More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1007 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  100 
 
 		 320 aa  646    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  39.61 
 
 		 304 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  32.76 
 
 		 288 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  34.45 
 
 		 290 aa  129  4.0000000000000003e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  33.44 
 
 		 305 aa  129  7.000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3403  UspA domain protein  32.67 
 
 		 301 aa  129  8.000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  36.05 
 
 		 283 aa  125  7e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  36.95 
 
 		 287 aa  123  4e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0327  UspA domain protein  35.16 
 
 		 305 aa  121  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.81164 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  34.12 
 
 		 281 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  33.66 
 
 		 307 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  30.94 
 
 		 300 aa  117  3e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0991  hypothetical protein  33.66 
 
 		 294 aa  113  5e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  27.63 
 
 		 276 aa  112  6e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  32.66 
 
 		 415 aa  112  9e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1083  UspA domain-containing protein  29.08 
 
 		 449 aa  110  5e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000280681  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0267  UspA domain-containing protein  30.49 
 
 		 306 aa  109  6e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3681  UspA domain protein  32.12 
 
 		 301 aa  108  1e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  31.06 
 
 		 297 aa  108  2e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6657  UspA domain protein  30.7 
 
 		 311 aa  107  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  26.25 
 
 		 274 aa  107  3e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0254  UspA domain protein  29.43 
 
 		 288 aa  106  4e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.422805 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2107  UspA domain-containing protein  32.8 
 
 		 291 aa  105  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2309  hypothetical protein  26.82 
 
 		 295 aa  104  2e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  35.08 
 
 		 280 aa  104  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0288  UspA domain protein  33.11 
 
 		 303 aa  103  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.48991 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3176  UspA domain protein  30.54 
 
 		 291 aa  103  4e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  31.72 
 
 		 314 aa  103  4e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0912  UspA domain-containing protein  32.29 
 
 		 317 aa  102  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0363039 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0289  UspA domain protein  28.43 
 
 		 289 aa  101  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2567  UspA domain protein  33.98 
 
 		 325 aa  100  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3774  UspA domain-containing protein  31.23 
 
 		 317 aa  99.8  6e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.143188  normal  0.471237 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4632  UspA domain protein  29.81 
 
 		 309 aa  99.8  6e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2546  UspA domain protein  32.3 
 
 		 390 aa  99.4  8e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3813  UspA domain protein  30.67 
 
 		 283 aa  99  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3480  UspA domain-containing protein  28.9 
 
 		 289 aa  97.8  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.420945 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_580  universal stress protein family  25.5 
 
 		 287 aa  97.4  3e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1762  UspA domain-containing protein  30.07 
 
 		 324 aa  97.1  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  33.17 
 
 		 286 aa  96.3  6e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2887  UspA domain-containing protein  35.89 
 
 		 325 aa  96.3  6e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535797  normal  0.92135 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3070  hypothetical protein  31.07 
 
 		 300 aa  95.9  8e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0906  UspA domain protein  37.59 
 
 		 147 aa  95.5  9e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00116915 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1641  UspA domain-containing protein  31.49 
 
 		 294 aa  95.9  9e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2595  UspA domain protein  36.43 
 
 		 146 aa  95.5  9e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000015359  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2547  UspA domain protein  33.12 
 
 		 306 aa  95.1  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3776  UspA domain-containing protein  29.47 
 
 		 297 aa  94.4  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226753  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2551  UspA domain-containing protein  26.91 
 
 		 278 aa  94.4  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000359822  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1963  UspA domain-containing protein  36.17 
 
 		 147 aa  94.4  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3830  universal stress family protein  30.98 
 
 		 303 aa  94.7  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0606263 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3085  hypothetical protein  29.32 
 
 		 303 aa  94  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  41.4 
 
 		 159 aa  94  3e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0640  universal stress protein  26.16 
 
 		 287 aa  93.6  4e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0172387  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1759  universal stress protein  29.93 
 
 		 298 aa  93.2  6e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  38.3 
 
 		 153 aa  92.8  7e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  39.44 
 
 		 148 aa  92  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4087  UspA domain-containing protein  39.07 
 
 		 145 aa  90.5  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305818  normal  0.183761 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2941  hypothetical protein  29.97 
 
 		 296 aa  90.1  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.99893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5820  UspA domain-containing protein  30.41 
 
 		 318 aa  90.1  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.131616 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  40.14 
 
 		 145 aa  89.7  5e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0612  UspA domain-containing protein  24.58 
 
 		 287 aa  90.1  5e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0812  UspA domain protein  36.05 
 
 		 153 aa  89.7  6e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198754  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2770  UspA domain protein  29.04 
 
 		 298 aa  89.7  6e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0325172  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0761  universal stress protein UspA  35.37 
 
 		 153 aa  89.4  8e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0808  UspA domain protein  36.05 
 
 		 153 aa  89.4  8e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0102743  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3238  universal stress protein  29.63 
 
 		 297 aa  88.6  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1678  hypothetical protein  28.57 
 
 		 297 aa  88.6  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2552  UspA domain protein  28.94 
 
 		 305 aa  89  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  39.58 
 
 		 147 aa  88.2  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0914  UspA domain-containing protein  29.04 
 
 		 297 aa  88.2  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1454  universal stress protein  34.04 
 
 		 149 aa  87.4  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000316755  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  40.43 
 
 		 152 aa  87  4e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1314  UspA domain-containing protein  27.6 
 
 		 323 aa  86.7  5e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.858313  normal  0.823385 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  36.91 
 
 		 149 aa  86.3  6e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2552  UspA domain protein  38.46 
 
 		 147 aa  86.3  6e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4459099999999997e-20 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1661  UspA domain protein  37.5 
 
 		 147 aa  86.3  6e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  37.5 
 
 		 162 aa  86.3  7e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4069  UspA domain-containing protein  38.46 
 
 		 162 aa  85.9  9e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0307561  normal  0.903316 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  34.75 
 
 		 139 aa  85.5  0.000000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  35.46 
 
 		 151 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  38.73 
 
 		 145 aa  85.1  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  37.5 
 
 		 145 aa  85.5  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0702  UspA domain protein  28.01 
 
 		 282 aa  85.1  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1269  UspA domain protein  24.03 
 
 		 275 aa  84.7  0.000000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1847  UspA domain protein  28.62 
 
 		 293 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000811482 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1321  universal stress protein UspA  37.75 
 
 		 169 aa  84.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2569  UspA domain protein  30.42 
 
 		 291 aa  84.7  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  37.93 
 
 		 149 aa  84  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2614  universal stress protein  30.92 
 
 		 280 aa  84  0.000000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.301606 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1268  universal stress protein  32.52 
 
 		 315 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3451  UspA domain-containing protein  32.81 
 
 		 293 aa  84  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  36.42 
 
 		 170 aa  83.6  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  36.43 
 
 		 150 aa  83.6  0.000000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1735  universal stress protein  27.16 
 
 		 301 aa  83.6  0.000000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0846445  normal  0.348826 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  36.62 
 
 		 145 aa  83.6  0.000000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  36.42 
 
 		 170 aa  83.6  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0105  universal stress protein  31.55 
 
 		 319 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  38.73 
 
 		 156 aa  82.8  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2564  UspA domain protein  29.43 
 
 		 282 aa  83.2  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.143275  normal  0.0151057 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  36.62 
 
 		 145 aa  83.2  0.000000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  35.25 
 
 		 152 aa  82.8  0.000000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>