More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_0850 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_0850  universal stress protein UspA  100 
 
 
146 aa  284  4e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.789221  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4087  UspA domain-containing protein  58.9 
 
 
145 aa  167  5e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305818  normal  0.183761 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  38.62 
 
 
147 aa  102  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  41.38 
 
 
149 aa  100  7e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  37.93 
 
 
149 aa  95.1  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2016  universal stress protein UspA-like protein  37.84 
 
 
148 aa  94  6e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0808  UspA domain protein  41.33 
 
 
153 aa  94  6e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0102743  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0812  UspA domain protein  41.33 
 
 
153 aa  93.6  8e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198754  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0761  universal stress protein UspA  40 
 
 
153 aa  92.4  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2552  UspA domain protein  35.86 
 
 
147 aa  91.3  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4459099999999997e-20 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  34.48 
 
 
151 aa  89  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1661  UspA domain protein  34.48 
 
 
147 aa  87.4  6e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  42.18 
 
 
151 aa  87  8e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  37.84 
 
 
159 aa  83.6  7e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  35.33 
 
 
151 aa  82.8  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1448  universal stress protein UspA  43.62 
 
 
164 aa  81.3  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2306  UspA domain-containing protein  38.36 
 
 
155 aa  80.1  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2413  UspA domain protein  43.15 
 
 
164 aa  79  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.53784  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  39.46 
 
 
170 aa  78.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  39.46 
 
 
170 aa  78.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  30.5 
 
 
274 aa  78.2  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0254  UspA domain protein  33.33 
 
 
288 aa  78.2  0.00000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.422805 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  38.73 
 
 
138 aa  78.2  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2500  UspA domain protein  42.47 
 
 
164 aa  77.4  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.419356  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  40.14 
 
 
208 aa  77.8  0.00000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1213  hypothetical protein  37.25 
 
 
151 aa  77.4  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.166995  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0384  UspA domain protein  35.46 
 
 
142 aa  77  0.00000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150335  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  39.29 
 
 
283 aa  77  0.00000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  36.99 
 
 
156 aa  76.6  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0906  UspA domain protein  32.43 
 
 
147 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00116915 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1963  UspA domain-containing protein  32.43 
 
 
147 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  34.44 
 
 
150 aa  75.5  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1321  universal stress protein UspA  40.14 
 
 
169 aa  75.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  38.71 
 
 
180 aa  75.9  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  38.46 
 
 
148 aa  75.9  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  38.67 
 
 
320 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0607  putative universal stress-related protein  41.22 
 
 
155 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.135512 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  33.79 
 
 
150 aa  74.7  0.0000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  40.56 
 
 
287 aa  74.3  0.0000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5582  UspA domain protein  39.61 
 
 
158 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.285651  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  38.03 
 
 
158 aa  73.2  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  39.58 
 
 
156 aa  73.2  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1142  UspA domain-containing protein  34.69 
 
 
143 aa  73.2  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.925681  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  34.03 
 
 
151 aa  72.4  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  34 
 
 
152 aa  72.8  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  38.06 
 
 
162 aa  72.8  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0762  UspA domain protein  31.97 
 
 
146 aa  72.8  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  31.54 
 
 
153 aa  72.8  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_003296  RS02117  hypothetical protein  35.85 
 
 
151 aa  71.6  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  32.19 
 
 
147 aa  71.6  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  32.21 
 
 
153 aa  71.6  0.000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  36.55 
 
 
155 aa  71.6  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5551  UspA domain protein  41.45 
 
 
165 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.883405 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2204  UspA domain protein  32.43 
 
 
150 aa  71.6  0.000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6198  UspA domain-containing protein  37.82 
 
 
156 aa  72  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.227044  normal  0.53809 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2111  UspA domain-containing protein  34.03 
 
 
146 aa  72  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000930123 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  32.62 
 
 
142 aa  71.2  0.000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2298  UspA domain-containing protein  37.91 
 
 
164 aa  71.6  0.000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178234  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1861  UspA domain protein  37.24 
 
 
145 aa  71.2  0.000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0942342  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4060  UspA domain-containing protein  32.14 
 
 
143 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3827  putative universal stress protein  37.41 
 
 
187 aa  70.5  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1307  UspA domain protein  40.14 
 
 
153 aa  70.5  0.000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.476613  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2309  hypothetical protein  31.25 
 
 
295 aa  70.5  0.000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  37.24 
 
 
305 aa  70.1  0.000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  40.82 
 
 
304 aa  70.5  0.000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4434  UspA domain-containing protein  39.19 
 
 
158 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.947422 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  38 
 
 
415 aa  69.7  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  33.77 
 
 
150 aa  70.1  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2792  UspA domain-containing protein  39.44 
 
 
162 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.276612  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  32.39 
 
 
145 aa  69.7  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  36.49 
 
 
154 aa  70.1  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1134  UspA domain-containing protein  34.9 
 
 
167 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  32.17 
 
 
145 aa  69.7  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2791  UspA domain-containing protein  39.73 
 
 
155 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.119476  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2502  UspA domain protein  39.22 
 
 
162 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.187507  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  33.78 
 
 
150 aa  69.3  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  35.37 
 
 
149 aa  69.3  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2036  universal stress protein (Usp)  41.06 
 
 
155 aa  68.9  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  30.67 
 
 
152 aa  68.9  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0589  universal stress protein  34.75 
 
 
140 aa  68.9  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.558284  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2415  UspA domain protein  38.96 
 
 
162 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1853  universal stress protein  38.26 
 
 
168 aa  68.6  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.499137  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  34.84 
 
 
156 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1334  hypothetical protein  37.93 
 
 
154 aa  68.9  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0586772  normal  0.952223 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6200  UspA domain-containing protein  39.46 
 
 
163 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371788  normal  0.304824 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1570  UspA domain protein  30.13 
 
 
154 aa  68.9  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  34.75 
 
 
140 aa  68.6  0.00000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0052  universal stress protein  37.66 
 
 
155 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2278  UspA domain protein  39.16 
 
 
143 aa  68.6  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5567  UspA domain protein  37.75 
 
 
152 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0038  universal stress family protein  37.42 
 
 
155 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.98264  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  33.79 
 
 
145 aa  67.8  0.00000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1925  UspA domain-containing protein  35.17 
 
 
144 aa  68.2  0.00000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1465  universal stress protein  38.06 
 
 
155 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0032  universal stress protein  38.06 
 
 
155 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  37.06 
 
 
288 aa  67.8  0.00000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1185  universal stress protein  38.06 
 
 
155 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0038  universal stress protein  38.06 
 
 
155 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283622  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3815  UspA domain-containing protein  38.67 
 
 
167 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.911542  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0180  UspA domain-containing protein  34.93 
 
 
160 aa  67.8  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149543  normal  0.974446 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>