More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2933 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 147 aa  303  3e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2552  UspA domain protein  75.34 
 
 		 147 aa  242  1.9999999999999999e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4459099999999997e-20 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1661  UspA domain protein  73.29 
 
 		 147 aa  235  2e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  70.07 
 
 		 149 aa  227  4e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  71.43 
 
 		 149 aa  224  2e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  66.67 
 
 		 151 aa  217  5e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2016  universal stress protein UspA-like protein  70.75 
 
 		 148 aa  209  7e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  62.59 
 
 		 151 aa  209  1e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0906  UspA domain protein  45.58 
 
 		 147 aa  123  1e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00116915 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1454  universal stress protein  42.07 
 
 		 149 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000316755  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0762  UspA domain protein  42.18 
 
 		 146 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1963  UspA domain-containing protein  42.18 
 
 		 147 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2204  UspA domain protein  41.5 
 
 		 150 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  38 
 
 		 159 aa  104  3e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2595  UspA domain protein  38.62 
 
 		 146 aa  101  3e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000015359  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  38.26 
 
 		 153 aa  101  4e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  34.72 
 
 		 208 aa  95.5  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4087  UspA domain-containing protein  38.36 
 
 		 145 aa  95.9  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305818  normal  0.183761 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0180  UspA domain-containing protein  34.01 
 
 		 160 aa  93.6  7e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149543  normal  0.974446 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  35.57 
 
 		 151 aa  91.3  4e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2717  UspA domain-containing protein  35.86 
 
 		 308 aa  91.3  4e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.643205 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3681  universal stress protein  35 
 
 		 143 aa  90.1  9e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2980  UspA domain-containing protein  33.57 
 
 		 143 aa  90.1  9e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3330  UspA domain-containing protein  34.29 
 
 		 143 aa  89.4  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1042  UspA domain-containing protein  34.29 
 
 		 143 aa  89.4  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.49662 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  39.58 
 
 		 320 aa  88.2  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  36.91 
 
 		 150 aa  88.6  3e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3249  UspA domain-containing protein  34.29 
 
 		 143 aa  88.6  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0874  UspA domain-containing protein  34.29 
 
 		 143 aa  87.8  4e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3148  UspA domain-containing protein  34.29 
 
 		 143 aa  87.8  4e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1030  UspA domain protein  34.03 
 
 		 143 aa  87.8  5e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.374464 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1009  UspA domain-containing protein  34.03 
 
 		 143 aa  87.8  5e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0692  UspA domain protein  40.13 
 
 		 157 aa  86.7  9e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  36.11 
 
 		 147 aa  86.3  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3714  universal stress protein  35.46 
 
 		 143 aa  85.9  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.782463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2552  UspA domain protein  35.92 
 
 		 305 aa  85.1  3e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4060  UspA domain-containing protein  33.57 
 
 		 143 aa  84.7  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3355  UspA domain-containing protein  32.86 
 
 		 143 aa  84.7  4e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.47946  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1448  universal stress protein UspA  37.01 
 
 		 164 aa  83.6  8e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1111  UspA domain-containing protein  35.21 
 
 		 145 aa  83.2  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2413  UspA domain protein  35.06 
 
 		 164 aa  81.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.53784  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1714  hypothetical protein  31.79 
 
 		 150 aa  81.6  0.000000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  32.17 
 
 		 158 aa  81.6  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2500  UspA domain protein  34.44 
 
 		 164 aa  82  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.419356  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  32.41 
 
 		 159 aa  81.3  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0953  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 143 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3712  universal stress protein  33.1 
 
 		 307 aa  80.9  0.000000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  32.88 
 
 		 138 aa  80.9  0.000000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  33.78 
 
 		 150 aa  81.3  0.000000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1925  UspA domain-containing protein  35.17 
 
 		 144 aa  81.3  0.000000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  32.19 
 
 		 290 aa  80.9  0.000000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0850  universal stress protein UspA  38.62 
 
 		 146 aa  80.9  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.789221  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4069  UspA domain-containing protein  32.24 
 
 		 162 aa  80.9  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0307561  normal  0.903316 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  35.42 
 
 		 150 aa  80.5  0.000000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3354  UspA domain-containing protein  31.47 
 
 		 147 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.346756  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  36.24 
 
 		 152 aa  80.5  0.000000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  32.89 
 
 		 153 aa  80.1  0.000000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3100  UspA domain-containing protein  32.87 
 
 		 147 aa  80.1  0.000000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.806996 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  33.11 
 
 		 148 aa  80.1  0.000000000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  32.88 
 
 		 180 aa  79.3  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0327  UspA domain protein  32 
 
 		 305 aa  79.3  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.81164 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  36.55 
 
 		 149 aa  79.3  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1083  universal stress protein family  34.51 
 
 		 145 aa  79.7  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3134  hypothetical protein  32.14 
 
 		 285 aa  79.7  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0938  UspA domain-containing protein  30.77 
 
 		 143 aa  79.3  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  32.64 
 
 		 144 aa  79  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  32.39 
 
 		 287 aa  78.6  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3827  putative universal stress protein  36.24 
 
 		 187 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0808  UspA domain protein  30.82 
 
 		 153 aa  79  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0102743  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  35.37 
 
 		 148 aa  79.3  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3405  UspA domain protein  32.19 
 
 		 150 aa  79  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3101  UspA domain-containing protein  31.43 
 
 		 143 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.792051 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0812  UspA domain protein  30.82 
 
 		 153 aa  79  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198754  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  34.46 
 
 		 162 aa  78.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  31.58 
 
 		 148 aa  78.6  0.00000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1407  universal stress protein  32.7 
 
 		 161 aa  78.2  0.00000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.192272  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0589  universal stress protein  33.1 
 
 		 140 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.558284  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  31.76 
 
 		 156 aa  77.8  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0761  universal stress protein UspA  30.82 
 
 		 153 aa  78.2  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0976  hypothetical protein  31.65 
 
 		 143 aa  77.4  0.00000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.21333  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  31.25 
 
 		 288 aa  77.8  0.00000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  33.56 
 
 		 153 aa  77.8  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2256  UspA domain-containing protein  31.51 
 
 		 308 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2643  universal stress protein UspA-like protein  30.54 
 
 		 168 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.795343  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2853  hypothetical protein  31.65 
 
 		 143 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.036432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3733  UspA domain protein  31.51 
 
 		 151 aa  77.4  0.00000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.217159  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  35.57 
 
 		 145 aa  77  0.00000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  29.94 
 
 		 170 aa  76.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  30.77 
 
 		 207 aa  76.6  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  33.79 
 
 		 297 aa  76.3  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  29.94 
 
 		 170 aa  76.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2791  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 155 aa  75.5  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.119476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3164  UspA domain protein  34.23 
 
 		 156 aa  75.9  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1974  hypothetical protein  34.9 
 
 		 166 aa  75.5  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  33.11 
 
 		 152 aa  75.1  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1334  hypothetical protein  31.33 
 
 		 154 aa  75.1  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0586772  normal  0.952223 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0155  hypothetical protein  31.13 
 
 		 177 aa  75.1  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  31.54 
 
 		 152 aa  74.7  0.0000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0804  UspA domain protein  35.46 
 
 		 138 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.380791 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2551  UspA domain-containing protein  30.28 
 
 		 278 aa  74.7  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000359822  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>