More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1182 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  100 
 
 
148 aa  295  1e-79  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  58.99 
 
 
143 aa  168  2e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  50.35 
 
 
150 aa  141  3e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  50.35 
 
 
147 aa  137  6e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  45.07 
 
 
150 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  43.26 
 
 
150 aa  119  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  42.67 
 
 
156 aa  118  3e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  43.24 
 
 
151 aa  114  3e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  39.16 
 
 
180 aa  114  3e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  43.36 
 
 
145 aa  113  6.9999999999999995e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  41.1 
 
 
164 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  43.36 
 
 
145 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  43.36 
 
 
145 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  43.66 
 
 
145 aa  110  7.000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  40.43 
 
 
148 aa  107  5e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  39.47 
 
 
157 aa  105  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  42.76 
 
 
148 aa  105  2e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  38.57 
 
 
152 aa  105  2e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  41.84 
 
 
149 aa  104  4e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2586  universal stress protein  39.71 
 
 
141 aa  103  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0483395  normal  0.125899 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  38.46 
 
 
158 aa  102  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1196  UspA domain-containing protein  39.86 
 
 
142 aa  99.8  1e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196709  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  38.57 
 
 
148 aa  97.4  6e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  36.36 
 
 
159 aa  96.7  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  37.76 
 
 
143 aa  95.5  2e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  36.81 
 
 
147 aa  95.5  2e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0780  UspA domain protein  35.46 
 
 
142 aa  94  7e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608906  normal  0.0365188 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0826  universal stress protein  37.23 
 
 
165 aa  92.4  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  36.88 
 
 
290 aa  90.9  5e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  35.46 
 
 
156 aa  90.9  6e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0848  hypothetical protein  33.8 
 
 
142 aa  89.4  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957853  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0965  UspA domain protein  35.62 
 
 
152 aa  88.2  4e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  34.44 
 
 
155 aa  88.2  4e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4356  UspA domain-containing protein  37.5 
 
 
145 aa  87.8  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244024  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2050  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  34.29 
 
 
143 aa  87.8  4e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.450915  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  30.5 
 
 
307 aa  87.4  7e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  34.48 
 
 
142 aa  85.5  2e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  36.36 
 
 
141 aa  85.9  2e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  32.62 
 
 
208 aa  85.1  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6185  UspA domain-containing protein  30.06 
 
 
157 aa  85.1  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.552133  normal  0.212632 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  36.81 
 
 
300 aa  84.7  4e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1664  UspA domain-containing protein  31.33 
 
 
156 aa  84.3  6e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1382  UspA domain-containing protein  31.69 
 
 
142 aa  84  6e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.378027 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1489  UspA domain-containing protein  38.57 
 
 
137 aa  84  6e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.854212 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4350  UspA domain protein  34.72 
 
 
294 aa  84  7e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.252521  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  35.53 
 
 
156 aa  84  7e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  38.36 
 
 
152 aa  83.6  8e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2181  UspA domain protein  35.29 
 
 
150 aa  83.6  8e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.313206  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2088  UspA domain-containing protein  34.67 
 
 
153 aa  83.2  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0358891 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0081  UspA domain protein  35.86 
 
 
143 aa  82.8  0.000000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324283  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  39.46 
 
 
151 aa  82.4  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0228  UspA domain protein  36.05 
 
 
144 aa  82.4  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.115538 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1230  UspA domain-containing protein  39.57 
 
 
137 aa  81.6  0.000000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  35.92 
 
 
320 aa  82  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4069  UspA domain-containing protein  32.67 
 
 
162 aa  81.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0307561  normal  0.903316 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  34.25 
 
 
162 aa  81.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1307  UspA domain protein  34.03 
 
 
153 aa  81.3  0.000000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.476613  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  32.65 
 
 
151 aa  81.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  33.1 
 
 
288 aa  81.3  0.000000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5916  UspA domain-containing protein  29.94 
 
 
157 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585154  normal  0.579135 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 
144 aa  80.9  0.000000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  32.19 
 
 
147 aa  80.5  0.000000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5381  UspA domain-containing protein  34.9 
 
 
162 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1257  UspA domain protein  35.25 
 
 
136 aa  80.5  0.000000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  32.86 
 
 
139 aa  80.1  0.000000000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0337  UspA domain-containing protein  39.72 
 
 
137 aa  80.1  0.000000000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3403  UspA domain protein  34.25 
 
 
301 aa  80.1  0.000000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  33.12 
 
 
151 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4254  UspA domain protein  33.77 
 
 
149 aa  79.7  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  35.37 
 
 
147 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  32.24 
 
 
156 aa  79  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  33.33 
 
 
139 aa  78.6  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  33.56 
 
 
144 aa  79  0.00000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  31.54 
 
 
142 aa  78.6  0.00000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2183  hypothetical protein  30.99 
 
 
176 aa  78.6  0.00000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  34.23 
 
 
148 aa  78.6  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4000  hypothetical protein  34.87 
 
 
156 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4367  UspA domain-containing protein  34.87 
 
 
156 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5987  UspA domain-containing protein  34.87 
 
 
156 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2415  UspA domain protein  33.33 
 
 
162 aa  78.2  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1270  universal stress protein  34.46 
 
 
154 aa  78.2  0.00000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  33.1 
 
 
144 aa  78.2  0.00000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2164  UspA domain protein  37.06 
 
 
154 aa  78.2  0.00000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1659  UspA domain protein  34.9 
 
 
147 aa  77.4  0.00000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.452952  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  34.23 
 
 
153 aa  77.8  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0180  UspA domain-containing protein  32.67 
 
 
160 aa  77.8  0.00000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149543  normal  0.974446 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  36.88 
 
 
137 aa  77.4  0.00000000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  34.03 
 
 
140 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  34.27 
 
 
297 aa  77.4  0.00000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1272  UspA domain-containing protein  34.72 
 
 
145 aa  77.4  0.00000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6467  UspA domain-containing protein  31.79 
 
 
159 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.276818 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4087  UspA domain-containing protein  32.41 
 
 
145 aa  77.4  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305818  normal  0.183761 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  33.8 
 
 
140 aa  77  0.00000000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3827  putative universal stress protein  34.23 
 
 
187 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2502  UspA domain protein  33.33 
 
 
162 aa  77  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.187507  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0833  UspA domain protein  31.95 
 
 
169 aa  77  0.00000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.139589  normal  0.670884 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  35 
 
 
128 aa  76.3  0.0000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1650  universal stress protein  35.53 
 
 
156 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.262714  normal  0.111079 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0442  universal stress protein  31.97 
 
 
200 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  34.72 
 
 
150 aa  76.3  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>