More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0902 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_0902  ferredoxin, petF-like protein  100 
 
 
124 aa  257  3e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.180357  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09631  ferredoxin, petF-like protein  91.94 
 
 
124 aa  240  6e-63  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09611  ferredoxin, petF-like protein  91.94 
 
 
124 aa  239  9e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.511459  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09801  ferredoxin, petF-like protein  79.84 
 
 
124 aa  213  5e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0554  ferredoxin (2Fe-2S)  55.17 
 
 
122 aa  142  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.569886  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0537  ferredoxin (2Fe-2S)  55.17 
 
 
122 aa  142  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0981  ferredoxin (2Fe-2S)  53.33 
 
 
122 aa  141  3e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000166855  normal  0.987662 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0512  ferredoxin (2Fe-2S)  54.17 
 
 
122 aa  140  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3903  ferredoxin (2Fe-2S)  53.85 
 
 
121 aa  139  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.832402  normal  0.566054 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1400  ferredoxin  53.28 
 
 
122 aa  138  3e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.385733  normal  0.502771 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0890  (2Fe-2S) ferredoxin  51.67 
 
 
122 aa  137  3.9999999999999997e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00054006  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1087  ferredoxin  53.23 
 
 
125 aa  135  1e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0754  ferredoxin (2Fe-2S)  51.67 
 
 
122 aa  136  1e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2581  ferredoxin (2Fe-2S)  49.18 
 
 
122 aa  132  1.9999999999999998e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09201  ferredoxin  48.76 
 
 
121 aa  129  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.354651  hitchhiker  0.00000103216 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29191  ferredoxin, PetF like protein  46.28 
 
 
121 aa  127  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0228  ferredoxin, PetF like protein  49.22 
 
 
128 aa  122  1e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.11908  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08951  ferredoxin, PetF like protein  49.22 
 
 
128 aa  122  1e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.104451  hitchhiker  0.000234569 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_9385  predicted protein  51.92 
 
 
105 aa  106  1e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0568  ferredoxin (2Fe-2S)  49.06 
 
 
104 aa  99.4  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0229344  normal  0.149468 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4458  ferredoxin (2Fe-2S)  44.86 
 
 
107 aa  97.1  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4724  (2Fe-2S) ferredoxin  47.17 
 
 
106 aa  97.1  8e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0491  ferredoxin (2Fe-2S)  43.14 
 
 
113 aa  93.2  1e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.963567  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3794  ferredoxin (2Fe-2S)  44.34 
 
 
105 aa  90.9  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.511657 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2185  ferredoxin (2Fe-2S)  41.12 
 
 
109 aa  90.5  6e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.558504 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2779  ferredoxin (2Fe-2S)  42.45 
 
 
105 aa  88.6  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0338  ferredoxin (2Fe-2S)  48.24 
 
 
105 aa  89.4  2e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.154262  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3322  ferredoxin (2Fe-2S)  42.45 
 
 
105 aa  88.6  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.466379 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4539  ferredoxin (2Fe-2S)  44.95 
 
 
111 aa  84.7  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.250574 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0756  ferredoxin (2Fe-2S)  41.24 
 
 
99 aa  80.9  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1542  ferredoxin (2Fe-2S)  41.18 
 
 
108 aa  78.2  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.847794  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0181  (2Fe-2S) ferredoxin  41.24 
 
 
99 aa  75.9  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1772  ferredoxin (2Fe-2S)  42.27 
 
 
99 aa  74.7  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16511  ferredoxin  42.35 
 
 
108 aa  73.9  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16391  ferredoxin  42.35 
 
 
108 aa  73.9  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.342589  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1060  ferredoxin (2Fe-2S)  39.22 
 
 
102 aa  73.9  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000352883 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0882  ferredoxin (2Fe-2S)  39.18 
 
 
99 aa  73.6  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.869731  hitchhiker  0.00155176 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1499  ferredoxin (2Fe-2S)  38.14 
 
 
99 aa  72.8  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0999  ferredoxin (2Fe-2S)  37 
 
 
98 aa  72.4  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0221545  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0916  ferredoxin (2Fe-2S)  39.58 
 
 
98 aa  70.9  0.000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14071  ferredoxin  36.08 
 
 
99 aa  70.5  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.116031  normal  0.0535794 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15131  ferredoxin  35.05 
 
 
99 aa  68.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0914  ferredoxin (2Fe-2S)  38.78 
 
 
96 aa  68.6  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15531  ferredoxin  35.05 
 
 
99 aa  68.6  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.443097  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15381  ferredoxin  35.05 
 
 
99 aa  68.6  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.911769  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0529  ferredoxin (2Fe-2S)  36.08 
 
 
99 aa  68.6  0.00000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0163346  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2148  ferredoxin (2Fe-2S)  36.08 
 
 
99 aa  68.6  0.00000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.943243  normal  0.214433 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1450  ferredoxin (2Fe-2S)  35.05 
 
 
99 aa  68.6  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.463453  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0915  ferredoxin (2Fe-2S)  39.8 
 
 
100 aa  68.2  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1205  ferredoxin (2Fe-2S)  37.11 
 
 
99 aa  67.8  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1234  ferredoxin (2Fe-2S)  37.11 
 
 
99 aa  67.4  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.128018  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1882  ferredoxin (2Fe-2S)  36.46 
 
 
103 aa  65.5  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.185492  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05261  ferredoxin  34.02 
 
 
99 aa  65.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1824  ferredoxin (2Fe-2S)  43.06 
 
 
104 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1796  ferredoxin (2Fe-2S)  43.06 
 
 
104 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1088  ferredoxin (2Fe-2S)  35.51 
 
 
106 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.835463 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37765  predicted protein  35.71 
 
 
123 aa  65.1  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.699954  normal  0.0237321 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0596  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  34.82 
 
 
343 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.491585  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2515  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  38.04 
 
 
343 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5822  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  38.04 
 
 
343 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.92832  normal  0.0803192 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2408  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  38.04 
 
 
343 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.233033 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1580  ferredoxin (2Fe-2S)  39.47 
 
 
88 aa  63.2  0.000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.66831  normal  0.0183824 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1879  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  38.04 
 
 
343 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2537  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  38.04 
 
 
343 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.753859  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2490  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  38.04 
 
 
343 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0805  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  38.04 
 
 
343 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0829  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  36.27 
 
 
343 aa  62  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0404  oxidoreductase, NAD/FAD/2Fe-2S iron-sulfur cluster binding protein  42.25 
 
 
373 aa  61.6  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363299  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4002  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  44.12 
 
 
381 aa  62  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.924171  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3397  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  44.12 
 
 
375 aa  62  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1059  ferredoxin (2Fe-2S)  34.58 
 
 
106 aa  61.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2477  ferredoxin  42.65 
 
 
379 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.949989 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3747  oxidoreductase FAD-binding subunit  42.65 
 
 
375 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.225631 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3138  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  35.29 
 
 
343 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4042  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  42.65 
 
 
375 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.186376 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0435  ferredoxin  34.41 
 
 
89 aa  61.2  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0025  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  37.23 
 
 
340 aa  60.5  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.775073  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1615  ferredoxin  37.84 
 
 
218 aa  60.5  0.000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.640152 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4509  ferredoxin (2Fe-2S)  39.47 
 
 
97 aa  60.1  0.000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.567791  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3554  oxidoreductase FAD-binding subunit  33.7 
 
 
382 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1194  ferredoxin  35.62 
 
 
101 aa  60.1  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1966  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  34.78 
 
 
343 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0683406  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0947  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  34.78 
 
 
343 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.438279  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0270  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  34.78 
 
 
343 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0393986  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1151  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  34.78 
 
 
343 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0655371  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1490  ferredoxin (2Fe-2S)  36 
 
 
94 aa  58.9  0.00000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.404225  normal  0.317474 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1860  iron-sulfur cluster-binding protein  40 
 
 
379 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0792  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  34.78 
 
 
343 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2634  hypothetical protein  38.81 
 
 
616 aa  59.3  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.982432 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0990  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  34.78 
 
 
343 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155808  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0997  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  34.78 
 
 
343 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.296007  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0878  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  34.78 
 
 
343 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000381375  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0315  hypothetical protein  40.54 
 
 
662 aa  58.5  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1577  putative ferredoxin oxidoreductase protein  43.55 
 
 
418 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5071  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  40.62 
 
 
414 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407916  hitchhiker  0.00354835 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0836  putative ferredoxin, 2Fe-2S  38.46 
 
 
380 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2116  iron-sulfur cluster-binding protein  38.46 
 
 
381 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.994866  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0748  putative ferredoxin, 2Fe-2S  38.46 
 
 
380 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2281  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  40 
 
 
335 aa  58.2  0.00000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5208  oxidoreductase FAD-binding subunit  33.78 
 
 
382 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>