000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  40.13 
 
 
170 aa  79.3  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  40.13 
 
 
170 aa  79.3  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2815  UspA domain protein  37.24 
 
 
147 aa  79.3  0.00000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0183337  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0254  UspA domain protein  24.03 
 
 
288 aa  79.3  0.00000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.422805 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6247  UspA domain-containing protein  28.16 
 
 
313 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.887249 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3403  UspA domain protein  28.66 
 
 
301 aa  78.6  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1986  UspA domain protein  26.8 
 
 
317 aa  78.6  0.0000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3813  UspA domain protein  30 
 
 
283 aa  79  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  32.88 
 
 
153 aa  77.8  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3714  universal stress protein  34.97 
 
 
143 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.782463  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  42.96 
 
 
159 aa  77.4  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  40.58 
 
 
180 aa  76.6  0.0000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  33.8 
 
 
153 aa  77  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1124  UspA domain-containing protein  31.91 
 
 
282 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1311  UspA domain protein  40.97 
 
 
187 aa  76.6  0.0000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.519886  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  32.62 
 
 
142 aa  76.6  0.0000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5163  UspA domain protein  36.88 
 
 
145 aa  75.1  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.262292  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1504  hypothetical protein  36.99 
 
 
151 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3238  universal stress protein  27.99 
 
 
297 aa  74.3  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  35.66 
 
 
152 aa  74.3  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  40.29 
 
 
158 aa  74.3  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5859  UspA domain-containing protein  31.49 
 
 
317 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.689351  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  35.42 
 
 
150 aa  74.3  0.000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3201  hypothetical protein  37.93 
 
 
156 aa  73.6  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308557  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4745  hypothetical protein  33.79 
 
 
151 aa  73.6  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.829975  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4632  UspA domain protein  29.55 
 
 
309 aa  73.2  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  29.05 
 
 
283 aa  73.2  0.000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1659  UspA domain protein  33.8 
 
 
147 aa  73.6  0.000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.452952  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1677  hypothetical protein  39.87 
 
 
146 aa  72.8  0.000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.884231 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0288  UspA domain protein  26.95 
 
 
303 aa  72.8  0.000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.48991 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  28.03 
 
 
314 aa  72.8  0.000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  34.48 
 
 
144 aa  72.8  0.000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1269  UspA domain protein  23.26 
 
 
275 aa  72.4  0.000000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0776  UspA domain protein  29.33 
 
 
308 aa  72  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  31.51 
 
 
152 aa  72  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  31.51 
 
 
153 aa  72  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2298  UspA domain-containing protein  36.73 
 
 
164 aa  71.2  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178234  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  35.42 
 
 
145 aa  70.9  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3355  UspA domain-containing protein  31.21 
 
 
143 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.47946  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0916  hypothetical protein  34 
 
 
173 aa  71.2  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  35.97 
 
 
280 aa  71.2  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1134  UspA domain-containing protein  39.16 
 
 
167 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  35.42 
 
 
145 aa  70.9  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2204  UspA domain protein  34.75 
 
 
150 aa  70.5  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3570  UspA domain protein  27.91 
 
 
271 aa  70.9  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.610605 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  35.42 
 
 
145 aa  70.5  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0267  UspA domain-containing protein  29.06 
 
 
306 aa  70.5  0.00000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1570  UspA domain protein  36.17 
 
 
154 aa  70.5  0.00000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3585  UspA domain-containing protein  36.96 
 
 
150 aa  70.1  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.666006  normal  0.0498222 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  31.76 
 
 
149 aa  69.3  0.00000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3480  UspA domain-containing protein  28.67 
 
 
289 aa  69.3  0.00000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.420945 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3858  hypothetical protein  26.26 
 
 
297 aa  69.7  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>