More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_3733 on replicon NC_013923
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013923  Nmag_3733  UspA domain protein  100 
 
 
151 aa  298  2e-80  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.217159  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3405  UspA domain protein  79.73 
 
 
150 aa  238  2e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1573  UspA domain protein  62.59 
 
 
149 aa  181  2.0000000000000003e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3164  UspA domain protein  45.58 
 
 
156 aa  106  1e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  41.78 
 
 
152 aa  104  3e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  41.67 
 
 
180 aa  102  1e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  45.33 
 
 
144 aa  101  3e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  42.14 
 
 
152 aa  99.8  1e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  42.57 
 
 
155 aa  99.8  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  38.19 
 
 
207 aa  95.9  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  34.97 
 
 
148 aa  94.7  4e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3681  UspA domain protein  37.91 
 
 
301 aa  92.8  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  38.19 
 
 
208 aa  91.7  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  42.07 
 
 
148 aa  91.7  3e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0965  UspA domain protein  38.41 
 
 
152 aa  91.3  4e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1858  UspA domain protein  41.38 
 
 
147 aa  90.9  5e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  40.97 
 
 
156 aa  90.1  9e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  40.91 
 
 
153 aa  89.7  1e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1307  UspA domain protein  41.67 
 
 
153 aa  89  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.476613  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4249  UspA domain protein  42.47 
 
 
133 aa  88.2  4e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  39.19 
 
 
156 aa  87.4  5e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0833  UspA domain protein  36.84 
 
 
169 aa  87.4  6e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.139589  normal  0.670884 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0780  UspA domain protein  34.03 
 
 
142 aa  85.9  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608906  normal  0.0365188 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  38.16 
 
 
159 aa  85.1  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  38.62 
 
 
158 aa  85.1  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0432  UspA domain protein  38.19 
 
 
144 aa  85.1  3e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  31.94 
 
 
150 aa  85.1  3e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  33.79 
 
 
145 aa  85.1  3e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1388  UspA domain protein  36.11 
 
 
145 aa  84.7  4e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.120958  normal  0.124251 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0224  UspA domain protein  39.04 
 
 
151 aa  83.6  9e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.483112  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  31.76 
 
 
150 aa  83.6  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  36.31 
 
 
288 aa  83.2  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
145 aa  81.6  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1196  UspA domain-containing protein  33.79 
 
 
142 aa  81.6  0.000000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196709  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  32.41 
 
 
145 aa  80.5  0.000000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  36.99 
 
 
290 aa  80.5  0.000000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  32.41 
 
 
145 aa  80.5  0.000000000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3418  UspA domain protein  40.69 
 
 
133 aa  80.1  0.000000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  34.9 
 
 
287 aa  79.3  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  37.06 
 
 
147 aa  79  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  32.21 
 
 
151 aa  78.6  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4350  UspA domain protein  34.67 
 
 
294 aa  78.6  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.252521  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  35.33 
 
 
149 aa  78.2  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  32.19 
 
 
164 aa  77.8  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1862  UspA domain protein  43.92 
 
 
141 aa  77.8  0.00000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0496809 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  34.93 
 
 
297 aa  77.8  0.00000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1308  UspA domain protein  37.5 
 
 
145 aa  77.8  0.00000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.437188  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0848  hypothetical protein  31.72 
 
 
142 aa  77.4  0.00000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957853  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  31.51 
 
 
147 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  35.14 
 
 
148 aa  77  0.00000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3170  UspA domain protein  38.46 
 
 
167 aa  76.6  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3403  UspA domain protein  40.14 
 
 
301 aa  76.6  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0570  UspA domain protein  42.55 
 
 
141 aa  76.6  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.932953  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  39.16 
 
 
307 aa  76.6  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  36.81 
 
 
286 aa  75.5  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1382  UspA domain-containing protein  36.17 
 
 
142 aa  75.9  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.378027 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  39.07 
 
 
300 aa  75.5  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  40.56 
 
 
281 aa  75.1  0.0000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  33.78 
 
 
142 aa  75.1  0.0000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2181  UspA domain protein  41.51 
 
 
150 aa  74.7  0.0000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.313206  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  34.03 
 
 
159 aa  74.7  0.0000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3055  UspA domain protein  36.81 
 
 
142 aa  74.3  0.0000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  36.55 
 
 
415 aa  73.9  0.0000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  36.05 
 
 
144 aa  73.9  0.0000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  33.57 
 
 
148 aa  73.6  0.0000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1661  UspA domain protein  31.94 
 
 
147 aa  73.6  0.0000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  29.17 
 
 
156 aa  73.6  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  31.08 
 
 
149 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4348  UspA domain protein  35.42 
 
 
149 aa  73.2  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0947911  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  32.14 
 
 
152 aa  72.4  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  36.81 
 
 
138 aa  72  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  32.67 
 
 
280 aa  72  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1861  UspA domain protein  36.3 
 
 
145 aa  72.8  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0942342  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  32.64 
 
 
140 aa  71.6  0.000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2164  UspA domain protein  42.47 
 
 
154 aa  71.6  0.000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2552  UspA domain protein  31.94 
 
 
147 aa  70.5  0.000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4459099999999997e-20 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1146  UspA domain protein  30.72 
 
 
156 aa  70.5  0.000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  31.29 
 
 
150 aa  70.1  0.000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  33.8 
 
 
153 aa  69.7  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  25.17 
 
 
157 aa  68.9  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6944  universal stress protein  32.67 
 
 
157 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00046035  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  30.56 
 
 
148 aa  69.3  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0480  UspA domain protein  36.81 
 
 
144 aa  68.6  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3734  UspA domain protein  34.75 
 
 
138 aa  68.6  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.210471  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  32.62 
 
 
150 aa  67.8  0.00000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3798  UspA domain protein  33.8 
 
 
281 aa  67.8  0.00000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  29.93 
 
 
151 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  35.66 
 
 
283 aa  67.4  0.00000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2586  universal stress protein  29.5 
 
 
141 aa  67  0.00000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0483395  normal  0.125899 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7052  UspA domain-containing protein  32 
 
 
159 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4016  UspA domain protein  35.17 
 
 
142 aa  66.2  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1440  hypothetical protein  32 
 
 
159 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6388  UspA domain-containing protein  32 
 
 
159 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.686835  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0309  hypothetical protein  30.56 
 
 
142 aa  66.6  0.0000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4745  hypothetical protein  31.82 
 
 
151 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.829975  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0826  universal stress protein  28.77 
 
 
165 aa  66.2  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3218  universal stress protein  32.8 
 
 
120 aa  65.5  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0127245 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0692  UspA domain protein  29.68 
 
 
157 aa  65.9  0.0000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3712  universal stress protein  28.57 
 
 
307 aa  65.5  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  33.56 
 
 
128 aa  65.9  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0225784 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>