More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_3817 on replicon NC_013923
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  100 
 
 
415 aa  811    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  46.02 
 
 
290 aa  211  2e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0856  ferredoxin  56.69 
 
 
129 aa  169  1e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1737  ferredoxin  53.54 
 
 
129 aa  164  2.0000000000000002e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3256  serine/threonine protein kinase  54.01 
 
 
681 aa  155  8e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.400269  normal  0.0118767 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  37.01 
 
 
281 aa  150  3e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2176  ferredoxin  55.91 
 
 
130 aa  150  4e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.378228  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0099  ferredoxin  55.91 
 
 
129 aa  147  4.0000000000000006e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  36.19 
 
 
307 aa  147  4.0000000000000006e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  37.15 
 
 
288 aa  143  5e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1779  ferredoxin  53.54 
 
 
129 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  38.21 
 
 
300 aa  135  9.999999999999999e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  36.64 
 
 
297 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1615  ferredoxin  46.15 
 
 
218 aa  130  5.0000000000000004e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.640152 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  34.67 
 
 
304 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3403  UspA domain protein  36.3 
 
 
301 aa  126  7e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1898  ferredoxin  52.94 
 
 
129 aa  125  1e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  36.21 
 
 
305 aa  123  8e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0452  heat shock protein DnaJ domain protein  42.97 
 
 
209 aa  122  1.9999999999999998e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  34.13 
 
 
287 aa  122  1.9999999999999998e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0431  ferredoxin  47.11 
 
 
214 aa  117  3e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  35.37 
 
 
286 aa  114  4.0000000000000004e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  32.66 
 
 
320 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3813  UspA domain protein  35.27 
 
 
283 aa  112  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  36.73 
 
 
280 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2107  UspA domain-containing protein  31.07 
 
 
291 aa  109  7.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  33.45 
 
 
283 aa  109  9.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3176  UspA domain protein  30.43 
 
 
291 aa  107  4e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1083  UspA domain-containing protein  27.33 
 
 
449 aa  101  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000280681  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0914  UspA domain-containing protein  30.98 
 
 
297 aa  96.7  6e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2887  UspA domain-containing protein  29.18 
 
 
325 aa  97.1  6e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535797  normal  0.92135 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3794  UspA domain protein  31.49 
 
 
301 aa  93.6  5e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00697323 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3776  UspA domain-containing protein  29.41 
 
 
297 aa  92.8  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226753  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3164  UspA domain protein  44.44 
 
 
156 aa  92.4  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1762  UspA domain-containing protein  30.16 
 
 
324 aa  92  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  40.3 
 
 
208 aa  92  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3798  UspA domain protein  32.42 
 
 
281 aa  91.7  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0912  UspA domain-containing protein  31.9 
 
 
317 aa  92  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0363039 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  40 
 
 
152 aa  90.5  4e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3405  UspA domain protein  42.76 
 
 
150 aa  90.5  5e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4350  UspA domain protein  31.38 
 
 
294 aa  90.5  6e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.252521  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  25.61 
 
 
276 aa  89.7  7e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4632  UspA domain protein  33.55 
 
 
309 aa  90.1  7e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2546  UspA domain protein  32.03 
 
 
390 aa  89.7  8e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3681  UspA domain protein  30.49 
 
 
301 aa  89.4  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6657  UspA domain protein  34.27 
 
 
311 aa  88.6  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  41.84 
 
 
144 aa  88.2  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2547  UspA domain protein  32.2 
 
 
306 aa  88.2  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  35.17 
 
 
145 aa  87.8  3e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1573  UspA domain protein  40.69 
 
 
149 aa  87.8  4e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0570  UspA domain protein  45 
 
 
141 aa  87  5e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.932953  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  38.06 
 
 
207 aa  87  6e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  38.26 
 
 
155 aa  86.3  9e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3774  UspA domain-containing protein  28.88 
 
 
317 aa  85.9  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.143188  normal  0.471237 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  38.75 
 
 
153 aa  85.9  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3418  UspA domain protein  43.7 
 
 
133 aa  84  0.000000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  36.62 
 
 
145 aa  84  0.000000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2564  UspA domain protein  27.12 
 
 
282 aa  84  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.143275  normal  0.0151057 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3238  universal stress protein  31.41 
 
 
297 aa  84  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0327  UspA domain protein  31.15 
 
 
305 aa  83.2  0.000000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.81164 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2567  UspA domain protein  31.13 
 
 
325 aa  82.4  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2298  UspA domain-containing protein  38.06 
 
 
164 aa  82.4  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178234  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2164  UspA domain protein  41.5 
 
 
154 aa  82.8  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0702  UspA domain protein  26.71 
 
 
282 aa  82.8  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2309  hypothetical protein  24.91 
 
 
295 aa  82  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  35.66 
 
 
145 aa  81.6  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  35.66 
 
 
145 aa  82  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  33.1 
 
 
147 aa  81.3  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  43.15 
 
 
159 aa  81.3  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  41.61 
 
 
156 aa  80.9  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  28.99 
 
 
314 aa  80.5  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0916  hypothetical protein  38.71 
 
 
173 aa  80.5  0.00000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  36.81 
 
 
149 aa  80.1  0.00000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  41.26 
 
 
158 aa  79.7  0.00000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  40.43 
 
 
152 aa  79.3  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  35.33 
 
 
156 aa  79.3  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12037  hypothetical protein  30.08 
 
 
295 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2059  UspA domain protein  34.93 
 
 
156 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3944  hitchhiker  0.00218931 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2569  UspA domain protein  30.72 
 
 
291 aa  78.6  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  34.97 
 
 
149 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  40.71 
 
 
138 aa  77.8  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  32.87 
 
 
148 aa  78.2  0.0000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3712  universal stress protein  26.47 
 
 
307 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1083  universal stress protein family  37.67 
 
 
145 aa  77.8  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0848  hypothetical protein  37.32 
 
 
142 aa  77.8  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957853  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2102  UspA domain protein  33.92 
 
 
289 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  36.71 
 
 
154 aa  77.8  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  41.89 
 
 
148 aa  78.2  0.0000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1307  UspA domain protein  42.86 
 
 
153 aa  77.8  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.476613  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1111  UspA domain-containing protein  34.44 
 
 
145 aa  77.4  0.0000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  34.48 
 
 
150 aa  77.4  0.0000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2614  universal stress protein  36.22 
 
 
280 aa  77.4  0.0000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.301606 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  25.35 
 
 
274 aa  77.4  0.0000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0288  UspA domain protein  29.7 
 
 
303 aa  77  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.48991 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0432  UspA domain protein  38.03 
 
 
144 aa  76.6  0.0000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2036  universal stress protein (Usp)  36.67 
 
 
155 aa  76.3  0.0000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0574  UspA domain protein  27.78 
 
 
303 aa  76.3  0.0000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  39.44 
 
 
180 aa  76.6  0.0000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  34.48 
 
 
150 aa  76.3  0.0000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0612  UspA domain-containing protein  23.96 
 
 
287 aa  75.9  0.000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>