More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0570 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_0570  UspA domain protein  100 
 
 
141 aa  275  2e-73  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.932953  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  46.9 
 
 
152 aa  110  9e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1573  UspA domain protein  48.94 
 
 
149 aa  109  1.0000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  43.88 
 
 
150 aa  108  3e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  43.84 
 
 
155 aa  107  6e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  50 
 
 
144 aa  104  5e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0432  UspA domain protein  41.55 
 
 
144 aa  103  6e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  43.88 
 
 
208 aa  103  8e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  47.86 
 
 
290 aa  102  1e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  45.45 
 
 
180 aa  102  1e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  37.41 
 
 
150 aa  102  2e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1388  UspA domain protein  43.26 
 
 
145 aa  102  2e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.120958  normal  0.124251 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  39.57 
 
 
145 aa  101  3e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  37.84 
 
 
152 aa  102  3e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  44.9 
 
 
153 aa  100  7e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3164  UspA domain protein  44.52 
 
 
156 aa  99.8  1e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  43.15 
 
 
156 aa  99.4  2e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  39.13 
 
 
145 aa  98.2  3e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  44.06 
 
 
158 aa  97.8  4e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4014  UspA domain protein  45.32 
 
 
136 aa  97.8  4e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  36.69 
 
 
145 aa  97.4  5e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  43.26 
 
 
207 aa  97.4  6e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  41.91 
 
 
138 aa  97.4  6e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  46.85 
 
 
307 aa  96.7  1e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0833  UspA domain protein  41.32 
 
 
169 aa  94.7  3e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.139589  normal  0.670884 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  38.13 
 
 
145 aa  95.1  3e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  39.01 
 
 
151 aa  95.1  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  43.48 
 
 
149 aa  94.7  4e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  42.86 
 
 
147 aa  94.7  4e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  45 
 
 
415 aa  94.4  5e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  43.8 
 
 
281 aa  94.4  5e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  36.62 
 
 
150 aa  94  6e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  35.17 
 
 
157 aa  94  7e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  43.36 
 
 
148 aa  93.2  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0848  hypothetical protein  37.41 
 
 
142 aa  93.2  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957853  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  40.85 
 
 
148 aa  92.8  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  35.42 
 
 
148 aa  92  3e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  38.57 
 
 
300 aa  91.3  5e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1858  UspA domain protein  39.13 
 
 
147 aa  90.5  7e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  43.8 
 
 
297 aa  90.5  7e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3681  UspA domain protein  39.31 
 
 
301 aa  89.7  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  42.76 
 
 
159 aa  89.7  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  39.29 
 
 
147 aa  89  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  39.42 
 
 
288 aa  89.4  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3733  UspA domain protein  42.55 
 
 
151 aa  89  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.217159  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  36.81 
 
 
143 aa  88.6  3e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3405  UspA domain protein  43.26 
 
 
150 aa  87.4  5e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1862  UspA domain protein  43.48 
 
 
141 aa  87.4  6e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0496809 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  34.56 
 
 
164 aa  86.7  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0780  UspA domain protein  33.09 
 
 
142 aa  86.3  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608906  normal  0.0365188 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  39.16 
 
 
286 aa  86.3  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  39.07 
 
 
305 aa  84.7  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0826  universal stress protein  35.51 
 
 
165 aa  84.7  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2059  UspA domain protein  35.66 
 
 
156 aa  84.7  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3944  hitchhiker  0.00218931 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  39.6 
 
 
154 aa  84.7  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  40.56 
 
 
144 aa  84.3  5e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2088  UspA domain-containing protein  40.67 
 
 
153 aa  84.3  5e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0358891 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  40.44 
 
 
287 aa  83.2  0.000000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  41.96 
 
 
156 aa  82.8  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0309  hypothetical protein  30.94 
 
 
142 aa  82  0.000000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  37.24 
 
 
156 aa  80.9  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3346  hypothetical protein  39.86 
 
 
156 aa  80.9  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0885774  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1570  UspA domain protein  37.5 
 
 
154 aa  80.9  0.000000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  40.29 
 
 
159 aa  80.9  0.000000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  37.96 
 
 
150 aa  80.5  0.000000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  36.43 
 
 
142 aa  79.7  0.00000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  38.97 
 
 
280 aa  80.1  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0480  UspA domain protein  40.29 
 
 
144 aa  80.1  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1706  universal stress protein  35.48 
 
 
130 aa  79.3  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0360451  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3218  universal stress protein  38.46 
 
 
120 aa  79  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0127245 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1382  UspA domain-containing protein  35.71 
 
 
142 aa  79  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.378027 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6968  UspA domain protein  35.37 
 
 
147 aa  78.6  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483791  normal  0.0402006 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  37.78 
 
 
152 aa  78.6  0.00000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  43.38 
 
 
283 aa  78.2  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3403  UspA domain protein  39.55 
 
 
301 aa  77.8  0.00000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0803  UspA domain protein  37.32 
 
 
212 aa  77.8  0.00000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4273  UspA domain protein  37.76 
 
 
155 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.664066 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4260  UspA domain protein  36.3 
 
 
148 aa  77  0.00000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.290835  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1567  universal stress protein  38.89 
 
 
164 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.84315  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1307  UspA domain protein  41.96 
 
 
153 aa  76.6  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.476613  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0228  UspA domain protein  38.73 
 
 
144 aa  76.6  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.115538 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0914  UspA domain protein  34.75 
 
 
154 aa  76.6  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.446701 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0916  hypothetical protein  37.93 
 
 
173 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3813  UspA domain protein  43.17 
 
 
283 aa  76.6  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  36.36 
 
 
153 aa  76.3  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1659  UspA domain protein  41.84 
 
 
147 aa  76.6  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.452952  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0965  UspA domain protein  38.97 
 
 
152 aa  75.5  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  35.42 
 
 
142 aa  75.9  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3418  UspA domain protein  40.58 
 
 
133 aa  75.9  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  38.06 
 
 
153 aa  75.5  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2298  UspA domain-containing protein  37.5 
 
 
164 aa  75.9  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178234  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  36.91 
 
 
148 aa  75.1  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2792  UspA domain protein  39.86 
 
 
144 aa  75.1  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3055  UspA domain protein  38.97 
 
 
142 aa  75.1  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1308  UspA domain protein  34.72 
 
 
145 aa  75.1  0.0000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.437188  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  41.1 
 
 
170 aa  74.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  41.1 
 
 
170 aa  74.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  38.97 
 
 
153 aa  74.3  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1369  UspA domain-containing protein  35.66 
 
 
144 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.981582 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0607  putative universal stress-related protein  37.06 
 
 
155 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.135512 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>