More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0873 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  100 
 
 		 150 aa  296  8e-80  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  82.52 
 
 		 153 aa  241  1.9999999999999999e-63  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  71.33 
 
 		 153 aa  225  2e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  71.81 
 
 		 152 aa  220  4.9999999999999996e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  69.8 
 
 		 153 aa  213  5.9999999999999996e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1294  universal stress protein  72.48 
 
 		 152 aa  205  1e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.967689 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  61.07 
 
 		 152 aa  192  9e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  43.14 
 
 		 145 aa  121  4e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0803  UspA domain protein  40.27 
 
 		 212 aa  116  9.999999999999999e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  41.33 
 
 		 145 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  40.67 
 
 		 145 aa  115  3e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0914  UspA domain protein  37.76 
 
 		 154 aa  109  1.0000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.446701 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1570  UspA domain protein  40.28 
 
 		 154 aa  107  5e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1198  UspA domain protein  35.81 
 
 		 155 aa  106  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.473556  normal  0.580664 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1270  universal stress protein  38.93 
 
 		 154 aa  103  1e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  44.29 
 
 		 151 aa  101  4e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  40 
 
 		 159 aa  100  5e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  42.28 
 
 		 162 aa  99.8  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  39.46 
 
 		 170 aa  95.1  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  39.46 
 
 		 170 aa  95.1  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3355  UspA domain-containing protein  37.59 
 
 		 143 aa  94.4  5e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.47946  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2415  UspA domain protein  40.27 
 
 		 162 aa  93.6  8e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  39.6 
 
 		 151 aa  93.6  9e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3714  universal stress protein  36.81 
 
 		 143 aa  93.2  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.782463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2502  UspA domain protein  40.54 
 
 		 162 aa  93.2  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.187507  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1321  universal stress protein UspA  40.14 
 
 		 169 aa  92.8  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  36.73 
 
 		 150 aa  91.7  4e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  36.88 
 
 		 145 aa  91.3  4e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0808  UspA domain protein  38.73 
 
 		 153 aa  90.5  6e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0102743  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0812  UspA domain protein  39.29 
 
 		 153 aa  90.1  8e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198754  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2862  UspA domain-containing protein  40.85 
 
 		 147 aa  90.5  8e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0352  UspA domain-containing protein  35.67 
 
 		 159 aa  90.1  9e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.818544 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  39.16 
 
 		 208 aa  89.4  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1448  universal stress protein UspA  39.35 
 
 		 164 aa  90.1  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0761  universal stress protein UspA  38.57 
 
 		 153 aa  89.4  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4060  UspA domain-containing protein  33.79 
 
 		 143 aa  89.4  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  36.91 
 
 		 147 aa  88.6  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  38.46 
 
 		 156 aa  88.2  4e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  39.33 
 
 		 307 aa  88.2  4e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2413  UspA domain protein  39.35 
 
 		 164 aa  87.8  4e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.53784  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  36.81 
 
 		 207 aa  87.8  4e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  36.17 
 
 		 145 aa  87.4  5e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  33.11 
 
 		 276 aa  87.4  6e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  37.14 
 
 		 147 aa  87  7e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  36.17 
 
 		 145 aa  87  8e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4069  UspA domain-containing protein  36.36 
 
 		 162 aa  86.7  9e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0307561  normal  0.903316 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  35.62 
 
 		 149 aa  85.5  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3734  UspA domain protein  39.01 
 
 		 138 aa  85.5  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.210471  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2768  UspA domain protein  36.67 
 
 		 134 aa  85.5  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.327579  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2861  UspA domain protein  36.67 
 
 		 134 aa  85.5  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.569855  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  35.46 
 
 		 148 aa  85.1  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  35.21 
 
 		 142 aa  85.1  3e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2675  universal stress protein UspA  36.67 
 
 		 134 aa  85.1  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2716  UspA domain protein  36.6 
 
 		 154 aa  85.1  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3202  UspA domain protein  33.09 
 
 		 151 aa  84.7  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.805747  normal  0.0850987 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2500  UspA domain protein  38.31 
 
 		 164 aa  84.7  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.419356  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  33.09 
 
 		 287 aa  84.7  4e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  34.21 
 
 		 149 aa  84.3  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  35.46 
 
 		 145 aa  83.6  8e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  36.43 
 
 		 320 aa  83.6  8e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1740  UspA domain protein  34.93 
 
 		 144 aa  83.6  8e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.253274 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0758  UspA domain protein  36.54 
 
 		 162 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.16073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1659  UspA domain protein  34.93 
 
 		 147 aa  83.2  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.452952  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  34.75 
 
 		 290 aa  83.2  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0228  UspA domain protein  35.66 
 
 		 144 aa  83.2  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.115538 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4434  UspA domain-containing protein  36.11 
 
 		 158 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947422 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  36.11 
 
 		 149 aa  82.4  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2314  UspA domain protein  32.67 
 
 		 153 aa  82.4  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  31.72 
 
 		 274 aa  82.4  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  33.33 
 
 		 304 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2941  hypothetical protein  33.79 
 
 		 296 aa  82  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.99893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3101  UspA domain-containing protein  35.46 
 
 		 143 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.792051 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2853  hypothetical protein  35.71 
 
 		 143 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.036432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2181  UspA domain protein  39.6 
 
 		 150 aa  82.4  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.313206  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  36.23 
 
 		 148 aa  82  0.000000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  36.17 
 
 		 280 aa  81.6  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0976  hypothetical protein  36.43 
 
 		 143 aa  82  0.000000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.21333  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  36.11 
 
 		 151 aa  82  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0874  UspA domain-containing protein  35.46 
 
 		 143 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3148  UspA domain-containing protein  35.46 
 
 		 143 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0289  UspA domain protein  37.06 
 
 		 289 aa  81.3  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3249  UspA domain-containing protein  35.46 
 
 		 143 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  37.59 
 
 		 142 aa  80.9  0.000000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0953  UspA domain-containing protein  33.79 
 
 		 143 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2569  UspA domain protein  33.81 
 
 		 291 aa  80.9  0.000000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1661  UspA domain protein  34.72 
 
 		 147 aa  80.5  0.000000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  37.5 
 
 		 288 aa  80.1  0.000000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  36.5 
 
 		 138 aa  80.1  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  34.04 
 
 		 150 aa  79.3  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  35.86 
 
 		 150 aa  79.7  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4083  UspA domain-containing protein  34.01 
 
 		 172 aa  79.7  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.391845  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1676  hypothetical protein  39.72 
 
 		 143 aa  79.7  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.631803 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  39.46 
 
 		 151 aa  79.7  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0938  UspA domain-containing protein  33.79 
 
 		 143 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  36.73 
 
 		 159 aa  79.7  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0309  hypothetical protein  35.21 
 
 		 142 aa  80.1  0.00000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  32.03 
 
 		 156 aa  79.3  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0254  UspA domain protein  36.05 
 
 		 288 aa  79  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.422805 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3706  UspA domain-containing protein  33.56 
 
 		 143 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0037155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2791  UspA domain-containing protein  34.23 
 
 		 155 aa  79.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.119476  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>