More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4306 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_4306  oxidoreductase FAD-binding subunit  100 
 
 
329 aa  664    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.264864  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3712  ferredoxin  49.25 
 
 
339 aa  296  3e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.709133  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3785  ferredoxin  49.25 
 
 
339 aa  296  3e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.870039  normal  0.280135 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3725  ferredoxin  48.95 
 
 
339 aa  295  8e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2468  ferredoxin  47.35 
 
 
344 aa  291  8e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4186  ferredoxin  47.73 
 
 
346 aa  290  2e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2973  oxidoreductase FAD-binding subunit  47.08 
 
 
341 aa  274  1.0000000000000001e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3372  oxidoreductase FAD-binding subunit  46.18 
 
 
369 aa  267  2e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0543  ferredoxin  39.38 
 
 
339 aa  226  3e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00032188 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1546  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  38.22 
 
 
354 aa  225  9e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.729888  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2130  ferredoxin  34.27 
 
 
361 aa  218  1e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.896649  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3520  ferredoxin  40.24 
 
 
351 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4115  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  37.18 
 
 
345 aa  207  2e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271721  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2674  ferredoxin  36.04 
 
 
330 aa  201  9.999999999999999e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.333884  normal  0.0191308 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2882  oxidoreductase FAD-binding subunit  36.09 
 
 
341 aa  201  9.999999999999999e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.07552  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3447  ferredoxin  36.47 
 
 
340 aa  194  2e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13604  hemoglobine-related protein hmp  35.99 
 
 
358 aa  191  2e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.714491  normal  0.806459 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0320  ferredoxin  37.23 
 
 
348 aa  190  2.9999999999999997e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1416  ferredoxin  34.1 
 
 
353 aa  187  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.15311  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5309  ferredoxin  34.72 
 
 
356 aa  187  2e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.185586 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1462  ferredoxin  33.72 
 
 
358 aa  186  7e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.611989  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0319  ferredoxin  36.07 
 
 
346 aa  185  7e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.220078  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0329  ferredoxin  36.07 
 
 
346 aa  185  7e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.106229 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1564  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  31.98 
 
 
348 aa  182  5.0000000000000004e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.517649 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5095  ferredoxin  36.01 
 
 
350 aa  182  6e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.276207 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3782  ferredoxin  33.92 
 
 
352 aa  182  7e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00690243  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4710  ferredoxin  36.01 
 
 
350 aa  182  8.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.748194  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4796  ferredoxin  36.01 
 
 
350 aa  182  8.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0310  oxidoreductase FAD-binding subunit  35.56 
 
 
339 aa  181  1e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4806  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  35.67 
 
 
358 aa  181  1e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.234643 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0228  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  36.13 
 
 
362 aa  181  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0180747  hitchhiker  0.0014836 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0245  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  36.13 
 
 
362 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0254  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  36.13 
 
 
362 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0292434  normal  0.0307686 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3851  ferredoxin  35.75 
 
 
360 aa  179  4.999999999999999e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3425  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  35.57 
 
 
362 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0901107  normal  0.882381 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2780  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  35.57 
 
 
362 aa  178  9e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0478602  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0326  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  35.57 
 
 
362 aa  178  9e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2861  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  35.29 
 
 
362 aa  178  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00257919 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0900  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  33.62 
 
 
389 aa  178  1e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4151  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  34.83 
 
 
358 aa  178  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.522682  normal  0.83112 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0306  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  35.57 
 
 
362 aa  176  3e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.144813  hitchhiker  0.000507312 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3101  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  36.13 
 
 
362 aa  177  3e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0125326  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18640  flavodoxin reductase family protein  36.71 
 
 
355 aa  177  3e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0011  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  36.69 
 
 
362 aa  176  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3840  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  36.69 
 
 
362 aa  176  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3779  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  36.69 
 
 
362 aa  176  5e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0589683  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1828  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  35.21 
 
 
362 aa  176  6e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.488384  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2612  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  34.75 
 
 
362 aa  175  8e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2577  phenylacetic acid degradation NADH oxidoreductase PaaE  36.41 
 
 
362 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.616553  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0008  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  36.41 
 
 
362 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0203524  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1980  phenylacetic acid degradation NADH oxidoreductase PaaE  36.41 
 
 
362 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.144649  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3533  phenylacetic acid degradation NADH oxidoreductase PaaE  36.41 
 
 
362 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3115  phenylacetic acid degradation NADH oxidoreductase PaaE  36.41 
 
 
362 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0136188  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3517  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  35.67 
 
 
346 aa  174  1.9999999999999998e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.611569  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4880  ferredoxin  34.62 
 
 
350 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.30814 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0291  phenylacetic acid degradation NADH oxidoreductase PaaE  35.57 
 
 
362 aa  172  9e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0757  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  34.6 
 
 
358 aa  171  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.123298  normal  0.178298 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4285  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  36.24 
 
 
362 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.481656  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3666  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  35.29 
 
 
362 aa  170  3e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.100364  hitchhiker  0.000000384073 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0991  putative ring-hydroxylation complex protein 4  35.76 
 
 
361 aa  170  3e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.153237  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2520  ferredoxin  36.97 
 
 
366 aa  169  4e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2893  ferredoxin  32.44 
 
 
347 aa  169  5e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.200106  normal  0.439628 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0651  ferredoxin  33.62 
 
 
353 aa  168  9e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0687  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  33.98 
 
 
360 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.475559  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2869  putative phenylacetic acid degradation NADH oxidoreductase paaE  34.73 
 
 
337 aa  167  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.423535  normal  0.236927 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1577  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  32.95 
 
 
356 aa  166  5e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1502  ferredoxin  33.43 
 
 
365 aa  166  5e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2253  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  33.33 
 
 
356 aa  166  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0381  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  32.78 
 
 
365 aa  165  8e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.155408  hitchhiker  0.00902786 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2263  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  32.95 
 
 
356 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.379907  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1479  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  32.95 
 
 
356 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0654  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  32.48 
 
 
351 aa  165  1.0000000000000001e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2477  ferredoxin  35.29 
 
 
379 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.949989 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03005  Phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  31.12 
 
 
349 aa  164  2.0000000000000002e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3637  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  34.06 
 
 
365 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.206041 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2665  oxidoreductase FAD-binding subunit  33.14 
 
 
396 aa  162  5.0000000000000005e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.202569  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4002  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  34.6 
 
 
381 aa  162  6e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.924171  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0932  ferredoxin  31.74 
 
 
358 aa  162  7e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5188  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  32.11 
 
 
356 aa  161  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.726966  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3569  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  34.6 
 
 
362 aa  162  1e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4030  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  31.47 
 
 
365 aa  160  3e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4563  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  36.01 
 
 
364 aa  160  3e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.659135 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3491  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  36.01 
 
 
364 aa  160  3e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.168778 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3352  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  31.59 
 
 
358 aa  158  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0836  putative ferredoxin, 2Fe-2S  32.34 
 
 
380 aa  158  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3949  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  34.64 
 
 
361 aa  157  2e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.413475 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0479  putative ferredoxin, 2Fe-2S  31.85 
 
 
381 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2116  iron-sulfur cluster-binding protein  32.14 
 
 
381 aa  158  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.994866  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0998  putative ferredoxin, 2Fe-2S  31.85 
 
 
380 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0388253  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0702  putative ferredoxin, 2Fe-2S  31.85 
 
 
380 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.54952  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1971  putative ferredoxin, 2Fe-2S  31.85 
 
 
380 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.851205  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26490  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  36.29 
 
 
360 aa  157  2e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.365765  normal  0.166146 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0748  putative ferredoxin, 2Fe-2S  32.14 
 
 
380 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3723  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  31.8 
 
 
358 aa  157  3e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.571859 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3728  ferredoxin  31.56 
 
 
356 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.600358 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4814  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  32.24 
 
 
386 aa  155  8e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.501777  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0814  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  34.63 
 
 
365 aa  155  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.382172  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05340  phenylacetate-CoA oxygenase, PaaK subunit  29.38 
 
 
357 aa  155  1e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.000116603  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3747  oxidoreductase FAD-binding subunit  33.91 
 
 
375 aa  154  2e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.225631 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1231  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  33.23 
 
 
364 aa  153  2.9999999999999998e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>