More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0169 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  100 
 
 		 151 aa  291  1e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2611  hypothetical protein  58.11 
 
 		 152 aa  128  3e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3070  hypothetical protein  52.82 
 
 		 300 aa  128  3e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0104  hypothetical protein  61.38 
 
 		 149 aa  125  3e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2559  UspA domain protein  47.89 
 
 		 295 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3085  hypothetical protein  49.33 
 
 		 303 aa  110  5e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1744  UspA domain protein  45.64 
 
 		 296 aa  105  3e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  44.83 
 
 		 144 aa  99  2e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3071  hypothetical protein  46.94 
 
 		 317 aa  97.1  7e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3063  hypothetical protein  47.14 
 
 		 297 aa  97.1  8e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  38.56 
 
 		 156 aa  94  7e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2716  hypothetical protein  45.68 
 
 		 168 aa  94  7e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  39.04 
 
 		 150 aa  93.6  8e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3141  hypothetical protein  51.03 
 
 		 297 aa  93.6  8e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  40.88 
 
 		 137 aa  93.6  9e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  40.69 
 
 		 149 aa  92.8  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1230  UspA domain-containing protein  40.43 
 
 		 137 aa  92.8  2e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0081  UspA domain protein  38.51 
 
 		 143 aa  92.4  2e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324283  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4616  UspA domain protein  38.13 
 
 		 141 aa  92.4  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  41.78 
 
 		 147 aa  91.3  4e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  41.84 
 
 		 164 aa  91.3  5e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  39.04 
 
 		 151 aa  90.9  6e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3072  hypothetical protein  45.95 
 
 		 161 aa  90.5  6e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0631  UspA domain protein  37.84 
 
 		 160 aa  89.4  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113911  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  39.46 
 
 		 150 aa  88.6  3e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  36.99 
 
 		 150 aa  88.2  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0337  UspA domain-containing protein  42.86 
 
 		 137 aa  88.6  3e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1489  UspA domain-containing protein  41.73 
 
 		 137 aa  88.2  4e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.854212 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  43.57 
 
 		 153 aa  87.8  5e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  42.47 
 
 		 162 aa  87.4  6e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  39.71 
 
 		 128 aa  87  7e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0225784 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  40.14 
 
 		 139 aa  85.5  2e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  37.5 
 
 		 140 aa  85.5  2e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  39.46 
 
 		 148 aa  86.3  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0289  UspA domain protein  37.14 
 
 		 289 aa  85.5  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1819  hypothetical protein  50.35 
 
 		 182 aa  85.9  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4370  universal stress protein  35.62 
 
 		 152 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5355  UspA domain protein  37.18 
 
 		 148 aa  85.1  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  39.71 
 
 		 290 aa  85.1  3e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  38.57 
 
 		 141 aa  85.5  3e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2109  UspA domain-containing protein  40.44 
 
 		 128 aa  84.7  4e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3301  UspA domain-containing protein  34.93 
 
 		 152 aa  84.7  4e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  35.66 
 
 		 145 aa  84.3  5e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4760  universal stress protein  34.93 
 
 		 152 aa  84  6e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4523  universal stress protein  34.93 
 
 		 152 aa  84  6e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4733  universal stress protein family  34.93 
 
 		 152 aa  84  6e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4359  universal stress protein  34.93 
 
 		 152 aa  84  6e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4875  universal stress protein  34.93 
 
 		 152 aa  84  6e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4754  universal stress protein family  34.93 
 
 		 152 aa  84  6e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00141211  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4743  universal stress protein family  34.93 
 
 		 152 aa  84  6e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1493  UspA domain-containing protein  36.91 
 
 		 165 aa  84  7e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1513  UspA domain-containing protein  36.91 
 
 		 165 aa  84  7e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.224479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  36.42 
 
 		 152 aa  83.6  8e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  36.05 
 
 		 142 aa  83.6  9e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  36.49 
 
 		 153 aa  83.6  9e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4735  universal stress protein  36.24 
 
 		 165 aa  83.6  9e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0233182  normal  0.974909 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4455  UspA domain-containing protein  34.97 
 
 		 152 aa  83.6  9e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0391704  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0502  universal stress protein family  34.97 
 
 		 152 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1294  universal stress protein  37.42 
 
 		 152 aa  83.2  0.000000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.967689 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  38.57 
 
 		 151 aa  82.8  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3847  UspA domain protein  36.36 
 
 		 145 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000916772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0309  hypothetical protein  36.05 
 
 		 142 aa  83.2  0.000000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1574  UspA domain-containing protein  36.24 
 
 		 165 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1117  hypothetical protein  36.24 
 
 		 165 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1597  UspA domain-containing protein  36.24 
 
 		 165 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  37.41 
 
 		 150 aa  81.6  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2210  universal stress protein UspA  39.16 
 
 		 149 aa  81.3  0.000000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1640  UspA domain-containing protein  36.24 
 
 		 165 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0486  UspA domain-containing protein  36.42 
 
 		 162 aa  81.3  0.000000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000206197  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  34.93 
 
 		 145 aa  81.3  0.000000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0254  UspA domain protein  35.46 
 
 		 288 aa  80.5  0.000000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.422805 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  36.62 
 
 		 148 aa  80.1  0.000000000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0180  UspA domain-containing protein  37.93 
 
 		 160 aa  79.7  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149543  normal  0.974446 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  37.86 
 
 		 147 aa  79.7  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2502  UspA domain protein  41.67 
 
 		 162 aa  79.7  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.187507  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4087  UspA domain-containing protein  41.18 
 
 		 145 aa  79.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305818  normal  0.183761 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  33.33 
 
 		 157 aa  79  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0906  UspA domain protein  36.55 
 
 		 147 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00116915 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1567  universal stress protein  39.72 
 
 		 164 aa  78.6  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.84315  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1888  putative universal stress protein  38.46 
 
 		 184 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.803254  normal  0.974311 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  40.43 
 
 		 138 aa  79  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  34.25 
 
 		 145 aa  78.6  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2415  UspA domain protein  40.97 
 
 		 162 aa  78.2  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  40.14 
 
 		 139 aa  78.6  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  39.31 
 
 		 320 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2528  UspA domain protein  41.01 
 
 		 140 aa  78.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.508947  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1331  universal stress protein UspA  41.01 
 
 		 140 aa  78.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  35.71 
 
 		 153 aa  78.2  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  35.17 
 
 		 143 aa  77.8  0.00000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2204  UspA domain protein  34.01 
 
 		 150 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  38.03 
 
 		 148 aa  77.8  0.00000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0458  hypothetical protein  40.71 
 
 		 144 aa  77.8  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  36.55 
 
 		 140 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  38.57 
 
 		 156 aa  77.4  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2624  UspA domain protein  41.01 
 
 		 140 aa  77.4  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  38.1 
 
 		 156 aa  77.4  0.00000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2102  UspA domain protein  40.91 
 
 		 289 aa  77  0.00000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  33.56 
 
 		 145 aa  77  0.00000000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0914  UspA domain protein  35.9 
 
 		 154 aa  77  0.00000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.446701 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1021  UspA domain-containing protein  35 
 
 		 143 aa  76.6  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>