More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0431 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0431  ferredoxin  100 
 
 
214 aa  436  1e-121  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1615  ferredoxin  53.46 
 
 
218 aa  226  2e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.640152 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0452  heat shock protein DnaJ domain protein  51.43 
 
 
209 aa  217  7.999999999999999e-56  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1737  ferredoxin  50.78 
 
 
129 aa  137  1e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0856  ferredoxin  47.66 
 
 
129 aa  128  7.000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2176  ferredoxin  50.77 
 
 
130 aa  126  2.0000000000000002e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.378228  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  47.11 
 
 
415 aa  117  9.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0099  ferredoxin  53.23 
 
 
129 aa  116  3e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1779  ferredoxin  50.78 
 
 
129 aa  112  3e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3256  serine/threonine protein kinase  41.45 
 
 
681 aa  110  1.0000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.400269  normal  0.0118767 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1898  ferredoxin  41.27 
 
 
129 aa  103  2e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0654  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  41.79 
 
 
351 aa  64.3  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2542  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  36.36 
 
 
344 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.261713  hitchhiker  0.0000462807 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2960  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  37.33 
 
 
413 aa  58.5  0.00000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4306  oxidoreductase FAD-binding subunit  37.68 
 
 
329 aa  58.5  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.264864  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1479  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  36.84 
 
 
356 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1223  oxidoreductase  38.89 
 
 
343 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.256584  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3728  ferredoxin  40.58 
 
 
356 aa  57.8  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.600358 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4509  ferredoxin (2Fe-2S)  38.1 
 
 
97 aa  57.4  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.567791  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3214  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  37.33 
 
 
408 aa  58.2  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2253  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  36.84 
 
 
356 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26490  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  38.67 
 
 
360 aa  57  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.365765  normal  0.166146 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7195  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  37.84 
 
 
358 aa  57  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.601931  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0651  ferredoxin  33.98 
 
 
353 aa  57  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0932  ferredoxin  36.84 
 
 
358 aa  57  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1577  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  36.84 
 
 
356 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4806  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  36.71 
 
 
358 aa  57  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.234643 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2263  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  36.84 
 
 
356 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.379907  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3155  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  44.29 
 
 
353 aa  57  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0757  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  35.21 
 
 
358 aa  56.2  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.123298  normal  0.178298 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0217  ferredoxin  33.8 
 
 
357 aa  56.6  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0184042 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05340  phenylacetate-CoA oxygenase, PaaK subunit  32.39 
 
 
357 aa  55.8  0.0000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.000116603  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0115  MOSC domain-containing protein  37.5 
 
 
366 aa  55.8  0.0000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.84635 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1242  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase PaaK subunit  38.57 
 
 
366 aa  55.5  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6456  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  57.69 
 
 
325 aa  55.5  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00677011 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0756  ferredoxin (2Fe-2S)  39.68 
 
 
99 aa  55.1  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2861  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  35.62 
 
 
362 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00257919 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4257  ferredoxin  31.94 
 
 
111 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.118014  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2581  ferredoxin (2Fe-2S)  38.57 
 
 
122 aa  55.1  0.0000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1882  ferredoxin (2Fe-2S)  40 
 
 
103 aa  54.3  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.185492  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3520  ferredoxin  40.54 
 
 
351 aa  54.7  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3822  ferredoxin  32.47 
 
 
105 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.654022  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3896  ferredoxin  32.47 
 
 
105 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.699938  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3808  ferredoxin  32.47 
 
 
105 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0641293  normal  0.164751 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2563  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  35.11 
 
 
345 aa  53.9  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4151  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  35.9 
 
 
358 aa  53.5  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.522682  normal  0.83112 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20190  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  40.3 
 
 
389 aa  53.9  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.864548  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4468  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  40.58 
 
 
369 aa  53.5  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.488012  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15381  ferredoxin  40.98 
 
 
99 aa  53.1  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.911769  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2130  ferredoxin  27.03 
 
 
361 aa  53.1  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.896649  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15531  ferredoxin  40.98 
 
 
99 aa  53.1  0.000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.443097  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1450  ferredoxin (2Fe-2S)  40.98 
 
 
99 aa  53.1  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.463453  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2886  putative phenylacetic acid degradation NADH oxidoreductase  34.62 
 
 
366 aa  53.5  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00113682  decreased coverage  0.000127414 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0882  ferredoxin (2Fe-2S)  38.1 
 
 
99 aa  53.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.869731  hitchhiker  0.00155176 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1903  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  35.71 
 
 
368 aa  53.1  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1195  heat shock protein DnaJ domain protein  40.85 
 
 
248 aa  53.1  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1089  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  43.28 
 
 
116 aa  52.8  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1017  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  43.28 
 
 
116 aa  52.8  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3666  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  34.25 
 
 
362 aa  52.4  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.100364  hitchhiker  0.000000384073 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0726  heat shock protein DnaJ domain protein  46.67 
 
 
259 aa  52.4  0.000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.221225  normal  0.743396 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3352  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  34.29 
 
 
358 aa  52.4  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1499  ferredoxin (2Fe-2S)  40.98 
 
 
99 aa  52.4  0.000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6688  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  36.76 
 
 
341 aa  52.4  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.211332  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4069  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  39.13 
 
 
369 aa  52.4  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.194384 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0291  phenylacetic acid degradation NADH oxidoreductase PaaE  34.25 
 
 
362 aa  52.4  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1546  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  36.99 
 
 
354 aa  52.4  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.729888  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3425  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  34.25 
 
 
362 aa  52.4  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0901107  normal  0.882381 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2391  ferredoxin  31.43 
 
 
109 aa  52  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.162374  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3533  phenylacetic acid degradation NADH oxidoreductase PaaE  36.49 
 
 
362 aa  52  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3840  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  36.49 
 
 
362 aa  52  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2577  phenylacetic acid degradation NADH oxidoreductase PaaE  36.49 
 
 
362 aa  52  0.000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.616553  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0011  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  36.49 
 
 
362 aa  52  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1980  phenylacetic acid degradation NADH oxidoreductase PaaE  36.49 
 
 
362 aa  52  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.144649  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3779  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  36.49 
 
 
362 aa  52  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0589683  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0902  ferredoxin, petF-like protein  35.71 
 
 
124 aa  52  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.180357  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3115  phenylacetic acid degradation NADH oxidoreductase PaaE  36.49 
 
 
362 aa  52  0.000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0136188  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0900  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  40.32 
 
 
389 aa  52  0.000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0181  (2Fe-2S) ferredoxin  37.7 
 
 
99 aa  52  0.000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0008  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  36.49 
 
 
362 aa  52  0.000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0203524  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0529  ferredoxin (2Fe-2S)  37.7 
 
 
99 aa  51.6  0.000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0163346  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2148  ferredoxin (2Fe-2S)  37.7 
 
 
99 aa  51.6  0.000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.943243  normal  0.214433 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1462  ferredoxin  35.14 
 
 
358 aa  52  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.611989  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2477  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  36.76 
 
 
367 aa  51.6  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03005  Phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  25.96 
 
 
349 aa  51.6  0.000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1782  heat shock protein DnaJ domain protein  46.88 
 
 
345 aa  51.6  0.000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14071  ferredoxin  37.7 
 
 
99 aa  51.2  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.116031  normal  0.0535794 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2883  heat shock protein DnaJ domain protein  49.06 
 
 
202 aa  51.2  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.936925 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3101  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  36.49 
 
 
362 aa  51.2  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0125326  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0228  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  32.88 
 
 
362 aa  51.6  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0180747  hitchhiker  0.0014836 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0687  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  35.71 
 
 
360 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.475559  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09801  ferredoxin, petF-like protein  37.5 
 
 
124 aa  51.6  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0916  ferredoxin (2Fe-2S)  40.98 
 
 
98 aa  51.2  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1772  ferredoxin (2Fe-2S)  36.51 
 
 
99 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1048  ferredoxin  27.63 
 
 
350 aa  50.4  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3739  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  32.35 
 
 
358 aa  50.4  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.184178  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2468  ferredoxin  27.54 
 
 
344 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0377  ferredoxin  34.43 
 
 
350 aa  50.1  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.88135 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5128  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  34.92 
 
 
351 aa  50.4  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.243235  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1828  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  34.29 
 
 
362 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.488384  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5309  ferredoxin  41.07 
 
 
356 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.185586 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>